UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1C14C6.8C14C6.80chrV 552,129contains similarity to Pfam domain PF01697 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domain IPR008166 (Protein of unknown function DUF23)
2T26E4.5T26E4.5n/achrV 15,787,827contains similarity to Interpro domain IPR008996 ()
3cyp-33C4F44C8.1n/achrV 2,237,058C. elegans CYP-33C4 protein; contains similarity to Pfam domain PF00067 Cytochrome P450 contains similarity to Interpro domains IPR001128 (Cytochrome P450), IPR002401 (Cytochrome P450, E-class, group I), IPR002403 (Cytochrome P450, E-class, group IV), IPR002397 (Cytochrome P450, B-class)
4F46H5.5F46H5.5n/achrX 7,256,401
5his-11ZK131.5n/achrII 13,821,955his-11 encodes an H2B histone; by homology, HIS-11 is predicted to function as a nucleosome component required for packaging of DNA into chromatin; his-11 is a replication-dependent histone locus that resides in the HIS3 cluster on chromosome II.
6H39E20.1H39E20.1n/achrX 1,396,448
7F36G9.12F36G9.12n/achrV 15,980,154contains similarity to Pfam domain PF01757 Acyltransferase family contains similarity to Interpro domains IPR002656 (Acyltransferase 3), IPR001356 (Homeobox), IPR006621 (Nose resistant to fluoxetine-4, N-terminal)
8R13D11.1R13D11.1n/achrV 818,109
9C03A7.12C03A7.12n/achrV 5,179,902contains similarity to Pfam domain PF00201 UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase contains similarity to Interpro domain IPR002213 (UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase)
10srw-2T03D3.3n/achrV 2,831,793C. elegans SRW-2 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
11fbxb-5F45C12.14n/achrII 1,721,873This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; its encoded protein also contains a Pfam-B45 motif of presently unknown function.
12sri-1F36G9.8n/achrV 15,966,916C. elegans SRI-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR002208 (SecY protein)
13Y52B11B.1Y52B11B.1n/achrI 11,123,920contains similarity to Lactococcus lactis FhuD-like protein.; TR:Q8VU74
14fbxb-7Y20C6A.2n/achrV 17,378,293C. elegans FBXB-7 protein; contains similarity to Pfam domains PF07735 (F-box associated) , PF00646 (F-box domain) contains similarity to Interpro domains IPR001810 (Cyclin-like F-box), IPR012885 (F-box associated type 2)
15Y106G6E.4Y106G6E.4n/achrI 10,222,213contains similarity to Pfam domain PF01812 5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase family contains similarity to Interpro domain IPR002698 (5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase)
16T15D6.8T15D6.8n/achrI 12,390,358contains similarity to Pfam domain PF01482 Domain of unknown function DUF13 contains similarity to Interpro domain IPR002485 (Protein of unknown function DUF13)
17T10B10.3T10B10.3n/achrX 15,179,981contains similarity to Pfam domain PF00169 PH domain contains similarity to Interpro domains IPR001849 (Pleckstrin-like), IPR011993 (Pleckstrin homology-type), IPR004012 (RUN)
18Y62H9A.2Y62H9A.2n/achrX 11,877,730contains similarity to Homo sapiens Angiomotin; ENSEMBL:ENSP00000305557
19F59A7.8F59A7.8n/achrV 2,010,108contains similarity to Pfam domains PF00271 (Helicase conserved C-terminal domain) , PF00176 (SNF2 family N-terminal domain) contains similarity to Interpro domains IPR000330 (SNF2-related), IPR014021 (Helicase, superfamily 1 and 2, ATP-binding), IPR014001 (DEAD-like helicase, N-terminal), IPR001650 (DNA/RNA helicase, C-terminal)
20R13.3R13.3n/achrIV 10,830,875contains similarity to Pfam domain PF01062 Bestrophin contains similarity to Interpro domain IPR000615 (Bestrophin)
21T22C1.11T22C1.11n/achrI 7,967,828contains similarity to Oryctolagus cuniculus Trichohyalin.; SW:P37709
22his-15ZK131.9n/achrII 13,818,464his-15 encodes an H2B histone.
23F35E2.9F35E2.9n/achrI 11,724,844contains similarity to Pfam domain PF03761 Domain of unknown function (DUF316) contains similarity to Interpro domains IPR005514 (Protein of unknown function DUF316), IPR009003 (Peptidase, trypsin-like serine and cysteine)
24ZC84.6ZC84.6n/achrIII 9,196,038contains similarity to Pfam domains PF01683 (EB module) (3), PF00014 (Kunitz/Bovine pancreatic trypsin inhibitor domain) (5)contains similarity to Interpro domains IPR002223 (Proteinase inhibitor I2, Kunitz metazoa), IPR006150 (Cysteine-rich repeat), IPR006149 (Nematode-specific EB region)
25C31H5.1C31H5.1n/achrI 9,028,536contains similarity to Pfam domain PF06342 Alpha/beta hydrolase of unknown function (DUF1057) contains similarity to Interpro domains IPR008262 (Lipase, active site), IPR010463 (Protein of unknown function DUF1057, lipase putative)
26W04A4.5W04A4.5n/achrI 13,669,210contains similarity to Pfam domain PF02985 HEAT repeat contains similarity to Interpro domains IPR011989 (Armadillo-like helical), IPR000357 (HEAT), IPR016024 (Armadillo-type fold)
27emb-5T04A8.14n/achrIII 4,717,943emb-5 encodes the C. elegans ortholog of the Spt6 family of RNA polymerase II transcription elongation factors; first identified in screens for temperature-sensitive embryonic lethal mutations, emb-5 is required for the correct timing of the second E (endoderm)-cell division in the early embryo and thus, for normal embryonic gastrulation; in addition, emb-5 activity is required postembryonically for proper gonad development; in yeast two-hybrid studies, EMB-5 interacts with the intracellular domains of LIN-12 and GLP-1, suggesting that EMB-5 functions as a positive downstream effector in Notch-like signaling pathways during C. elegans development; emb-5 mRNA is most abundant during embryonic stages, with lower levels apparent during the L1-L3 larval stages, and even lower levels observed during L4.
28C41G6.6C41G6.6n/achrV 15,222,374contains similarity to Pfam domain PF01030 Receptor L domain contains similarity to Interpro domain IPR000494 (EGF receptor, L domain)
29sra-37T21H8.2n/achrX 13,892,086C. elegans SRA-37 protein; contains similarity to Pfam domain PF02117 C.elegans Sra family integral membrane protein contains similarity to Interpro domain IPR000344 (Nematode chemoreceptor, Sra)
30F47B8.5F47B8.5n/achrV 14,326,311contains similarity to Pfam domain PF01482 Domain of unknown function DUF13 contains similarity to Interpro domains IPR002485 (Protein of unknown function DUF13), IPR000694 (Proline-rich region), IPR000976 (Wilm's tumour protein), IPR003071 (Orphan nuclear receptor, HMR type)
31F57C7.4F57C7.4n/achrX 10,585,230contains similarity to Interpro domain IPR008972 ()
32ZC373.3ZC373.3n/achrX 10,061,060contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
33K03H1.11K03H1.11n/achrIII 9,951,334contains similarity to Pfam domain PF00646 (F-box domain)
34F46G11.2F46G11.2n/achrX 5,789,196
35T28F2.7T28F2.7n/achrI 3,658,340contains similarity to Pfam domain PF00858 Amiloride-sensitive sodium channel contains similarity to Interpro domains IPR003945 (NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5), IPR001873 (Na+ channel, amiloride-sensitive)
36his-10ZK131.4n/achrII 13,823,128his-10 encodes an H4 histone.
37gly-16T15D6.2n/achrI 12,380,173gly-16 encodes a protein similar to 2/I N-acetylglucosaminyltransferase; gly-16 is expressed in the seam cells during embryonic stages.
38K12B6.8K12B6.8n/achrV 6,310,389contains similarity to Interpro domains IPR001841 (Zinc finger, RING-type), IPR001965 (Zinc finger, PHD-type), IPR013083 (Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type), IPR002219 (Protein kinase C, phorbol ester/diacylglycerol binding)
39clp-2T04A8.16n/achrIII 4,702,158clp-2 encodes a large calpain subunit that contains two predicted MIT (microtubule interacting and trafficking) domains and is homologous to the mammalian Calpain 7 proteins and the atypical, nuclear-localized Aspergillus calpain, PalB; by homology, CLP-2 is predicted to function as a calcium-dependent, cysteine protease that is involved in intracellular proteolysis and peptidolysis; however, as loss of clp-2 activity via RNA-mediated interference (RNAi) does not result in any obvious abnormalities, the precise role of CLP-2 in C. elegans development and/or behavior is not yet known.
40sri-24C41G6.11n/achrV 15,212,913C. elegans SRI-24 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
41T05E7.4T05E7.4n/achrI 6,193,727
42T09E11.4T09E11.4n/achrI 12,361,669contains similarity to Pfam domain PF01757 Acyltransferase family contains similarity to Interpro domain IPR002656 (Acyltransferase 3)
43R03D7.2R03D7.2n/achrII 10,933,886contains similarity to Rhodopirellula baltica DNA-binding protein SMUBP-2.; TR:Q7UWP1
44W05H12.2W05H12.2n/achrI 13,412,326contains similarity to Pfam domain PF01612 3'-5' exonuclease contains similarity to Interpro domains IPR002562 (3'-5' exonuclease), IPR012337 (Polynucleotidyl transferase, Ribonuclease H fold)
45srd-4ZK863.5n/achrV 12,185,574C. elegans SRD-4 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
46K12D9.12K12D9.12n/achrV 3,021,212contains similarity to Pfam domain PF01030 Receptor L domain contains similarity to Interpro domain IPR000494 (EGF receptor, L domain)
47nekl-2ZC581.1n/achrI 6,664,152nekl-2 encodes a putative serine/threonine protein kinase orthologous to Aspergillus nidulans nimA and human NEK8 (OMIM:609799), and paralogous to C. elegans D1044.3, D1044.8, F19H6.1, and Y39G10AR.3; nekl-2 interacts with two or more components of the EGF/RAS signalling pathway, and is required for such signalling in vulval development.
48T14G8.4T14G8.4n/achrX 12,862,943contains similarity to Mus musculus Gamma-tubulin complex component GCP5 homolog.; TR:Q8BKN5
49col-89F17C8.2n/achrIII 4,748,632C. elegans COL-89 protein; contains similarity to Pfam domains PF01484 (Nematode cuticle collagen N-terminal domain) , PF01391 (Collagen triple helix repeat (20 copies)) (2)contains similarity to Interpro domains IPR002486 (Nematode cuticle collagen, N-terminal), IPR000694 (Proline-rich region), IPR008160 (Collagen triple helix repeat)
50C32B5.12C32B5.12n/achrII 952,421