UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1srr-5C13D9.20chrV 5,009,463C. elegans SRR-5 protein; contains similarity to Pfam domain PF03268 Caenorhabditis protein of unknown function, DUF267 contains similarity to Interpro domains IPR004950 (Protein of unknown function DUF267, Caenorhabditis species), IPR000146 (Inositol phosphatase/fructose-1,6-bisphosphatase)
2nhr-282F54B8.2n/achrV 15,812,667C. elegans NHR-282 protein; contains similarity to Pfam domain PF00104 Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
3T24A6.2T24A6.2n/achrV 3,558,528
4F35B3.3F35B3.3n/achrX 17,013,662
5Y18D10A.4Y18D10A.4n/achrI 12,816,155contains similarity to Thecacera pennigera Cytochrome oxidase subunit I (EC 1.9.3.1) (Cytochrome c oxidasespolypeptide I) (Fragment).; TR:Q9T6F2
6T16A1.4T16A1.4n/achrII 2,081,787
7srt-35F47D2.4n/achrV 4,263,036C. elegans SRT-35 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domains IPR002651 (Protein of unknown function DUF32), IPR001991 (Sodium:dicarboxylate symporter)
8W03B1.8W03B1.8n/achrIV 4,344,287contains similarity to Pfam domain PF01757 Acyltransferase family contains similarity to Interpro domain IPR002656 (Acyltransferase 3)
9Y45F3A.4Y45F3A.4n/achrIII 10,573,829contains similarity to Interpro domain IPR008967 ()
10Y8A9A.4Y8A9A.4n/achrII 3,791,066
11F49E11.8F49E11.8n/achrIV 13,055,531contains similarity to Neisseria meningitidis Preprotein translocase SecA subunit.; TR:Q9JTK7
12F15H10.5F15H10.5n/achrV 10,418,359contains similarity to Borrelia burgdorferi Hypothetical protein BB0170.; TR:O51192
13sru-23F36G9.6n/achrV 15,971,479C. elegans SRU-23 protein; contains similarity to Pfam domain PF02688 Domain of unknown function DUF215 contains similarity to Interpro domains IPR003839 (Protein of unknown function DUF215), IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
14str-3M7.13n/achrIV 11,099,437str-3 encodes a seven transmembrane chemosensory receptor; STR-3 is expressed in the ASI chemosensory neurons; STR-3 expression in ASI is repressed in the presence of dauer pheromone at concentrations lower than that which induces dauer formation.
15F28A10.8F28A10.8n/achrII 838,145contains similarity to Pfam domain PF03762 Vitelline membrane outer layer protein I (VOMI) contains similarity to Interpro domain IPR005515 (Vitelline membrane outer layer protein I (VOMI))
16C07A4.2C07A4.2n/achrX 10,173,174contains similarity to Pfam domain PF00188 SCP-like extracellular protein contains similarity to Interpro domains IPR014044 (SCP-like extracellular), IPR001283 (Allergen V5/Tpx-1 related)
17F46B3.14F46B3.14n/achrV 20,626,135contains similarity to Interpro domain IPR003645 (Follistatin-like, N-terminal)
18F54B11.9F54B11.9n/achrX 13,607,737contains similarity to Plasmodium falciparum Hypothetical protein.; TR:Q8I5W3
19srd-58E04F6.13n/achrII 7,204,421C. elegans SRD-58 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
20F47D12.6F47D12.6n/achrIII 6,286,908
21tag-194W02D3.6n/achrI 6,730,509C. elegans TAG-194 protein; contains similarity to Pfam domain PF00153 Mitochondrial carrier protein contains similarity to Interpro domains IPR002067 (Mitochondrial carrier protein), IPR002030 (Mitochondrial brown fat uncoupling protein), IPR001993 (Mitochondrial substrate carrier), IPR002113 (Adenine nucleotide translocator 1)
22lgc-42Y39A3B.2n/achrIII 2,000,367C. elegans LGC-42 protein; contains similarity to Pfam domains PF02931 (Neurotransmitter-gated ion-channel ligand binding domain) , PF02932 (Neurotransmitter-gated ion-channel transmembrane region) contains similarity to Interpro domains IPR006028 (Gamma-aminobutyric acid A receptor), IPR006201 (Neurotransmitter-gated ion-channel), IPR006202 (Neurotransmitter-gated ion-channel ligand-binding), IPR006029 (Neurotransmitter-gated ion-channel transmembrane region)
23srd-71C13B7.4n/achrV 2,424,746C. elegans SRD-71 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR001614 (Myelin proteolipid protein PLP), IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR002016 (Haem peroxidase, plant/fungal/bacterial)
24srj-15Y40B10B.2n/achrV 1,963,860C. elegans SRJ-15 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR002120 (Thyrotrophin-releasing hormone receptor)
25srw-109ZK488.9n/achrV 607,863C. elegans SRW-109 protein; contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR008075 (Lipocalin-1 receptor)
26F35C12.1F35C12.1n/achrI 9,805,249contains similarity to Ralstonia solanacearum PopB.; TR:Q84IE7
27F11A5.13F11A5.13n/achrV 16,226,353contains similarity to Clostridium acetobutylicum MDR-type permease.; TR:Q97D15
28C50B8.4C50B8.4n/achrV 13,572,712contains similarity to Helicobacter pylori Vacuolating cytotoxin.; TR:Q9ZHV0
29Y43F8B.12Y43F8B.12n/achrV 19,469,274contains similarity to Saccharomyces cerevisiae Mitotic spindle assembly; SGD:YBL063W
30C39B10.3C39B10.3n/achrX 10,443,924contains similarity to Saccharomyces cerevisiae Protein involved in mating-type locus silencing, interacts with Sir2p; probably functions to recruit or stabilize Sir proteins; SGD:YDR363W
31str-261W09D6.2n/achrIII 11,075,857C. elegans STR-261 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR011256 (Regulatory factor, effector, bacterial), IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
32C30F2.2C30F2.2n/achrX 16,080,929contains similarity to Interpro domain IPR001841 (Zinc finger, RING-type)
33C17B7.9C17B7.9n/achrV 3,331,512contains similarity to Pfam domain PF01579 Domain of unknown function DUF19 contains similarity to Interpro domains IPR016638 (Uncharacterised conserved protein UPF0376), IPR002542 (Protein of unknown function DUF19)
34T06C12.12T06C12.12n/achrV 15,892,264contains similarity to Pyrococcus horikoshii Hypothetical protein PH0933.; TR:O58684
35dct-14Y38H6C.3n/achrV 20,495,572C. elegans DCT-14 protein ; contains similarity to Rhizopus oryzae FK506-binding protein 4 (EC 5.2.1.8) (Peptidyl-prolyl cis-transsisomerase) (PPIase) (Rotamase).; SW:P0C1J6
36srh-142T08G3.3n/achrV 16,460,149C. elegans SRH-142 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
37T28A11.4T28A11.4n/achrV 3,274,213
38srh-100C46E10.10n/achrII 3,713,935C. elegans SRH-100 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
39C25A1.15C25A1.15n/achrI 10,197,447contains similarity to Human herpesvirus 6 Hypothetical protein.; TR:Q89893
40clec-116K04H8.1n/achrI 14,251,698C. elegans CLEC-116 protein; contains similarity to Pfam domain PF08277 PAN-like domain contains similarity to Interpro domains IPR006583 (CW), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
41R04F11.1R04F11.1n/achrV 12,309,572R04F11.1 encodes a claudin homolog that may be required for normal cohesion of apical junctions in epithelia; R04F11.1 is worm-specific, with obvious homologs only in C. elegans; R04F11.1 has no obvious function in mass RNAi assays; claudins are integral membrane proteins with four transmembrane sequences that are found in mammalian tight junctions (TJs), induce TJs when transgenically expressed in cells normally lacking them, and can mediate the specific conductance of of specific ions (e.g., magnesium or calcium) through TJs while blocking the flow of water.
42B0563.7B0563.7n/achrX 9,153,274contains similarity to Pfam domain PF00036 EF hand contains similarity to Interpro domains IPR001125 (Recoverin), IPR011992 (EF-Hand type), IPR002048 (Calcium-binding EF-hand), IPR003299 (Flagellar calcium-binding protein (calflagin)), IPR000261 (EPS15 homology (EH))
43C06A5.5C06A5.5n/achrI 5,982,136
44F01D4.8F01D4.8n/achrIV 10,451,925contains similarity to Pfam domain PF00291 Pyridoxal-phosphate dependent enzyme contains similarity to Interpro domain IPR001926 (Pyridoxal phosphate-dependent enzyme, beta subunit)
45scl-4C39E9.1n/achrIV 13,062,457C. elegans SCL-4 protein; contains similarity to Pfam domain PF00188 SCP-like extracellular protein contains similarity to Interpro domains IPR014044 (SCP-like extracellular), IPR002413 (Ves allergen), IPR001283 (Allergen V5/Tpx-1 related), IPR000480 (Glutelin)
46EGAP5.1EGAP5.1n/achrX 5,163,174
47srw-20T05E12.4n/achrV 17,079,045C. elegans SRW-20 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
48str-106K05D4.2n/achrV 16,181,228C. elegans STR-106 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
49srz-20F56D6.5n/achrIV 3,916,211C. elegans SRZ-20 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domains IPR002651 (Protein of unknown function DUF32), IPR001411 (Tetracycline resistance protein, TetB), IPR000576 (Proton/sugar symporter, LacY)
50C37C3.11C37C3.11n/achrV 7,864,144