UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1C14E2.6C14E2.62e-116chrX 1,828,107contains similarity to Pfam domain PF01764 Lipase (class 3) contains similarity to Interpro domain IPR002921 (Lipase, class 3)
2F46F5.14F46F5.14n/achrII 800,774contains similarity to Pfam domain PF03314 Protein of unknown function, DUF273 contains similarity to Interpro domain IPR004988 (Protein of unknown function DUF273)
3K02E11.6K02E11.6n/achrV 14,251,141contains similarity to Interpro domain IPR002213 (UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase)
4F52E1.3F52E1.3n/achrV 8,395,551
5clec-244T27C5.7n/achrV 17,414,115C. elegans CLEC-244 protein; contains similarity to Pfam domain PF00059 Lectin C-type domain contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
6R119.2R119.2n/achrI 370,004contains similarity to Pfam domain PF00557 metallopeptidase family M24 contains similarity to Interpro domains IPR000994 (Peptidase M24, catalytic core), IPR001714 (Peptidase M24, methionine aminopeptidase)
7T23D5.8T23D5.8n/achrV 15,747,913contains similarity to Interpro domain IPR000168 (Nematode 7TM chemoreceptor (probably olfactory))
8Y62H9A.14Y62H9A.14n/achrX 11,922,107contains similarity to Interpro domain IPR009010 (Aspartate decarboxylase-like fold)
9uvt-3C42D8.3n/achrX 5,090,152C. elegans UVT-3 protein; contains similarity to Pfam domain PF03630 Fumble contains similarity to Interpro domains IPR002791 (Protein of unknown function DUF89), IPR015844 (Pantothenate kinase, acetyl-CoA regulated, two-domain type), IPR011602 (Fumble)
10T08G5.8T08G5.8n/achrV 14,048,191contains similarity to Pfam domain PF00635 MSP (Major sperm protein) domain contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000535 (Major sperm protein)
11hil-1C30G7.1n/achrV 14,951,239C. elegans HIL-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF00538 linker histone H1 and H5 family contains similarity to Interpro domains IPR011991 (Winged helix repressor DNA-binding), IPR005819 (Histone H5), IPR005818 (Histone H1/H5), IPR003216 (Linker histone, N-terminal)
12F20E11.5F20E11.5n/achrV 17,461,590contains similarity to Pfam domain PF03436 Domain of unknown function (DUF281) contains similarity to Interpro domain IPR005098 (Protein of unknown function DUF281)
13C15H9.2C15H9.2n/achrX 6,119,566contains similarity to Pfam domain PF00651 BTB/POZ domain contains similarity to Interpro domains IPR000210 (BTB/POZ-like), IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR013069 (BTB/POZ)
14M01G12.10M01G12.10n/achrI 12,119,338contains similarity to Homo sapiens Hypothetical protein KIAA0477; ENSEMBL:ENSP00000316434
15F19B10.5F19B10.5n/achrII 3,656,709
16K07G5.3K07G5.3n/achrI 7,163,733contains similarity to Pfam domain PF00168 C2 domain contains similarity to Interpro domains IPR008973 (C2 calcium/lipid-binding region, CaLB), IPR000008 (C2 calcium-dependent membrane targeting)
17T21B6.4T21B6.4n/achrX 10,934,829contains similarity to Interpro domain IPR003006 (Immunoglobulin/major histocompatibility complex, conserved site)
18srg-41T19C4.3n/achrV 11,161,148C. elegans SRG-41 protein; contains similarity to Interpro domains IPR000500 (Connexins), IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
19F09F9.1F09F9.1n/achrX 4,116,127contains similarity to Dirofilaria immitis Cuticular antigen.; TR:Q965D8
20T24H10.4T24H10.4n/achrII 9,110,325contains similarity to Pfam domain PF05705 Eukaryotic protein of unknown function (DUF829) contains similarity to Interpro domain IPR008547 (Protein of unknown function DUF829, eukaryotic)
21glt-4T22E5.2n/achrX 6,405,125glt-4 encodes an ortholog of glutamate/aspartate and neutral amino acid transporters.
22C08B11.3C08B11.3n/achrII 8,025,126contains similarity to Pfam domain PF01388 ARID/BRIGHT DNA binding domain contains similarity to Interpro domains IPR015880 (Zinc finger, C2H2-like), IPR016024 (Armadillo-type fold), IPR007087 (Zinc finger, C2H2-type), IPR001606 (AT-rich interaction region)
23C54C8.5C54C8.5n/achrI 12,454,277contains similarity to Pfam domain PF03360 Glycosyltransferase family 43 contains similarity to Interpro domain IPR005027 (Glycosyl transferase, family 43)
24scl-21Y43F8B.5n/achrV 19,495,187C. elegans SCL-21 protein; contains similarity to Pfam domain PF00188 SCP-like extracellular protein contains similarity to Interpro domains IPR014044 (SCP-like extracellular), IPR001283 (Allergen V5/Tpx-1 related)
25fbxa-41F52D2.1n/achrX 1,949,939This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
26Y62H9A.3Y62H9A.3n/achrX 11,879,462contains similarity to Interpro domains IPR000694 (Proline-rich region), IPR000480 (Glutelin)
27srsx-39M01B2.9n/achrV 15,255,926C. elegans SRSX-39 protein; contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
28clec-214C50E3.1n/achrV 7,611,567C. elegans CLEC-214 protein; contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like)
29R155.4R155.4n/achrIII 1,978,876contains similarity to Pfam domain PF02206 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domains IPR008967 (p53-like transcription factor, DNA-binding), IPR003125 (Protein of unknown function WSN), IPR005427 (Salmonella/Shigella invasin protein C)
30srxa-7C31A11.6n/achrV 16,308,625C. elegans SRXA-7 protein; contains similarity to Pfam domain PF03383 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein, class xa contains similarity to Interpro domain IPR005047 (Protein of unknown function DUF286, G protein-coupled receptor-like putative Caenorhabditis species)
31F21D9.8F21D9.8n/achrV 19,279,623contains similarity to Medicago truncatula Pectin methyl-esterase PER precursor (EC 3.1.1.11).; TR:Q9SC90
32T15B7.7T15B7.7n/achrV 6,824,981contains similarity to Pfam domain PF03385 Protein of unknown function, DUF288 contains similarity to Interpro domain IPR005049 (Protein of unknown function DUF288)
33T28A11.17T28A11.17n/achrV 3,264,867T28A11.17 encodes a neprilysin; neprilysins are thermolysin-like zinc metallopeptidases, found on the outer surface of animal cells, that negatively regulate small signalling peptides (e.g., enkephalin, tachykinin, insulin, and natriuretic peptides) by cleaving them; T28A11.17 has no clear orthologs in other organisms.
34R03H10.2R03H10.2n/achrII 4,161,532
35nas-10K09C8.3n/achrX 10,962,779nas-10 encodes an astacin-like metalloprotease.
36W06G6.7W06G6.7n/achrV 16,640,273contains similarity to Pfam domains PF00622 (SPRY domain) , PF00041 (Fibronectin type III domain) , PF00097 (Zinc finger, C3HC4 type (RING finger)) , PF00643 (B-box zinc finger) contains similarity to Interpro domains IPR001841 (Zinc finger, RING-type), IPR008957 (Fibronectin, type III-like fold), IPR001870 (B302, (SPRY)-like), IPR003961 (Fibronectin, type III), IPR013083 (Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type), IPR003649 (B-box, C-terminal), IPR003877 (SPla/RYanodine receptor SPRY), IPR000315 (Zinc finger, B-box)
37srxa-14Y44A6B.1n/achrV 20,635,709C. elegans SRXA-14 protein; contains similarity to Pfam domain PF03383 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein, class xa contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR005047 (Protein of unknown function DUF286, G protein-coupled receptor-like putative Caenorhabditis species)
38C04B4.6C04B4.6n/achrX 12,275,348contains similarity to Corynebacterium efficiens Putative alanyl-tRNA synthetase.; TR:Q8FT23
39srg-32T21C9.7n/achrV 10,587,952C. elegans SRG-32 protein; contains similarity to Interpro domain IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
40srh-109T19C9.4n/achrV 17,219,817C. elegans SRH-109 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
41F58G11.4F58G11.4n/achrV 13,674,239contains similarity to Pfam domain PF07690 Major Facilitator Superfamily contains similarity to Interpro domains IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
42vps-33.1B0303.9n/achrIII 8,702,024C. elegans VPS-33.1 protein; contains similarity to Pfam domain PF00995 Sec1 family contains similarity to Interpro domain IPR001619 (Sec1-like protein)
43C46E10.9C46E10.9n/achrII 3,728,602contains similarity to Pfam domain PF00096 Zinc finger, C2H2 type contains similarity to Interpro domains IPR015880 (Zinc finger, C2H2-like), IPR007086 (Zinc finger, C2H2-subtype), IPR013087 (Zinc finger, C2H2-type/integrase, DNA-binding), IPR003656 (Zinc finger, BED-type predicted), IPR007087 (Zinc finger, C2H2-type)
44hlh-10ZK682.4n/achrV 9,281,043C. elegans HLH-10 protein; contains similarity to Pfam domain PF00010 Helix-loop-helix DNA-binding domain contains similarity to Interpro domains IPR001092 (Basic helix-loop-helix dimerisation region bHLH), IPR011598 (Helix-loop-helix DNA-binding)
45C04A11.2C04A11.2n/achrX 13,667,311contains similarity to Homo sapiens Putative protein TPRXL; ENSEMBL:ENSP00000322097
46F38E9.4F38E9.4n/achrX 16,452,168
47nhr-187F47C10.4n/achrV 3,861,996C. elegans NHR-187 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
48nhr-174E03H4.6n/achrI 12,418,082C. elegans NHR-174 protein; contains similarity to Pfam domain PF00096 Zinc finger, C2H2 type contains similarity to Interpro domains IPR015880 (Zinc finger, C2H2-like), IPR007087 (Zinc finger, C2H2-type)
49Y54G9A.1Y54G9A.1n/achrII 13,700,041contains similarity to Carabus linnei NADH dehydrogenase subunit 5 (Fragment).; TR:O79584
50F18H3.1F18H3.1n/achrX 13,520,521contains similarity to Pfam domain PF00622 SPRY domain contains similarity to Interpro domains IPR001870 (B302, (SPRY)-like), IPR003877 (SPla/RYanodine receptor SPRY)