UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1C14E2.5C14E2.51.0000000000000001e-69chrX 1,824,473
2C15C6.3C15C6.3n/achrI 12,209,642contains similarity to Interpro domains IPR006077 (Vinculin/alpha-catenin), IPR000694 (Proline-rich region)
3B0379.2B0379.2n/achrI 10,071,342contains similarity to Saccharomyces cerevisiae Possible role for UBP3 in controlling the activity or assembly of the SIR protein complex.; SGD:YER151C
4D1065.1D1065.1n/achrV 4,075,636contains similarity to Pfam domain PF03189 Protein of unknown function, DUF270 contains similarity to Interpro domain IPR004878 (Protein of unknown function DUF270)
5srj-21F28H7.11n/achrV 10,745,530C. elegans SRJ-21 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
6ZK721.3ZK721.3n/achrX 8,785,606
7srw-69F18E3.5n/achrV 7,428,134C. elegans SRW-69 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
8ZC376.6ZC376.6n/achrV 14,188,934contains similarity to Interpro domain IPR001028 (Glycoprotein phospholipase D)
9W08F4.1W08F4.1n/achrII 593,688
10cyp-14A3K09A11.4n/achrX 13,272,959C. elegans CYP-14A3 protein; contains similarity to Pfam domain PF00067 Cytochrome P450 contains similarity to Interpro domains IPR001128 (Cytochrome P450), IPR002401 (Cytochrome P450, E-class, group I), IPR002403 (Cytochrome P450, E-class, group IV), IPR002397 (Cytochrome P450, B-class)
11srt-61T27C10.1n/achrI 10,905,441C. elegans SRT-61 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
12T16G12.4T16G12.4n/achrIII 10,058,154contains similarity to Treponema denticola FlhB.; TR:Q9APY7
13math-14C16C4.4n/achrII 1,870,071C. elegans MATH-14 protein; contains similarity to Pfam domain PF00917 MATH domain contains similarity to Interpro domains IPR008974 (TRAF-like), IPR002083 (MATH), IPR001712 (Type III secretion system FHIPEP)
14F28F8.7F28F8.7n/achrV 15,579,943contains similarity to Pfam domain PF01448 ELM2 domain contains similarity to Interpro domain IPR000949 (ELM2)
15K07C11.10K07C11.10n/achrV 8,226,436contains similarity to Homo sapiens hypothetical protein isoform 1; ENSEMBL:ENSP00000381337
16acr-9C40C9.2n/achrX 13,644,544acr-9 encodes a predicted member of the alpha subunit family of nicotinic acetylcholine receptors.
17F46F5.14F46F5.14n/achrII 800,774contains similarity to Pfam domain PF03314 Protein of unknown function, DUF273 contains similarity to Interpro domain IPR004988 (Protein of unknown function DUF273)
18unc-40T19B4.7n/achrI 5,685,676The unc-40 gene encodes a netrin receptor that is required to guide dorsal-ventral cell and axon migrations, and is required for correct polarization and migration of the neuroblasts QL and QR.
19F48G7.4F48G7.4n/achrV 620,860
20srh-165C41G6.9n/achrV 15,220,637C. elegans SRH-165 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
21nhr-262F09C6.8n/achrV 16,906,069C. elegans NHR-262 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
22str-141F47G9.2n/achrV 11,323,048C. elegans STR-141 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
23srg-22Y25C1A.10n/achrII 3,092,472C. elegans SRG-22 protein; contains similarity to Pfam domain PF02118 C.elegans Srg family integral membrane protein contains similarity to Interpro domain IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
24str-205C02E7.9n/achrV 4,929,096C. elegans STR-205 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
25str-55F26D2.7n/achrV 16,416,377C. elegans STR-55 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
26T27A10.5T27A10.5n/achrX 3,573,294
27fbxa-149Y38H6C.10n/achrV 20,512,556This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins.
28srg-2C18F10.5n/achrIII 6,259,346srg-2 encodes a predicted seven transmembrane domain G protein-coupled chemosensory receptor; an SRG-2::GFP fusion protein is expressed exclusively in the cilia of ASK sensory neurons, which are believed to be involved in chemotaxis to lysine and sensory regulation of egg laying; localization of SRG-2 to ASK cilia does not appear to depend upon wild-type activity of either odr-4 or odr-8.
29T26E4.1T26E4.1n/achrV 15,780,361contains similarity to Pfam domain PF01030 (Receptor L domain)
30C46E10.9C46E10.9n/achrII 3,728,602contains similarity to Pfam domain PF00096 Zinc finger, C2H2 type contains similarity to Interpro domains IPR015880 (Zinc finger, C2H2-like), IPR007086 (Zinc finger, C2H2-subtype), IPR013087 (Zinc finger, C2H2-type/integrase, DNA-binding), IPR003656 (Zinc finger, BED-type predicted), IPR007087 (Zinc finger, C2H2-type)
31F58F6.3F58F6.3n/achrIV 1,375,965
32F52D2.6F52D2.6n/achrX 1,977,920
33fbxa-157C06H5.2n/achrV 17,900,819This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
34srab-13F59A7.3n/achrV 2,026,295C. elegans SRAB-13 protein ;
35str-246W09D6.3n/achrIII 11,078,457C. elegans STR-246 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
36ZK1037.1ZK1037.1n/achrV 15,311,784contains similarity to Pfam domain PF01030 Receptor L domain contains similarity to Interpro domain IPR000494 (EGF receptor, L domain)
37srx-7C14C6.1n/achrV 561,828C. elegans SRX-7 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domains IPR002651 (Protein of unknown function DUF32), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
38srh-97F49H6.4n/achrV 17,018,412C. elegans SRH-97 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
39xnp-1B0041.7n/achrI 4,668,742xnp-1 encodes an ATP-dependent DNA helicase of the SNF2 family that is orthologous to human XNP/ATR-X, which is associated with a number of X-linked mental retardation syndromes; in C. elegans, xnp-1 activity is required at high temperatures for embryogenesis, somatic gonad development, fertility, and vulval morphogenesis; in addition, animals doubly mutant for xnp-1 and lin-35/Rb, hpl-2/HP1, or nucleosome remodelling and histone deacetylase (NuRD) complex members such as lin-53 and let-418, display larval arrest with growth cessation but continued cell proliferation; xnp-1 is also required, with lin-35/Rb and hpl-2/HP1, for proper regulation of transgene expression; xnp-1 mRNA, detectable in embryos and the germline by in situ hybridization, is expressed at highest levels in embryos with decreasing levels seen in successive larval stages; xnp-1 transcriptional reporter fusions exhibit strong expression beginning at mid-embryogenesis but fading by embryonic morphogenesis; at hatching, expression is observed in all dividing cells including the P lineage, and at later larval stages expression is observed in the vulval precursor cells.
40srx-93F59B1.3n/achrV 3,620,070C. elegans SRX-93 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR002651 (Protein of unknown function DUF32), IPR001411 (Tetracycline resistance protein, TetB)
41srt-13ZC142.1n/achrV 4,249,044C. elegans SRT-13 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domains IPR002651 (Protein of unknown function DUF32), IPR000539 (Frizzled protein)
42str-229C17E7.11n/achrV 3,901,512C. elegans STR-229 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
43srh-247C31B8.13n/achrV 2,933,658C. elegans SRH-247 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
44Y47D3B.4Y47D3B.4n/achrIII 11,407,290contains similarity to Pfam domain PF01697 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domain IPR008166 (Protein of unknown function DUF23)
45Y48E1B.7Y48E1B.7n/achrII 13,580,236Y48E1B.7 encodes a C2H2-type zinc-finger protein required for embryonic development and fertility; Y48E1B.7 transcript levels are diminished by ERI-1, RDE-3, and RRF-2, perhaps through endogenous RNAi; Y48E1B.7 is paralogous to MCD-1, but has no obvious non-nematode orthologs; Y48E1B.7 contains a single central zinc-finger and a C-terminal low-complexity region, but no other recognizable protein domains.
46srj-40F38H12.2n/achrV 4,102,865C. elegans SRJ-40 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
47srv-19H04M03.6n/achrIV 5,873,058C. elegans SRV-19 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
48C33H5.1C33H5.1n/achrIV 7,809,904contains similarity to Pfam domain PF01482 Domain of unknown function DUF13 contains similarity to Interpro domain IPR002485 (Protein of unknown function DUF13)
49Y116A8C.13Y116A8C.13n/achrIV 16,956,392contains similarity to Pfam domains PF00271 (Helicase conserved C-terminal domain) , PF00176 (SNF2 family N-terminal domain) contains similarity to Interpro domains IPR000330 (SNF2-related), IPR001395 (Aldo/keto reductase), IPR014021 (Helicase, superfamily 1 and 2, ATP-binding), IPR014001 (DEAD-like helicase, N-terminal), IPR001650 (DNA/RNA helicase, C-terminal)
50clec-165F38A1.10n/achrIV 1,246,135C. elegans CLEC-165 protein; contains similarity to Pfam domain PF00059 Lectin C-type domain contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR001680 (WD40 repeat), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)