UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1C13F10.5C13F10.55.0000000000000005e-68chrV 7,217,043contains similarity to Homo sapiens Isoform 2 of Uncharacterized protein C6orf64; ENSEMBL:ENSP00000362346
2F22D3.5F22D3.5n/achrII 6,938,664
3T01C8.3T01C8.3n/achrX 16,781,536
4M110.3M110.3n/achrII 8,215,496contains similarity to Pfam domain PF00097 Zinc finger, C3HC4 type (RING finger) contains similarity to Interpro domains IPR001841 (Zinc finger, RING-type), IPR013083 (Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type), IPR011016 (Zinc finger, variant RING-type)
5M151.3M151.3n/achrII 3,629,023contains similarity to Homo sapiens Isoform 2 of Girdin; ENSEMBL:ENSP00000263630
6F14D2.5F14D2.5n/achrII 3,340,796
7K08D9.2K08D9.2n/achrV 3,228,961contains similarity to Pfam domain PF01697 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domain IPR008166 (Protein of unknown function DUF23)
8F42A6.5F42A6.5n/achrIV 3,331,304contains similarity to Interpro domain IPR001357 (BRCT)
9F21F8.2F21F8.2n/achrV 8,275,167contains similarity to Pfam domain PF00026 Eukaryotic aspartyl protease contains similarity to Interpro domains IPR009007 (Peptidase aspartic, catalytic), IPR001461 (Peptidase A1)
10fbxb-67F49B2.2n/achrI 14,297,764This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; its encoded protein also contains a Pfam-B45 motif of presently unknown function.
11Y40B1B.7Y40B1B.7n/achrI 13,427,466contains similarity to Rattus norvegicus Coiled-coil domain-containing protein 86 (Cytokine-induced proteinswith coiled-coil domain).; SW:Q5XIB5
12C48B4.7C48B4.7n/achrIII 9,558,981contains similarity to Xenopus laevis Hypothetical protein.; TR:Q7ZYB3
13C02H6.1C02H6.1n/achrV 7,389,111contains similarity to Pfam domain PF01762 Galactosyltransferase contains similarity to Interpro domain IPR002659 (Glycosyl transferase, family 31)
14Y52B11A.8Y52B11A.8n/achrI 11,033,190contains similarity to Interpro domains IPR016090 (Phospholipase A2), IPR013090 (Phospholipase A2, active site)
15his-74W05B10.1n/achrV 12,659,997C. elegans HIS-74 protein; contains similarity to Pfam domain PF00125 Core histone H2A/H2B/H3/H4 contains similarity to Interpro domains IPR000164 (Histone H3), IPR009072 (Histone-fold), IPR007125 (Histone core)
16set-13K12H6.11n/achrII 2,818,048set-13 encodes a SET domain-containing protein; SET-13 has no non-nematode orthologs, but several paralogs (SET-6, SET-15, SET-19, SET-20, SET-21, and SET-32); neither set-13(n5012) nor set-13(RNAi) have any obvious phenotypes.
17C56E6.2C56E6.2n/achrII 6,525,580contains similarity to Pfam domains PF00071 (Ras family) , PF08477 (Miro-like protein) contains similarity to Interpro domains IPR002041 (Ran GTPase), IPR003577 (Ras small GTPase, Ras type), IPR013684 (Miro-like), IPR003578 (Ras small GTPase, Rho type), IPR005225 (Small GTP-binding protein), IPR001806 (Ras GTPase), IPR003579 (Ras small GTPase, Rab type), IPR006688 (ADP-ribosylation factor), IPR013753 (Ras), IPR006036 (Potassium uptake protein TrkA), IPR002078 (RNA polymerase sigma factor 54, interaction)
18F59D12.3F59D12.3n/achrX 15,649,663contains similarity to Pfam domain PF04590 Protein of unknown function, DUF595 contains similarity to Interpro domain IPR007669 (Protein of unknown function DUF595)
19T08D2.7T08D2.7n/achrX 186,625contains similarity to Pfam domains PF00069 (Protein kinase domain) , PF00498 (FHA domain) contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR008984 (SMAD/FHA domain), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related), IPR000253 (Forkhead-associated)
20C08H9.7C08H9.7n/achrII 9,860,547contains similarity to Pfam domain PF00704 Glycosyl hydrolases family 18 contains similarity to Interpro domains IPR011583 (Chitinase II), IPR017853 (Glycoside hydrolase, catalytic core), IPR001223 (Glycoside hydrolase, family 18, catalytic domain), IPR013781 (Glycoside hydrolase, subgroup, catalytic core)
21ZK218.1ZK218.1n/achrV 17,092,954contains similarity to Pfam domain PF01549 ShK domain-like contains similarity to Interpro domain IPR003582 (Metridin-like ShK toxin)
22gcy-9ZK455.2n/achrX 11,335,257gcy-9 encodes a membrane guanylyl cyclase; gcy-9 expression is reportedly weak and variable in non-neuronal tissues.
23sre-8F40G12.1n/achrV 14,258,150C. elegans SRE-8 protein; contains similarity to Pfam domain PF03125 C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR004151 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor)
24F14B8.2F14B8.2n/achrX 6,904,852
25B0207.6B0207.6n/achrI 5,936,242contains similarity to Pfam domain PF03029 Conserved hypothetical ATP binding protein contains similarity to Interpro domain IPR004130 (Protein of unknown function, ATP binding)
26srx-48T26H8.2n/achrV 15,303,024C. elegans SRX-48 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
27str-229C17E7.11n/achrV 3,901,512C. elegans STR-229 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
28M01E11.1M01E11.1n/achrI 5,582,772contains similarity to Pfam domain PF04140 Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase (ICMT) family contains similarity to Interpro domain IPR007269 (Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase)
29F44E5.2F44E5.2n/achrII 11,770,321contains similarity to Pfam domain PF00560 Leucine Rich Repeat
30Y39E4B.11Y39E4B.11n/achrIII 13,206,068
31fbxa-145F48C1.2n/achrI 5,320,402This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins.
32F37B12.3F37B12.3n/achrII 9,040,539contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
33C50F4.4C50F4.4n/achrV 9,537,163contains similarity to Streptomyces coelicolor Hypothetical protein SCO3733.; TR:Q9L0X1
34C17H12.2C17H12.2n/achrIV 6,788,223contains similarity to Drosophila melanogaster Flybase gene name is CG7289-PA;; FLYBASE:CG7289
35F40E3.3F40E3.3n/achrI 2,638,982
36hlh-28F31A3.2n/achrX 17,550,714C. elegans HLH-28 protein; contains similarity to Pfam domain PF00010 Helix-loop-helix DNA-binding domain contains similarity to Interpro domains IPR001092 (Basic helix-loop-helix dimerisation region bHLH), IPR011598 (Helix-loop-helix DNA-binding)
37C49F5.3C49F5.3n/achrX 11,983,268contains similarity to Phytophthora infestans SECY-independent transporter protein.; TR:Q9T238
38B0563.5B0563.5n/achrX 9,146,762
39C10B5.1C10B5.1n/achrV 8,582,501contains similarity to Pfam domain PF00400 WD domain, G-beta repeat contains similarity to Interpro domains IPR011046 (WD40 repeat-like), IPR001680 (WD40 repeat), IPR016160 (Aldehyde dehydrogenase, conserved site), IPR015943 (WD40/YVTN repeat-like)
40R11G11.14R11G11.14n/achrV 522,961contains similarity to Pfam domains PF04083 (ab-hydrolase associated lipase region) , PF00561 (alpha/beta hydrolase fold) contains similarity to Interpro domains IPR006693 (AB-hydrolase associated lipase region), IPR000073 (Alpha/beta hydrolase fold-1), IPR008262 (Lipase, active site)
41ZC412.8ZC412.8n/achrV 14,879,632contains similarity to Plasmodium cynomolgi Circumsporozoite protein precursor (CS).; SW:P08675
42Y39A1A.2Y39A1A.2n/achrIII 10,602,626contains similarity to Oryza sativa Hypothetical protein.; TR:Q9LH25
43wee-1.1F35H8.7n/achrII 9,582,677C. elegans WEE-1.1 protein; contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
44srh-97F49H6.4n/achrV 17,018,412C. elegans SRH-97 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
45C48C5.3C48C5.3n/achrX 8,959,409contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
46srb-7F37C12.17n/achrIII 7,178,120C. elegans SRB-7 protein; contains similarity to Pfam domains PF02117 (C.elegans Sra family integral membrane protein) , PF02175 (C.elegans integral membrane protein Srb) contains similarity to Interpro domains IPR001463 (Sodium:alanine symporter), IPR002184 (Serpentine beta receptor), IPR000344 (Nematode chemoreceptor, Sra)
47vet-6F44F1.7n/achrI 13,271,377vet-6 encodes a protein that contains a spectrin repeat; vet-6 is preferentially transcribed in embryos prior to gastrulation.
48T02G6.6T02G6.6n/achrI 11,821,054contains similarity to Pfam domain PF07735 F-box associated contains similarity to Interpro domain IPR012885 (F-box associated type 2)
49Y39E4B.7Y39E4B.7n/achrIII 13,113,204contains similarity to Pfam domain PF01529 (DHHC zinc finger domain)
50Y54G9A.5Y54G9A.5n/achrII 13,723,894