UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1C11H1.5C11H1.50chrX 14,300,542contains similarity to Pfam domain PF00090 Thrombospondin type 1 domain contains similarity to Interpro domain IPR000884 (Thrombospondin, type I)
2skr-9C52D10.7n/achrIV 17,163,837skr-9 encodes a homolog of Skp1 in S. cerevisiae, a component of the SCF (Skp1, Cullin, F-box) ubiquitin-ligase complex that regulates ubiquitin-mediated protein degradation; SKR-9 is required for posterior body morphogenesis, embryonic and larval development, and postembryonic cell proliferation.
3W02D3.2W02D3.2n/achrI 6,738,931contains similarity to Pfam domain PF01180 Dihydroorotate dehydrogenase contains similarity to Interpro domains IPR001295 (Dihydroorotate dehydrogenase, core), IPR013785 (Aldolase-type TIM barrel), IPR005719 (Dihydroorotate dehydrogenase, class 2), IPR012135 (Dihydroorotate dehydrogenase, classes 1 and 2)
4T20H4.5T20H4.5n/achrIII 7,233,493T20H4.5 gene encodes a 23 kDa subunit of mitochondrial complex I that is required for oxidative phosphorylation and for resistance to volatile anesthetics; T20H4.5 is orthologous to human NDUFS8 (OMIM:602141, mutated in Leigh syndrome).
5fbxa-216Y47H9C.10n/achrI 11,902,379C. elegans FBXA-216 protein; contains similarity to Pfam domains PF01827 (FTH domain) , PF00646 (F-box domain) contains similarity to Interpro domains IPR002900 (Protein of unknown function DUF38, Caenorhabditis species), IPR001810 (Cyclin-like F-box)
6ZK470.6ZK470.6n/achrX 4,176,765
7C34C12.8C34C12.8n/achrIII 3,460,983contains similarity to Pfam domain PF01025 GrpE contains similarity to Interpro domains IPR009012 (GrpE nucleotide exchange factor, head), IPR013805 (GrpE nucleotide exchange factor, coiled-coil), IPR000740 (GrpE nucleotide exchange factor)
8F09E5.8F09E5.8n/achrII 5,351,303contains similarity to Pfam domain PF01168 Alanine racemase, N-terminal domain contains similarity to Interpro domains IPR011078 (Predicted pyridoxal phosphate-dependent enzyme, YBL036C type), IPR001608 (Alanine racemase, N-terminal)
9F57G8.5F57G8.5n/achrV 16,340,228contains similarity to Pfam domain PF00999 Sodium/hydrogen exchanger family contains similarity to Interpro domain IPR006153 (Sodium/hydrogen exchanger)
10R05H10.2R05H10.2n/achrII 14,861,825contains similarity to Pfam domain PF00076 RNA recognition motif. (a.k.a. RRM, RBD, or RNP domain) contains similarity to Interpro domains IPR004838 (Aminotransferases, class-I, pyridoxal-phosphate-binding site), IPR012677 (Nucleotide-binding, alpha-beta plait), IPR003954 (RNA recognition, region 1), IPR000504 (RNA recognition motif, RNP-1)
11F10D7.3F10D7.3n/achrX 17,373,645contains similarity to Pfam domain PF00462 Glutaredoxin contains similarity to Interpro domains IPR002109 (Glutaredoxin), IPR014025 (Glutaredoxin subgroup), IPR012336 (Thioredoxin-like fold), IPR012335 (Thioredoxin fold), IPR011899 (Glutaredoxin, eukaryotic and viruses)
12F46H5.4F46H5.4n/achrX 7,249,770contains similarity to Pfam domain PF06920 Dedicator of cytokinesis contains similarity to Interpro domains IPR011608 (PRD), IPR002052 (N-6 adenine-specific DNA methylase, conserved site), IPR010703 (Dedicator of cytokinesis), IPR016024 (Armadillo-type fold), IPR000008 (C2 calcium-dependent membrane targeting)
13gly-19F22D6.12n/achrI 7,113,932gly-19 encodes a protein similar to 2/I N-acetylglucosaminyltransferase; it is probably coexpressed with gly-18 in the anal sphincter muscle.
14C05G5.1C05G5.1n/achrX 14,737,200contains similarity to Pfam domain PF07690 Major Facilitator Superfamily contains similarity to Interpro domains IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
15Y45G12C.1Y45G12C.1n/achrV 2,567,280contains similarity to Pfam domain PF07801 Protein of unknown function (DUF1647) contains similarity to Interpro domain IPR012444 (Protein of unknown function DUF1647)
16F11E6.8F11E6.8n/achrIV 17,447,304contains similarity to Pfam domains PF07714 (Protein tyrosine kinase) , PF00069 (Protein kinase domain) contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related), IPR008266 (Tyrosine protein kinase, active site)
17prx-12F08B12.2n/achrX 11,393,885C. elegans PRX-12 protein; contains similarity to Pfam domain PF04757 Pex2 / Pex12 amino terminal region contains similarity to Interpro domains IPR001841 (Zinc finger, RING-type), IPR013083 (Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type), IPR017375 (Peroxisome assembly, p12), IPR006845 (Pex, N-terminal)
18R12E2.12R12E2.12n/achrI 4,174,271contains similarity to Interpro domain IPR000529 (Ribosomal protein S6)
19K09C4.5K09C4.5n/achrX 3,284,155contains similarity to Pfam domains PF07690 (Major Facilitator Superfamily) , PF00083 (Sugar (and other) transporter) contains similarity to Interpro domains IPR007114 (Major facilitator superfamily), IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR005828 (General substrate transporter), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
20D1025.1D1025.1n/achrX 14,521,627contains similarity to Homo sapiens Splice isoform 3 of Q9ULU4 Protein kinase C binding protein 1; ENSEMBL:ENSP00000262975
21his-3T10C6.12n/achrV 16,040,965his-3 encodes an H2A histone; by homology, HIS-3 is predicted to function as a nucleosome component required for packaging of DNA into chromatin; his-3 is a replication-dependent histone locus that resides in the HIS1 cluster on chromosome V.
22mtss-1PAR2.1n/achrIII 8,768,640C. elegans MTSS-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF00436 Single-strand binding protein family contains similarity to Interpro domains IPR000424 (Primosome PriB/single-strand DNA-binding), IPR016027 (Nucleic acid-binding, OB-fold-like), IPR012340 (Nucleic acid-binding, OB-fold), IPR011344 (Single-strand DNA-binding)
23F25E5.1F25E5.1n/achrV 7,468,526contains similarity to Interpro domain IPR009091 (Regulator of chromosome condensation/beta-lactamase-inhibitor protein II)
24W07B8.1W07B8.1n/achrV 1,136,888contains similarity to Pfam domain PF00112 Papain family cysteine protease contains similarity to Interpro domains IPR013128 (Peptidase C1A, papain), IPR000668 (Peptidase C1A, papain C-terminal)
25ars-2F28H1.3n/achrI 3,984,796ars-2 encodes a predicted cytoplasmic alanyl-tRNA synthetase (AlaRS), a class II aminoacyl-tRNA synthetase that catalyzes the attachment of alanine to its cognate tRNA and is thus required for protein biosynthesis; ARS-2 is essential for embryogenesis, and is required for fertility and a normal rate of postembryonic development; ARS-2 expression is likely ubiquitous and detected in hypodermis, intestine, neurons, and the pharynx from late embryogenesis through the adult stage of development.
26M02G9.1M02G9.1n/achrII 10,330,867contains similarity to Pfam domain PF02363 Cysteine rich repeat contains similarity to Interpro domains IPR003341 (Cysteine rich repeat, tripleX), IPR015333 (Pollen allergen ole e 6)
27tag-131H38K22.3n/achrIII 4,318,987C. elegans TAG-131 protein; contains similarity to Pfam domain PF00173 Cytochrome b5-like Heme/Steroid binding domain contains similarity to Interpro domain IPR001199 (Cytochrome b5)
28F52C12.2F52C12.2n/achrIV 1,956,651contains similarity to Pfam domains PF04068 (Possible metal-binding domain in RNase L inhibitor, RLI) , PF04034 (Domain of unknown function (DUF367)) contains similarity to Interpro domains IPR007209 (Possible metal-binding region in RNase L inhibitor, RLI), IPR007177 (Protein of unknown function DUF367)
29T01G5.1T01G5.1n/achrV 15,117,760contains similarity to Pfam domains PF07714 (Protein tyrosine kinase) , PF00069 (Protein kinase domain) contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
30BE10.2BE10.2n/achrIII 12,795,671contains similarity to Homo sapiens Transmembrane protein 195; ENSEMBL:ENSP00000341662
31H13N06.2H13N06.2n/achrX 15,489,935contains similarity to Pfam domain PF00092 von Willebrand factor type A domain contains similarity to Interpro domain IPR002035 (von Willebrand factor, type A)
32ubh-4C08B11.7n/achrII 8,038,864C. elegans UBH-4 protein; contains similarity to Pfam domain PF01088 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase, family 1 contains similarity to Interpro domains IPR001578 (Peptidase C12, ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1), IPR017390 (Ubiquitinyl hydrolase, UCH37 type)
33F08A8.3F08A8.3n/achrI 12,948,957contains similarity to Pfam domains PF01756 (Acyl-CoA oxidase) , PF02770 (Acyl-CoA dehydrogenase, middle domain) contains similarity to Interpro domains IPR013786 (Acyl-CoA dehydrogenase/oxidase, N-terminal), IPR006091 (Acyl-CoA dehydrogenase/oxidase, central region), IPR013764 (Acyl-CoA oxidase/dehydrogenase, type1/2, C-terminal), IPR012258 (Acyl-CoA oxidase), IPR009100 (Acyl-CoA dehydrogenase/oxidase, middle and N-terminal), IPR002655 (Acyl-CoA oxidase, C-terminal), IPR009075 (Acyl-CoA dehydrogenase/oxidase C-terminal)
34T10D4.6T10D4.6n/achrII 3,121,247contains similarity to Pfam domain PF02178 AT hook motif contains similarity to Interpro domains IPR010993 (Sterile alpha motif homology), IPR009057 (Homeodomain-like)
35uig-1F32F2.1n/achrV 13,278,769C. elegans UIG-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF00621 RhoGEF domain contains similarity to Interpro domains IPR000219 (Dbl homology (DH) domain), IPR001849 (Pleckstrin-like), IPR011993 (Pleckstrin homology-type), IPR001331 (Guanine-nucleotide dissociation stimulator, CDC24, conserved site)
36F16F9.4F16F9.4n/achrX 8,461,517contains similarity to Pfam domain PF07859 alpha/beta hydrolase fold contains similarity to Interpro domains IPR002168 (Lipase, GDXG, active site), IPR017157 (Arylacetamide deacetylase), IPR013094 (Alpha/beta hydrolase fold-3)
37C18B12.6C18B12.6n/achrX 15,005,608contains similarity to Pfam domain PF07970 Protein of unknown function (DUF1692) contains similarity to Interpro domain IPR012936 (Protein of unknown function DUF1692)
38str-32T19H12.7n/achrV 4,880,697C. elegans STR-32 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
39F15D4.5F15D4.5n/achrII 13,246,445contains similarity to Interpro domain IPR001878 (Zinc finger, CCHC-type)
40B0205.6B0205.6n/achrI 10,738,293contains similarity to Pfam domains PF01212 (Beta-eliminating lyase) , PF00266 (Aminotransferase class-V) contains similarity to Interpro domains IPR001597 (Aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase), IPR015424 (Pyridoxal phosphate-dependent transferase, major region), IPR000192 (Aminotransferase, class V/Cysteine desulphurase), IPR016454 (Cysteine desulphurase, NifS), IPR015422 (Pyridoxal phosphate-dependent transferase, major region, subdomain 2), IPR015421 (Pyridoxal phosphate-dependent transferase, major region, subdomain 1)
41tag-197F08C6.3n/achrX 7,566,676C. elegans TAG-197 protein; contains similarity to Pfam domain PF04129 Vps52 / Sac2 family contains similarity to Interpro domain IPR007258 (Vps52/Sac2)
42F55A4.1F55A4.1n/achrX 1,036,270contains similarity to Pfam domain PF00957 Synaptobrevin contains similarity to Interpro domains IPR010908 (Longin), IPR011012 (Longin-like), IPR001388 (Synaptobrevin)
43R07B1.7R07B1.7n/achrX 9,869,453contains similarity to Candida albicans Chitinase 2 precursor (EC 3.2.1.14).; SW:CHI2_CANAL
44iff-2F54C9.1n/achrII 8,560,312C. elegans IFF-2 protein; contains similarity to Pfam domains PF01287 (Eukaryotic initiation factor 5A hypusine, DNA-binding OB fold) , PF00467 (KOW motif) contains similarity to Interpro domains IPR001884 (Eukaryotic initiation factor 5A hypusine (eIF-5A)), IPR008991 (Translation protein SH3-like), IPR005824 (KOW), IPR012340 (Nucleic acid-binding, OB-fold), IPR014722 (Translation protein SH3-like, subgroup)
45ppk-1F55A12.3n/achrI 5,361,848ppk-1 encodes a putative phosphatidylinositol-4-phosphate 5' kinase that is essential for ovulation, intense gonad sheath contraction and dilation of the spermathecal valve during oocyte maturation, and UNC-54 filament organization; more generally, PPK-1 is required for fertility, progression through larval development, normal locomotion and defecation, and overall health; defects of ppk-1(RNAi) animals in sterility, ovulation, and UNC-54 filaments are suppressed by the gain-of-function itr-1(sy290) allele, presumably through increased IP(3) signalling; PPK-1 is expressed in gonad sheath, spermatheca, uterine and vulva muscles, distal tip cells, intestine, head mesodermal cell, and many neurons (e.g., in the ventral nerve cord, near the nerve ring, and in tail); PPK-1 may be activated by VAV-1; PPK-1 is orthologous to five human proteins (e.g., PIP5K1B, OMIM:602745), and distantly paralogous to PPK-2.
46T05G5.1T05G5.1n/achrIII 9,741,123contains similarity to Pfam domain PF00008 EGF-like domain contains similarity to Interpro domains IPR000742 (EGF-like, type 3), IPR006209 (EGF-like)
47R05D3.9R05D3.9n/achrIII 8,365,541contains similarity to Interpro domains IPR012336 (Thioredoxin-like fold), IPR012335 (Thioredoxin fold)
48glt-6R05G6.6n/achrIV 7,505,011glt-6 encodes an ortholog of glutamate/aspartate and neutral amino acid transporters.
49tap-1C44H4.5n/achrX 14,590,650C. elegans TAP-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF00481 Protein phosphatase 2C contains similarity to Interpro domains IPR001932 (Protein phosphatase 2C-related), IPR014045 (Protein phosphatase 2C, N-terminal), IPR015655 (Protein phosphatase 2C)
50F55C5.8F55C5.8n/achrV 12,290,267contains similarity to Drosophila melanogaster Flybase gene name is Srp68-PA;; FLYBASE:CG5064