UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1C10B5.1C10B5.12e-173chrV 8,582,501contains similarity to Pfam domain PF00400 WD domain, G-beta repeat contains similarity to Interpro domains IPR011046 (WD40 repeat-like), IPR001680 (WD40 repeat), IPR016160 (Aldehyde dehydrogenase, conserved site), IPR015943 (WD40/YVTN repeat-like)
2T23G5.3T23G5.3n/achrIII 9,230,130contains similarity to Pfam domains PF02214 (K+ channel tetramerisation domain) , PF00786 (P21-Rho-binding domain) contains similarity to Interpro domains IPR000694 (Proline-rich region), IPR000095 (PAK-box/P21-Rho-binding), IPR000210 (BTB/POZ-like), IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR003131 (Potassium channel, voltage dependent, Kv, tetramerisation)
3set-13K12H6.11n/achrII 2,818,048set-13 encodes a SET domain-containing protein; SET-13 has no non-nematode orthologs, but several paralogs (SET-6, SET-15, SET-19, SET-20, SET-21, and SET-32); neither set-13(n5012) nor set-13(RNAi) have any obvious phenotypes.
4C48B4.7C48B4.7n/achrIII 9,558,981contains similarity to Xenopus laevis Hypothetical protein.; TR:Q7ZYB3
5srx-93F59B1.3n/achrV 3,620,070C. elegans SRX-93 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR002651 (Protein of unknown function DUF32), IPR001411 (Tetracycline resistance protein, TetB)
6W06G6.9W06G6.9n/achrV 16,646,169contains similarity to Ralstonia solanacearum Hypothetical protein RSc2317.; TR:Q8XX01
7T27A1.2T27A1.2n/achrII 532,038contains similarity to Pfam domain PF07735 F-box associated contains similarity to Interpro domain IPR012885 (F-box associated type 2)
8sre-40T05A7.8n/achrII 4,682,734C. elegans SRE-40 protein; contains similarity to Pfam domain PF03125 C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR004151 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor)
9str-229C17E7.11n/achrV 3,901,512C. elegans STR-229 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
10T01H10.8T01H10.8n/achrX 12,134,602T01H10.8 encodes a BEACH domain-containing protein that is orthologous to the mammalian lysosomal trafficking regulator LYST which when mutated leads to Chediak-Higashi syndrome (CHS, OMIM:606897).
11K08D9.2K08D9.2n/achrV 3,228,961contains similarity to Pfam domain PF01697 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domain IPR008166 (Protein of unknown function DUF23)
12M03F8.5M03F8.5n/achrV 5,935,209contains similarity to Pfam domain PF02995 Protein of unknown function (DUF229) contains similarity to Interpro domain IPR004245 (Protein of unknown function DUF229)
13hlh-26C17C3.8n/achrII 5,533,262C. elegans HLH-26 protein; contains similarity to Pfam domain PF00010 Helix-loop-helix DNA-binding domain contains similarity to Interpro domains IPR001092 (Basic helix-loop-helix dimerisation region bHLH), IPR011598 (Helix-loop-helix DNA-binding)
14F13B9.6F13B9.6n/achrX 8,266,671contains similarity to Pfam domain PF00100 Zona pellucida-like domain contains similarity to Interpro domain IPR001507 (Endoglin/CD105 antigen)
15F19G12.3F19G12.3n/achrX 1,425,941contains similarity to Pfam domain PF02170 PAZ domain contains similarity to Interpro domain IPR003100 (Argonaute and Dicer protein, PAZ)
16M01E11.1M01E11.1n/achrI 5,582,772contains similarity to Pfam domain PF04140 Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase (ICMT) family contains similarity to Interpro domain IPR007269 (Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase)
17T22B2.5T22B2.5n/achrX 3,910,583
18F10D2.8F10D2.8n/achrV 7,150,438contains similarity to Interpro domain IPR002213 (UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase)
19ZC132.8ZC132.8n/achrV 4,316,012
20T27A1.3T27A1.3n/achrII 536,941This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins.
21F55E10.4F55E10.4n/achrX 8,327,670
22srh-47T03F7.4n/achrV 11,299,983C. elegans SRH-47 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR006069 (ATPase, P-type cation exchange, alpha subunit)
23srx-44T10C6.4n/achrV 16,021,667C. elegans SRX-44 protein ; contains similarity to Rattus norvegicus Blue-sensitive opsin (BOP) (Blue cone photoreceptor pigment) (Shortswavelength-sensitive cone opsin) (S opsin).; SW:Q63652
24ZK666.4ZK666.4n/achrII 10,477,397contains similarity to Oryza sativa Putative retinoblastoma-related protein 1.; TR:Q84QM3
25C02H6.1C02H6.1n/achrV 7,389,111contains similarity to Pfam domain PF01762 Galactosyltransferase contains similarity to Interpro domain IPR002659 (Glycosyl transferase, family 31)
26srd-3K10B4.5n/achrII 127,822C. elegans SRD-3 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
27F09F9.3F09F9.3n/achrX 4,120,310
28T02G5.11T02G5.11n/achrII 7,080,284contains similarity to Pfam domain PF05741 Nanos RNA binding domain contains similarity to Interpro domain IPR008705 (Zinc finger, Nanos)
29srh-165C41G6.9n/achrV 15,220,637C. elegans SRH-165 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
30puf-4M4.2n/achrIV 3,207,566C. elegans PUF-4 protein; contains similarity to Pfam domain PF00806 Pumilio-family RNA binding repeat contains similarity to Interpro domains IPR011989 (Armadillo-like helical), IPR001313 (Pumilio RNA-binding region), IPR016024 (Armadillo-type fold)
31F21D9.8F21D9.8n/achrV 19,279,623contains similarity to Medicago truncatula Pectin methyl-esterase PER precursor (EC 3.1.1.11).; TR:Q9SC90
32B0365.7B0365.7n/achrV 13,144,616contains similarity to Pfam domain PF08393 Dynein heavy chain, N-terminal region 2 contains similarity to Interpro domains IPR013602 (Dynein heavy chain, N-terminal region 2), IPR000215 (Protease inhibitor I4, serpin)
33F11A1.2F11A1.2n/achrX 10,658,016
34srx-41F59B1.7n/achrV 3,635,917C. elegans SRX-41 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domains IPR002651 (Protein of unknown function DUF32), IPR004827 (Basic-leucine zipper (bZIP) transcription factor), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
35xbx-4C23H5.3n/achrIV 2,115,124C. elegans XBX-4 protein ;
36B0034.5B0034.5n/achrII 5,973,873contains similarity to Interpro domain IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
37C07E3.8C07E3.8n/achrII 10,352,798contains similarity to Pfam domain PF06542 Protein of unknown function (DUF1114) contains similarity to Interpro domain IPR009497 (Protein of unknown function DUF1114)
38F47B7.3F47B7.3n/achrX 3,763,711contains similarity to Pfam domain PF02343 Domain of unknown function DUF130 contains similarity to Interpro domain IPR003326 (Protein of unknown function DUF130)
39ncx-3ZC168.1n/achrIV 10,719,177ncx-3 encodes a putative 3Na[+]/1Ca[2+] exchanger, orthologous to human SLC8A1-3 and paralogous to NCX-1/-2; NCX-3 is predicted to export free cytoplasmic Ca[2+] with low affinity but high capacity, being complemented by low-capacity/high-affinity Ca[2+] ATPase pumps such as MCA-1/-3; NCX-3 has tandem Calx-alpha and Calx-beta domains predicted to carry out ion transport and regulation; NCX-3 has no obvious function in mass RNAi assays.
40F26D2.14F26D2.14n/achrV 16,436,268contains similarity to Pfam domain PF01549 ShK domain-like contains similarity to Interpro domain IPR003582 (Metridin-like ShK toxin)
41srbc-18C45H4.6n/achrV 2,169,987C. elegans SRBC-18 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
42wee-1.1F35H8.7n/achrII 9,582,677C. elegans WEE-1.1 protein; contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
43C18A11.6C18A11.6n/achrX 8,034,037
44F56H11.2F56H11.2n/achrIV 9,532,255contains similarity to Bacillus cereus Hypothetical protein.; TR:Q81E16
45F54D5.11F54D5.11n/achrII 11,541,574contains similarity to Pfam domain PF02186 TFIIE beta subunit core domain contains similarity to Interpro domains IPR011991 (Winged helix repressor DNA-binding), IPR016656 (Transcription initiation factor IIE, beta subunit), IPR003166 (Transcription factor TFIIE beta subunit, core)
46F11D11.4F11D11.4n/achrV 18,762,417contains similarity to Pfam domain PF03409 Protein of unknown function (DUF274) contains similarity to Interpro domain IPR005071 (Protein of unknown function DUF274)
47T26A5.4T26A5.4n/achrIII 6,461,112contains similarity to Pfam domain PF00534 Glycosyl transferases group 1 contains similarity to Interpro domain IPR001296 (Glycosyl transferase, group 1)
48C47F8.4C47F8.4n/achrI 12,317,914contains similarity to Pfam domain PF03360 Glycosyltransferase family 43 contains similarity to Interpro domain IPR005027 (Glycosyl transferase, family 43)
49T15B7.7T15B7.7n/achrV 6,824,981contains similarity to Pfam domain PF03385 Protein of unknown function, DUF288 contains similarity to Interpro domain IPR005049 (Protein of unknown function DUF288)
50Y17D7B.5Y17D7B.5n/achrV 18,775,675contains similarity to Interpro domain IPR006583 (CW)