UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1C15H9.2C15H9.24e-155chrX 6,119,566contains similarity to Pfam domain PF00651 BTB/POZ domain contains similarity to Interpro domains IPR000210 (BTB/POZ-like), IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR013069 (BTB/POZ)
2fbxa-41F52D2.1n/achrX 1,949,939This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
3nhr-174E03H4.6n/achrI 12,418,082C. elegans NHR-174 protein; contains similarity to Pfam domain PF00096 Zinc finger, C2H2 type contains similarity to Interpro domains IPR015880 (Zinc finger, C2H2-like), IPR007087 (Zinc finger, C2H2-type)
4T08G5.8T08G5.8n/achrV 14,048,191contains similarity to Pfam domain PF00635 MSP (Major sperm protein) domain contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000535 (Major sperm protein)
5srsx-39M01B2.9n/achrV 15,255,926C. elegans SRSX-39 protein; contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
6sre-44W07G1.2n/achrII 13,950,633C. elegans SRE-44 protein; contains similarity to Pfam domain PF03125 C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR004151 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor)
7hil-1C30G7.1n/achrV 14,951,239C. elegans HIL-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF00538 linker histone H1 and H5 family contains similarity to Interpro domains IPR011991 (Winged helix repressor DNA-binding), IPR005819 (Histone H5), IPR005818 (Histone H1/H5), IPR003216 (Linker histone, N-terminal)
8T23D5.8T23D5.8n/achrV 15,747,913contains similarity to Interpro domain IPR000168 (Nematode 7TM chemoreceptor (probably olfactory))
9nhr-187F47C10.4n/achrV 3,861,996C. elegans NHR-187 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
10gcy-2R134.2n/achrII 9,509,771gcy-2 encodes a predicted transmembrane guanylyl cyclase; as loss of gcy-2 activity via RNA-mediated interference does not result in any abnormalities, the precise role of GCY-2 in C. elegans development and/or behavior is not yet known; by sequence similarity, however, GCY-2 can be predicted to function in chemosensory signal transduction.
11F29A7.8F29A7.8n/achrII 2,757,825contains similarity to Pfam domain PF08277 PAN-like domain contains similarity to Interpro domain IPR006583 (CW)
12R10A10.1R10A10.1n/achrI 6,418,689
13srh-109T19C9.4n/achrV 17,219,817C. elegans SRH-109 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
14Y26D4A.5Y26D4A.5n/achrI 13,076,809contains similarity to Staphylococcus aureus Hypothetical protein SAV2385 (Hypothetical protein MW2305).; TR:Q99RP4
15C17H1.6C17H1.6n/achrI 13,131,624contains similarity to Danio rerio Arginine and glutamate-rich protein 1-B.; SW:Q6P5L7
16M01H9.2M01H9.2n/achrIV 4,461,106contains similarity to Pfam domain PF01549 ShK domain-like contains similarity to Interpro domains IPR002350 (Proteinase inhibitor I1, Kazal), IPR001368 (TNFR/CD27/30/40/95 cysteine-rich region), IPR003582 (Metridin-like ShK toxin)
17F45E12.6F45E12.6n/achrII 7,313,979
18Y37A1B.9Y37A1B.9n/achrIV 14,018,009contains similarity to Pfam domain PF01030 Receptor L domain contains similarity to Interpro domain IPR000494 (EGF receptor, L domain)
19C45E5.2C45E5.2n/achrIV 5,742,716contains similarity to Pfam domain PF00704 Glycosyl hydrolases family 18 contains similarity to Interpro domains IPR011583 (Chitinase II), IPR017853 (Glycoside hydrolase, catalytic core), IPR001223 (Glycoside hydrolase, family 18, catalytic domain), IPR013781 (Glycoside hydrolase, subgroup, catalytic core)
20srh-32Y26G10.2n/achrV 17,702,215C. elegans SRH-32 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
21C14E2.6C14E2.6n/achrX 1,828,107contains similarity to Pfam domain PF01764 Lipase (class 3) contains similarity to Interpro domain IPR002921 (Lipase, class 3)
22F35E2.1F35E2.1n/achrI 11,739,734contains similarity to Pfam domain PF06681 Protein of unknown function (DUF1182) contains similarity to Interpro domains IPR002091 (Aromatic amino acid permease), IPR010601 (Protein of unknown function DUF1182)
23F46F5.14F46F5.14n/achrII 800,774contains similarity to Pfam domain PF03314 Protein of unknown function, DUF273 contains similarity to Interpro domain IPR004988 (Protein of unknown function DUF273)
24F41H8.2F41H8.2n/achrV 827,588contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
25C34D1.1C34D1.1n/achrV 13,224,279contains similarity to Pfam domain PF00751 (DM DNA binding domain)
26F52E10.2F52E10.2n/achrX 16,282,921contains similarity to Borrelia burgdorferi EppA.; TR:Q840B4
27B0310.3B0310.3n/achrX 512,692
28uvt-3C42D8.3n/achrX 5,090,152C. elegans UVT-3 protein; contains similarity to Pfam domain PF03630 Fumble contains similarity to Interpro domains IPR002791 (Protein of unknown function DUF89), IPR015844 (Pantothenate kinase, acetyl-CoA regulated, two-domain type), IPR011602 (Fumble)
29srsx-17F58D7.1n/achrV 5,929,015C. elegans SRSX-17 protein; contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
30F54G2.2F54G2.2n/achrX 2,636,226contains similarity to Pfam domain PF00098 Zinc knuckle contains similarity to Interpro domains IPR009007 (Peptidase aspartic, catalytic), IPR001969 (Peptidase aspartic, active site), IPR001878 (Zinc finger, CCHC-type)
31srbc-79B0250.6n/achrV 20,487,016C. elegans SRBC-79 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
32col-52D1007.2n/achrI 4,572,052C. elegans COL-52 protein; contains similarity to Pfam domain PF01391 Collagen triple helix repeat (20 copies) contains similarity to Interpro domains IPR008161 (Collagen helix repeat), IPR008160 (Collagen triple helix repeat)
33T05B9.2T05B9.2n/achrII 11,257,607contains similarity to Rattus norvegicus Fibrillin-2.; TR:Q9WUH9
34C10E2.2C10E2.2n/achrX 16,746,897This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins.
35W06G6.7W06G6.7n/achrV 16,640,273contains similarity to Pfam domains PF00622 (SPRY domain) , PF00041 (Fibronectin type III domain) , PF00097 (Zinc finger, C3HC4 type (RING finger)) , PF00643 (B-box zinc finger) contains similarity to Interpro domains IPR001841 (Zinc finger, RING-type), IPR008957 (Fibronectin, type III-like fold), IPR001870 (B302, (SPRY)-like), IPR003961 (Fibronectin, type III), IPR013083 (Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type), IPR003649 (B-box, C-terminal), IPR003877 (SPla/RYanodine receptor SPRY), IPR000315 (Zinc finger, B-box)
36F16G10.8F16G10.8n/achrII 2,382,692contains similarity to Pfam domain PF02343 Domain of unknown function DUF130 contains similarity to Interpro domain IPR003326 (Protein of unknown function DUF130)
37F19B10.5F19B10.5n/achrII 3,656,709
38Y66A7A.7Y66A7A.7n/achrIII 11,629,581contains similarity to Lactobacillus plantarum Hypothetical protein.; TR:Q88VI8
39sodh-2K12G11.4n/achrV 11,890,433C. elegans SODH-2 protein; contains similarity to Pfam domains PF00107 (Zinc-binding dehydrogenase) , PF08240 (Alcohol dehydrogenase GroES-like domain) contains similarity to Interpro domains IPR013149 (Alcohol dehydrogenase, zinc-binding), IPR011032 (GroES-like), IPR013154 (Alcohol dehydrogenase GroES-like), IPR002085 (Alcohol dehydrogenase superfamily, zinc-containing), IPR016040 (NAD(P)-binding), IPR002328 (Alcohol dehydrogenase, zinc-containing, conserved site)
40F35G8.1F35G8.1n/achrX 9,317,241contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR005395 (Neuropeptide FF receptor), IPR000611 (Neuropeptide Y receptor), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
41C17C3.9C17C3.9n/achrII 5,531,799
42K02E11.6K02E11.6n/achrV 14,251,141contains similarity to Interpro domain IPR002213 (UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase)
43F53A9.5F53A9.5n/achrX 8,699,785contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
44C03C10.7C03C10.7n/achrIII 4,096,446contains similarity to Saccharomyces cerevisiae Profilin synthetic lethal protein, has region of coiled-coil structure; subunit of the Exocyst complex--the Exocyst complex contains the gene products encoded by SEC3, SEC5, SEC6, SEC8, SEC10, SEC15 and EXO70 and is required for exocytosis; SGD:YER008C
45sri-15F15H9.2n/achrI 12,152,667C. elegans SRI-15 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
46srxa-7C31A11.6n/achrV 16,308,625C. elegans SRXA-7 protein; contains similarity to Pfam domain PF03383 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein, class xa contains similarity to Interpro domain IPR005047 (Protein of unknown function DUF286, G protein-coupled receptor-like putative Caenorhabditis species)
47M01G12.10M01G12.10n/achrI 12,119,338contains similarity to Homo sapiens Hypothetical protein KIAA0477; ENSEMBL:ENSP00000316434
48srh-102F40D4.11n/achrV 17,164,173C. elegans SRH-102 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
49T24H10.4T24H10.4n/achrII 9,110,325contains similarity to Pfam domain PF05705 Eukaryotic protein of unknown function (DUF829) contains similarity to Interpro domain IPR008547 (Protein of unknown function DUF829, eukaryotic)
50nas-10K09C8.3n/achrX 10,962,779nas-10 encodes an astacin-like metalloprotease.