UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1math-6C16C4.115e-168chrII 1,884,167C. elegans MATH-6 protein; contains similarity to Pfam domain PF00917 MATH domain contains similarity to Interpro domains IPR008974 (TRAF-like), IPR002083 (MATH)
2T26E4.5T26E4.5n/achrV 15,787,827contains similarity to Interpro domain IPR008996 ()
3C36C5.4C36C5.4n/achrV 3,167,003contains similarity to Pfam domain PF01579 Domain of unknown function DUF19 contains similarity to Interpro domains IPR016638 (Uncharacterised conserved protein UPF0376), IPR002542 (Protein of unknown function DUF19)
4F55C5.6F55C5.6n/achrV 12,280,460contains similarity to Pfam domain PF01593 Flavin containing amine oxidoreductase contains similarity to Interpro domains IPR000759 (Adrenodoxin reductase), IPR002937 (Amine oxidase), IPR016040 (NAD(P)-binding)
5R11D1.4R11D1.4n/achrV 12,713,623contains similarity to Xenopus laevis Similar to kinesin-like 1.; TR:Q8AVK8
6flp-27C25H3.5n/achrII 5,681,799C. elegans FLP-27 protein ;
7sre-51C50E10.10n/achrII 12,312,675C. elegans SRE-51 protein; contains similarity to Pfam domain PF03125 C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR004151 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor)
8nhr-174E03H4.6n/achrI 12,418,082C. elegans NHR-174 protein; contains similarity to Pfam domain PF00096 Zinc finger, C2H2 type contains similarity to Interpro domains IPR015880 (Zinc finger, C2H2-like), IPR007087 (Zinc finger, C2H2-type)
9C44C10.6C44C10.6n/achrX 11,698,664contains similarity to Streptococcus pneumoniae GtrA family protein.; TR:Q97R28
10asna-2F47G3.2n/achrX 2,383,478C. elegans ASNA-2 protein; contains similarity to Pfam domain PF02374 Anion-transporting ATPase contains similarity to Interpro domain IPR003348 (Anion-transporting ATPase)
11Y116A8C.11Y116A8C.11n/achrIV 16,989,256contains similarity to Streptococcus pyogenes serotype M5 M protein, serotype 5 precursor.; SW:P02977
12Y56A3A.18Y56A3A.18n/achrIII 11,918,159Y56A3A.18 encodes an ortholog of S. cerevisiae BUD20 that may suppress tumorous growth in the germline; like PRO-1, -2, and -3, Y56A3A.18 is thought to be required for ribosome biogenesis, suggesting a link between biogenesis in the distal sheath and control of cell division in the germline.
13lips-8F31F6.7n/achrX 14,899,559C. elegans LIPS-8 protein; contains similarity to Pfam domain PF01674 Lipase (class 2) contains similarity to Interpro domain IPR002918 (Lipase, class 2)
14ZK795.1ZK795.1n/achrIV 12,551,089contains similarity to Pfam domain PF03770 Inositol polyphosphate kinase contains similarity to Interpro domain IPR005522 (Inositol polyphosphate kinase)
15Y37A1B.8Y37A1B.8n/achrIV 14,022,381contains similarity to Pfam domain PF01030 Receptor L domain contains similarity to Interpro domain IPR000494 (EGF receptor, L domain)
16fbxb-6F07E5.1n/achrII 2,066,717This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins.
17W06G6.7W06G6.7n/achrV 16,640,273contains similarity to Pfam domains PF00622 (SPRY domain) , PF00041 (Fibronectin type III domain) , PF00097 (Zinc finger, C3HC4 type (RING finger)) , PF00643 (B-box zinc finger) contains similarity to Interpro domains IPR001841 (Zinc finger, RING-type), IPR008957 (Fibronectin, type III-like fold), IPR001870 (B302, (SPRY)-like), IPR003961 (Fibronectin, type III), IPR013083 (Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type), IPR003649 (B-box, C-terminal), IPR003877 (SPla/RYanodine receptor SPRY), IPR000315 (Zinc finger, B-box)
18C17H1.5C17H1.5n/achrI 13,115,023contains similarity to Mus musculus Inner centromere protein.; SW:Q9WU62
19Y17G7B.13Y17G7B.13n/achrII 12,045,368contains similarity to Pfam domain PF06090 Domain of unknown function (DUF941) contains similarity to Interpro domain IPR009286 (Protein of unknown function DUF941)
20srsx-2F20E11.2n/achrV 17,437,669C. elegans SRSX-2 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
21fbxb-99Y8A9A.5n/achrII 3,792,968This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins.
22F46E10.3F46E10.3n/achrV 6,519,002contains similarity to Pfam domain PF07735 F-box associated contains similarity to Interpro domain IPR012885 (F-box associated type 2)
23rap-2C25D7.7n/achrV 15,062,961rap-2 encodes a Ras-related GTPase that is most similar to the RAP2 members of the Ras GTPase superfamily; by homology, RAP-2 is predicted to function as a membrane-localized GTPase that likely plays a role in signal transduction; as animals homozygous for a rap-2 deletion mutation show no obvious abnormalities, the precise role of RAP-2 in C. elegans development and/or behavior is not yet known.
24F26F2.2F26F2.2n/achrV 20,559,052contains similarity to Saccharomyces cerevisiae Global transcription activator that acts in complex with Snf2p, Snf5p, Snf6p, and Swi3p to assist gene-specific activators; involved in the regulation of expression of many genes, including ADH1, ADH2, GAL1, HO, INO1 and SUC2; SGD:YPL016W
25ZK1240.4ZK1240.4n/achrII 2,315,354
26K12H6.2K12H6.2n/achrII 2,814,250
27sre-4T13F2.5n/achrIV 9,782,834C. elegans SRE-4 protein; contains similarity to Pfam domain PF03125 C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR004151 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor)
28srw-35T08G3.10n/achrV 16,472,391C. elegans SRW-35 protein; contains similarity to Pfam domain PF06976 Protein of unknown function (DUF1300) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR010726 (Protein of unknown function DUF1300), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
29F58D12.1F58D12.1n/achrV 14,052,371contains similarity to White spot syndrome virus Wsv359 (WSSV418).; TR:Q8VAP2
30srbc-15F15E11.10n/achrV 2,346,927C. elegans SRBC-15 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
31F21D12.2F21D12.2n/achrII 7,318,858
32srh-139F57E7.3n/achrV 16,484,653C. elegans SRH-139 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
33W09C3.3W09C3.3n/achrI 4,708,334contains similarity to Pfam domain PF01482 Domain of unknown function DUF13 contains similarity to Interpro domain IPR002485 (Protein of unknown function DUF13)
34R02D5.6R02D5.6n/achrV 14,513,495contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
35srh-203F20E11.10n/achrV 17,455,364C. elegans SRH-203 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
36srv-36F57G8.8n/achrV 16,324,110C. elegans SRV-36 protein ;
37F59C12.3F59C12.3n/achrX 16,606,372contains similarity to Interpro domain IPR009114 (Angiomotin)
38T22D1.6T22D1.6n/achrIV 6,899,771
39C01B7.3C01B7.3n/achrV 8,783,769
40ZK1073.1ZK1073.1n/achrX 16,126,525contains similarity to Pfam domain PF03096 Ndr family contains similarity to Interpro domain IPR004142 (Ndr)
41str-44C42D4.4n/achrIV 7,177,788C. elegans STR-44 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
42C43H6.6C43H6.6n/achrX 2,397,074contains similarity to Pfam domains PF00059 (Lectin C-type domain) , PF00431 (CUB domain) contains similarity to Interpro domains IPR000859 (CUB), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
43T08G5.8T08G5.8n/achrV 14,048,191contains similarity to Pfam domain PF00635 MSP (Major sperm protein) domain contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000535 (Major sperm protein)
44F47B10.4F47B10.4n/achrX 10,891,428contains similarity to Cyanophage P60 Thioredoxin C3.; TR:Q8W710
45C30G12.3C30G12.3n/achrII 7,275,917
46str-220C42D4.9n/achrIV 7,170,609str-220 encodes a seven transmembrane chemoreceptor; microarray analyses indicate that str-220 is expressed at higher levels in the AWB olfactory neurons than the AFD thermosensory neurons; anatomical expression studies confirm expression in the AWB neurons; expression of str-220 in AWB is regulated, in part, by the KIN-29 Ser/Thr kinase.
47T20D4.16T20D4.16n/achrV 3,394,536
48F27C1.13F27C1.13n/achrI 5,445,369contains similarity to Pfam domain PF03607 Doublecortin contains similarity to Interpro domain IPR003533 (Doublecortin)
49srh-49C10G11.4n/achrI 6,298,750C. elegans SRH-49 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
50dhs-27C04F6.5n/achrX 3,415,914dhs-27 encodes a short-chain dehydrogenase predicted to be mitochondrial.