UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1C16B8.2C16B8.20chrX 3,963,843
2srd-7C06G8.4n/achrIV 10,785,932C. elegans SRD-7 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
3F16D3.4F16D3.4n/achrI 8,366,932F16D3.4 encodes a putative beta-tubulin folding cofactor D, orthologous to human TBCD (OMIM:604649); in early embryos, F16D3.4 is required for normally rapid microtubule elongation; F16D3.4 may be a ligand and effector of the ARL2 ortholog EVL-20; F16D3.4 is expressed in larval and adult pharynx, intestine, and neurons; in mass RNAi assays, F16D3.4 is required for normal mitotic spindle elongation, embryonic and larval viability, fertility, locomotion, body shape, vulval development, and cuticular integrity.
4gro-1ZC395.6n/achrIII 5,266,087C. elegans GRO-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF01715 IPP transferase contains similarity to Interpro domains IPR003604 (Zinc finger, U1-type), IPR002627 (tRNA isopentenyltransferase), IPR003593 (AAA+ ATPase, core), IPR011593 (Isopentenyl transferase-like), IPR007087 (Zinc finger, C2H2-type)
5ugt-41F10D2.11n/achrV 7,162,312C. elegans UGT-41 protein; contains similarity to Pfam domain PF00201 UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase contains similarity to Interpro domain IPR002213 (UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase)
6F25H9.1F25H9.1n/achrV 13,454,521contains similarity to Interpro domain IPR016054 (Ly-6 antigen / uPA receptor -like)
7W08D2.5W08D2.5n/achrIV 9,821,001contains similarity to Pfam domains PF00122 (E1-E2 ATPase) , PF00702 (haloacid dehalogenase-like hydrolase) contains similarity to Interpro domains IPR008250 (E1-E2 ATPase-associated region), IPR006544 (P-type ATPase of unknown pump specificity (type V)), IPR001757 (ATPase, P-type, K/Mg/Cd/Cu/Zn/Na/Ca/Na/H-transporter), IPR000150 (Cof protein), IPR005834 (Haloacid dehalogenase-like hydrolase)
8R10E8.2R10E8.2n/achrV 18,254,063contains similarity to Pfam domain PF01827 FTH domain contains similarity to Interpro domain IPR002900 (Protein of unknown function DUF38, Caenorhabditis species)
9ndx-9F13H10.2n/achrIV 11,010,995The ndx-9 gene encodes a member of the NADH pyrophosphatase subfamily of the NUDIX hydrolases.
10pqn-29F10F2.9n/achrIII 4,645,137The protein product of this gene is predicted to contain a glutamine/asparagine (Q/N)-rich ('prion') domain, by the algorithm of Michelitsch and Weissman (as of the WS77 release of WormBase, i.e., in wormpep77).
11B0285.6B0285.6n/achrIII 4,354,080B0285.6 encodes a predicted sodium-coupled carboxylate transporter that is one of four C. elegans proteins related to Drosophila Indy and the mammalian NaDC1 and NaDC3 transporters; B0285.6::lacZ reporter fusions are expressed in the excretory cell, from early larval stages through adulthood, with some later expression occasionally seen in two large unidentified structures on the dorsal side of the pharyngeal terminal bulb.
12F28C1.1F28C1.1n/achrV 12,452,041contains similarity to Drosophila melanogaster Flybase gene name is CG6695-PA;; FLYBASE:CG6695
13nfyc-1F23F1.1n/achrII 44,432C. elegans NFYC-1 protein; contains similarity to Pfam domains PF00808 (Histone-like transcription factor (CBF/NF-Y) and archaeal histone) , PF00125 (Core histone H2A/H2B/H3/H4) contains similarity to Interpro domains IPR009072 (Histone-fold), IPR007125 (Histone core), IPR003958 (Transcription factor CBF/NF-Y/archaeal histone)
14str-193C50C10.6n/achrV 9,821,161C. elegans STR-193 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
15F17A9.4F17A9.4n/achrV 6,109,818contains similarity to Pfam domain PF00724 NADH:flavin oxidoreductase / NADH oxidase family contains similarity to Interpro domains IPR013785 (Aldolase-type TIM barrel), IPR001155 (NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase, N-terminal), IPR002343 (Paraneoplastic encephalomyelitis antigen)
16R11E3.2R11E3.2n/achrIV 4,773,617contains similarity to Pfam domain PF00860 Permease family contains similarity to Interpro domain IPR006043 (Xanthine/uracil/vitamin C permease)
17Y11D7A.8Y11D7A.8n/achrIV 9,252,608contains similarity to Pfam domains PF02958 (Domain of unknown function (DUF227)) , PF07914 (Protein of unknown function (DUF1679)) contains similarity to Interpro domains IPR011009 (Protein kinase-like), IPR012877 (Protein of unknown function DUF1679, Caenorhabditis species), IPR004119 (Protein of unknown function DUF227), IPR015897 (CHK kinase-like)
18T22F3.7T22F3.7n/achrV 3,599,159contains similarity to Pfam domain PF07690 Major Facilitator Superfamily contains similarity to Interpro domains IPR007114 (Major facilitator superfamily), IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
19Y17G7B.4Y17G7B.4n/achrII 11,995,419contains similarity to Pfam domain PF01916 Deoxyhypusine synthase contains similarity to Interpro domain IPR002773 (Deoxyhypusine synthase)
20ZK1098.4ZK1098.4n/achrIII 9,543,651contains similarity to Pfam domain PF01008 Initiation factor 2 subunit family contains similarity to Interpro domain IPR000649 (Initiation factor 2B related)
21W03B1.2W03B1.2n/achrIV 4,329,360contains similarity to Interpro domains IPR002229 (Blood group Rhesus C/E and D polypeptide), IPR000769 (Regulatory protein Rop)
22T11F9.1T11F9.1n/achrV 11,460,688contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
23R09A8.1R09A8.1n/achrX 12,615,226contains similarity to Homo sapiens FLASH; ENSEMBL:ENSP00000237177
24fbxb-39M01D1.7n/achrII 1,040,136This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; its encoded protein also contains a Pfam-B45 motif of presently unknown function.
25F17A2.3F17A2.3n/achrX 12,308,161contains similarity to Pfam domain PF00628 PHD-finger contains similarity to Interpro domains IPR001965 (Zinc finger, PHD-type), IPR013083 (Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type), IPR011011 (Zinc finger, FYVE/PHD-type)
26F23F12.8F23F12.8n/achrIII 6,485,986F23F12.8 encodes a large (980-residue) protein, predicted to be secreted, with two chitin-binding peritrophin-A domains, separated by a low-complexity region; F23F12.8 is synthesized in larval and adult pharynx, a known site of chitin deposition; like CEJ-1 and CPG-2 in embryos, F23F12.8 might participate in chitin synthesis, and its peritrophin-A domains might enable mechanical cross-linking of chitin.
27T15H9.2T15H9.2n/achrII 9,616,485contains similarity to Homo sapiens Putative uncharacterized protein DKFZp686J1372; ENSEMBL:ENSP00000341653
28F55C12.6F55C12.6n/achrII 5,875,271contains similarity to Pfam domain PF06852 Protein of unknown function (DUF1248) contains similarity to Interpro domain IPR009658 (Protein of unknown function DUF1248)
29F43C1.1F43C1.1n/achrIII 4,213,606contains similarity to Pfam domains PF00481 (Protein phosphatase 2C) , PF00560 (Leucine Rich Repeat) (11)contains similarity to Interpro domains IPR001932 (Protein phosphatase 2C-related), IPR001611 (Leucine-rich repeat), IPR000694 (Proline-rich region), IPR003591 (Leucine-rich repeat, typical subtype), IPR014045 (Protein phosphatase 2C, N-terminal)
30wts-1T20F10.1n/achrI 10,294,898C. elegans WTS-1 protein; contains similarity to Pfam domains PF00069 (Protein kinase domain) , PF00433 (Protein kinase C terminal domain) contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR000694 (Proline-rich region), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related), IPR000961 (Protein kinase, C-terminal)
31T09B9.5T09B9.5n/achrX 9,778,986contains similarity to Streptococcus pneumoniae Hypothetical protein.; TR:P96479
32bli-5F45G2.5n/achrIII 13,428,598bli-5 encodes a protease inhibitor that affects the integrity of the cuticle and the development of the bursa in the adult male.
33math-30F52C6.5n/achrII 1,908,950C. elegans MATH-30 protein; contains similarity to Pfam domain PF00917 MATH domain contains similarity to Interpro domains IPR008974 (TRAF-like), IPR002083 (MATH)
34M01B2.8M01B2.8n/achrV 15,260,488contains similarity to Pfam domain PF03380 Caenorhabditis protein of unknown function, DUF282 contains similarity to Interpro domain IPR005044 (Protein of unknown function DUF282, Caenorhabditis species)
35cah-5R173.1n/achrX 7,021,932cah-5 encodes a member of the carbonic anhydrase family.
36nhr-264F14A5.1n/achrIV 9,293,087C. elegans NHR-264 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
37C50E3.5C50E3.5n/achrV 7,591,348contains similarity to Interpro domain IPR008108 (Type III secretion system outer membrane, B protein)
38T10B5.2T10B5.2n/achrV 1,849,449
39T15D6.4T15D6.4n/achrI 12,375,417contains similarity to Aedes aegypti N-acetyllactosaminide beta-1,3-n-acetylglucosaminyltransferase.; TR:Q175J5
40C14E2.1C14E2.1n/achrX 1,826,905
41srw-32K03D7.11n/achrV 17,509,470C. elegans SRW-32 protein; contains similarity to Pfam domain PF06976 Protein of unknown function (DUF1300) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR010726 (Protein of unknown function DUF1300)
42C34F6.5C34F6.5n/achrX 11,208,547contains similarity to Homo sapiens Histone acetyltransferase MORF beta; ENSEMBL:ENSP00000287239
43srbc-76M01B2.4n/achrV 15,252,812C. elegans SRBC-76 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
44C05B5.5C05B5.5n/achrIII 10,002,152This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins.
45E03H12.9E03H12.9n/achrIV 4,990,834contains similarity to Pfam domain PF08277 PAN-like domain contains similarity to Interpro domain IPR006583 (CW)
46F30A10.6F30A10.6n/achrI 9,490,547contains similarity to Pfam domain PF02383 SacI homology domain contains similarity to Interpro domain IPR002013 (Synaptojanin, N-terminal)
47cup-4C02C2.3n/achrIII 7,867,528The primary phenotype of cup-4 animals is an accumulation of secreted GFP in the pseudocoelom, suggesting a decrease in, or the absence of, endocytosis in coelomocytes.
48F52H2.5F52H2.5n/achrX 2,558,768
49clec-21T07H3.4n/achrII 1,583,563C. elegans CLEC-21 protein; contains similarity to Pfam domains PF00431 (CUB domain) , PF00059 (Lectin C-type domain) (2)contains similarity to Interpro domains IPR000859 (CUB), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
50pkc-1F57F5.5n/achrV 12,019,252pkc-1 encodes a serine/threonine protein kinase that is orthologous to mammalian protein kinase C epsilon (PRKCE), a member of the nPKC subgroup of the protein kinase C superfamily; together with UNC-13, PKC-1 may act downstream of goa-1 to modulate phorbol ester-induced stimulation of acetylcholine release at NMJs; PKC-1 positively regulates locomotion, and affects thermotaxis and chemotaxis together with kin-11; PKC-1 is required for regulating several behaviors including sensation of volatile and soluble compounds, osmolarity, and temperature (thermosensation); PKC-1 is also required for phorbolester-induced stimulation of acetylcholine release at neuromuscular junctions; PKC-1 localizes to the processes and cell bodies of approximately 75 sensory neurons and interneurons, and pkc-1 mRNA is detectable at varying levels during larval and adult stages.