UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1C12D12.5C12D12.52e-127chrX 3,505,953contains similarity to Pfam domain PF00505 HMG (high mobility group) box contains similarity to Interpro domains IPR000910 (High mobility group box, HMG1/HMG2), IPR009071 (High mobility group box, HMG)
2skr-9C52D10.7n/achrIV 17,163,837skr-9 encodes a homolog of Skp1 in S. cerevisiae, a component of the SCF (Skp1, Cullin, F-box) ubiquitin-ligase complex that regulates ubiquitin-mediated protein degradation; SKR-9 is required for posterior body morphogenesis, embryonic and larval development, and postembryonic cell proliferation.
3C49C3.10C49C3.10n/achrIV 17,337,847contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR000215 (Protease inhibitor I4, serpin), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
4math-15C16C4.5n/achrII 1,867,089C. elegans MATH-15 protein; contains similarity to Pfam domain PF00917 MATH domain contains similarity to Interpro domains IPR008974 (TRAF-like), IPR002083 (MATH)
5sri-42T10D4.9n/achrII 3,141,931C. elegans SRI-42 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
6T26E4.5T26E4.5n/achrV 15,787,827contains similarity to Interpro domain IPR008996 ()
7ZK550.2ZK550.2n/achrIV 17,247,626contains similarity to Pfam domain PF07690 Major Facilitator Superfamily contains similarity to Interpro domains IPR007114 (Major facilitator superfamily), IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
8T28F3.9T28F3.9n/achrIV 17,310,065contains similarity to Pfam domain PF02485 Core-2/I-Branching enzyme contains similarity to Interpro domain IPR003406 (Glycosyl transferase, family 14)
9gtl-1C05C12.3n/achrIV 11,254,145gtl-1 encodes a TRPM subfamily member of the TRP channel family that affects the periodicity of the defecation cycle in combination with gon-2; expression includes the intestine.
10K04G11.3K04G11.3n/achrX 14,346,393contains similarity to Pfam domain PF07547 RSD-2 N-terminal domain contains similarity to Interpro domain IPR011508 (RSD-2, N-terminal)
11T08E11.8T08E11.8n/achrII 1,834,708contains similarity to Pfam domain PF01827 FTH domain contains similarity to Interpro domain IPR002900 (Protein of unknown function DUF38, Caenorhabditis species)
12F22H10.6F22H10.6n/achrX 16,690,126
13T20D4.6T20D4.6n/achrV 3,411,676contains similarity to Pfam domains PF00339 (Arrestin (or S-antigen), N-terminal domain) , PF02752 (Arrestin (or S-antigen), C-terminal domain) contains similarity to Interpro domains IPR014756 (Immunoglobulin E-set), IPR011022 (Arrestin-like, C-terminal), IPR014752 (Arrestin, C-terminal), IPR011021 (Arrestin-like, N-terminal)
14drh-3D2005.5n/achrI 7,823,605drh-3 encodes a DExH-box helicase.
15atp-4T05H4.12n/achrV 6,426,736C. elegans ATP-4 protein; contains similarity to Pfam domain PF05511 Mitochondrial ATP synthase coupling factor 6 contains similarity to Interpro domain IPR008387 (ATPase, F0 complex, subunit F6, mitochondrial)
16F19C7.6F19C7.6n/achrIV 4,595,282
17C49A9.2C49A9.2n/achrIV 6,226,732contains similarity to Pfam domain PF03312 Protein of unknown function, DUF272 contains similarity to Interpro domain IPR004987 (Protein of unknown function DUF272)
18C29F7.7C29F7.7n/achrX 13,442,218contains similarity to Peromyscus maniculatus Alcohol dehydrogenase 2 (EC 1.1.1.1).; SW:ADH2_PERMA
19K08C7.7K08C7.7n/achrIV 10,665,006This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins.
20B0244.7B0244.7n/achrIII 5,732,127contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
21end-1F58E10.2n/achrV 13,986,046end-1 encodes a GATA-like transcription factor sufficient to initiate endoderm differentiation and binds to the canonical target DNA sequence WGATAR with specificity similar to GATA-1 and D4 transcription factors; its expression bypasses requirement for maternal SKN-1 and the maternal Wnt signaling pathway in endoderm formation and it activates endoderm differentiation in isolated Xenopus ectoderm.
22nspb-5F38A5.9n/achrIV 6,599,329C. elegans NSPB-5 protein; contains similarity to Pfam domain PF07312 Protein of unknown function (DUF1459) contains similarity to Interpro domain IPR009924 (Protein of unknown function DUF1459)
23Y47H9C.9Y47H9C.9n/achrI 11,900,113contains similarity to Pfam domain PF06918 Protein of unknown function (DUF1280) contains similarity to Interpro domain IPR009689 (Protein of unknown function DUF1280)
24cyp-33E3F42A9.4n/achrIV 8,615,428C. elegans CYP-33E3 protein; contains similarity to Pfam domain PF00067 Cytochrome P450 contains similarity to Interpro domains IPR001128 (Cytochrome P450), IPR002401 (Cytochrome P450, E-class, group I)
25ZK892.3ZK892.3n/achrII 10,002,830contains similarity to Pfam domains PF07690 (Major Facilitator Superfamily) , PF00083 (Sugar (and other) transporter) contains similarity to Interpro domains IPR007114 (Major facilitator superfamily), IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR005829 (Sugar transporter, conserved site), IPR005828 (General substrate transporter), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
26F19C7.2F19C7.2n/achrIV 4,601,343contains similarity to Pfam domain PF05577 Serine carboxypeptidase S28 contains similarity to Interpro domain IPR008758 (Peptidase S28)
27H10E21.1H10E21.1n/achrIII 16,729
28srd-53F13G3.2n/achrI 7,294,860C. elegans SRD-53 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
29C06A12.3C06A12.3n/achrIV 17,428,622contains similarity to Pfam domain PF05303 Protein of unknown function (DUF727) contains similarity to Interpro domain IPR007967 (Protein of unknown function DUF727)
30F34H10.4F34H10.4n/achrX 9,649,656contains similarity to Interpro domain IPR002253 (Flavin-containing monooxygenase (FMO) 1)
31C32E8.9C32E8.9n/achrI 3,796,306contains similarity to Pfam domain PF00378 Enoyl-CoA hydratase/isomerase family contains similarity to Interpro domain IPR001753 (Crotonase, core)
32D2085.4D2085.4n/achrII 8,667,037contains similarity to Pfam domains PF00612 (IQ calmodulin-binding motif) , PF00632 (HECT-domain (ubiquitin-transferase)) contains similarity to Interpro domains IPR000569 (HECT), IPR000048 (IQ calmodulin-binding region)
33B0432.4B0432.4n/achrII 287,664contains similarity to Pfam domain PF00153 Mitochondrial carrier protein contains similarity to Interpro domains IPR001993 (Mitochondrial substrate carrier), IPR002067 (Mitochondrial carrier protein), IPR002030 (Mitochondrial brown fat uncoupling protein), IPR002113 (Adenine nucleotide translocator 1)
34T22F3.10T22F3.10n/achrV 3,608,429contains similarity to Pfam domain PF07690 Major Facilitator Superfamily contains similarity to Interpro domains IPR007114 (Major facilitator superfamily), IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
35R105.1R105.1n/achrIV 4,635,811contains similarity to Pfam domain PF03762 Vitelline membrane outer layer protein I (VOMI) contains similarity to Interpro domain IPR005515 (Vitelline membrane outer layer protein I (VOMI))
36F38A1.9F38A1.9n/achrIV 1,244,866
37F46C5.7F46C5.7n/achrII 8,839,705contains similarity to Homo sapiens Splice isoform 1 of Q8WXQ8 Carboxypeptidase A5 precursor; ENSEMBL:ENSP00000289573
38pkc-1F57F5.5n/achrV 12,019,252pkc-1 encodes a serine/threonine protein kinase that is orthologous to mammalian protein kinase C epsilon (PRKCE), a member of the nPKC subgroup of the protein kinase C superfamily; together with UNC-13, PKC-1 may act downstream of goa-1 to modulate phorbol ester-induced stimulation of acetylcholine release at NMJs; PKC-1 positively regulates locomotion, and affects thermotaxis and chemotaxis together with kin-11; PKC-1 is required for regulating several behaviors including sensation of volatile and soluble compounds, osmolarity, and temperature (thermosensation); PKC-1 is also required for phorbolester-induced stimulation of acetylcholine release at neuromuscular junctions; PKC-1 localizes to the processes and cell bodies of approximately 75 sensory neurons and interneurons, and pkc-1 mRNA is detectable at varying levels during larval and adult stages.
39B0222.9B0222.9n/achrV 9,170,672contains similarity to Pfam domains PF00941 (FAD binding domain in molybdopterin dehydrogenase) , PF02738 (Aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding domain) , PF00111 (2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain) , PF01799 ([2Fe-2S] binding domain) , PF01315 (Aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, a/b hammerhead domain) contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR001041 (Ferredoxin), IPR002346 (Molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding), IPR012675 (Beta-grasp fold, ferredoxin-type), IPR002888 ([2Fe-2S]-binding), IPR016166 (FAD-binding, type 2), IPR006058 (2Fe-2S ferredoxin, iron-sulphur binding site), IPR016169 (CO dehydrogenase flavoprotein-like, FAD-binding, subdomain 2), IPR000674 (Aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, a/b hammerhead), IPR008274 (Aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding)
40C14C6.13C14C6.13n/achrV 573,386
41bcmo-2F53C3.12n/achrII 3,909,661C. elegans BCMO-2 protein; contains similarity to Pfam domain PF03055 Retinal pigment epithelial membrane protein contains similarity to Interpro domains IPR004294 (Carotenoid oxygenase), IPR015123 (Bcr-Abl oncoprotein oligomerisation)
42srw-88T06G6.7n/achrI 12,721,084C. elegans SRW-88 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
43F15A4.9F15A4.9n/achrII 12,480,165contains similarity to Pfam domains PF00339 (Arrestin (or S-antigen), N-terminal domain) , PF02752 (Arrestin (or S-antigen), C-terminal domain) contains similarity to Interpro domains IPR014756 (Immunoglobulin E-set), IPR011022 (Arrestin-like, C-terminal), IPR014752 (Arrestin, C-terminal), IPR011021 (Arrestin-like, N-terminal)
44clec-21T07H3.4n/achrII 1,583,563C. elegans CLEC-21 protein; contains similarity to Pfam domains PF00431 (CUB domain) , PF00059 (Lectin C-type domain) (2)contains similarity to Interpro domains IPR000859 (CUB), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
45clec-242Y68A4B.2n/achrV 17,244,604C. elegans CLEC-242 protein; contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
46F28C1.1F28C1.1n/achrV 12,452,041contains similarity to Drosophila melanogaster Flybase gene name is CG6695-PA;; FLYBASE:CG6695
47W06D12.1W06D12.1n/achrV 17,736,716contains similarity to Pfam domain PF00100 Zona pellucida-like domain contains similarity to Interpro domain IPR001507 (Endoglin/CD105 antigen)
48T26C5.4T26C5.4n/achrII 9,249,704contains similarity to Encephalitozoon cuniculi SER/THR protein phosphatase 2-A (EC 3.1.3.16) (Serine/threoninesprotein phosphatase).; TR:Q8SS50
49R07B7.5R07B7.5n/achrV 12,069,626contains similarity to Pfam domain PF01494 FAD binding domain contains similarity to Interpro domains IPR003042 (Aromatic-ring hydroxylase), IPR002938 (Monooxygenase, FAD-binding)
50W03H9.2W03H9.2n/achrII 14,144,403contains similarity to Homo sapiens Conserved hypothetical protein; HI:HIT000046554