UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1C08D8.1C08D8.10chrV 8,347,824contains similarity to Pfam domains PF07690 (Major Facilitator Superfamily) , PF05978 (Eukaryotic protein of unknown function (DUF895)) contains similarity to Interpro domains IPR010291 (Protein of unknown function DUF895, eukaryotic), IPR003567 (Cytochrome c-type biogenesis protein), IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
2spp-9T25C12.2n/achrX 11,487,901C. elegans SPP-9 protein; contains similarity to Pfam domain PF03489 Saposin-like type B, region 2 contains similarity to Interpro domains IPR008138 (Saposin-like type B, 2), IPR011001 (Saposin-like), IPR008139 (Saposin B)
3F11F1.5F11F1.5n/achrIII 13,402,502contains similarity to Pfam domain PF02520 Domain of unknown function DUF148 contains similarity to Interpro domains IPR003661 (Signal transduction histidine kinase, subgroup 1, dimerisation and phosphoacceptor region), IPR003677 (Protein of unknown function DUF148)
4Y75B8A.33Y75B8A.33n/achrIII 12,364,496
5Y75B8A.10Y75B8A.10n/achrIII 12,181,866contains similarity to Interpro domains IPR001841 (Zinc finger, RING-type), IPR013083 (Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type), IPR006662 (Thioredoxin-related)
6clec-58ZK666.3n/achrII 10,475,101C. elegans CLEC-58 protein; contains similarity to Pfam domain PF00092 von Willebrand factor type A domain contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin), IPR002035 (von Willebrand factor, type A)
7C31A11.1C31A11.1n/achrV 16,294,149contains similarity to Pfam domain PF01757 Acyltransferase family contains similarity to Interpro domains IPR002656 (Acyltransferase 3), IPR006621 (Nose resistant to fluoxetine-4, N-terminal)
8Y26D4A.9Y26D4A.9n/achrI 13,088,824contains similarity to Pfam domain PF03175 DNA polymerase type B, organellar and viral contains similarity to Interpro domains IPR000215 (Protease inhibitor I4, serpin), IPR004868 (DNA-directed DNA polymerase, family B, mitochondria/virus)
9srbc-48F54B8.6n/achrV 15,820,807C. elegans SRBC-48 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
10F49H6.13F49H6.13n/achrV 17,008,999contains similarity to Pfam domain PF06653 Protein of unknown function (DUF1164) contains similarity to Interpro domains IPR009545 (Protein of unknown function DUF1164), IPR001285 (Synaptophysin/synaptoporin)
11srg-40T19C4.4n/achrV 11,163,867C. elegans SRG-40 protein; contains similarity to Interpro domains IPR000500 (Connexins), IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
12E04F6.12E04F6.12n/achrII 7,217,217
13C07H4.1C07H4.1n/achrII 9,091,587contains similarity to Oceanobacillus iheyensis Hypothetical conserved protein.; TR:Q8ETI8
14C01G5.4C01G5.4n/achrIV 6,533,692contains similarity to Pfam domain PF02206 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domains IPR003125 (Protein of unknown function WSN), IPR001399 (VP6 blue-tongue virus inner capsid protein)
15R07B7.7R07B7.7n/achrV 12,072,671
16T24D5.3T24D5.3n/achrX 12,581,565contains similarity to Homo sapiens hypothetical protein DKFZp434P055; ENSEMBL:ENSP00000272832
17cyp-29A4B0331.1n/achrV 9,656,299C. elegans CYP-29A4 protein; contains similarity to Pfam domain PF00067 Cytochrome P450 contains similarity to Interpro domains IPR002397 (Cytochrome P450, B-class), IPR001128 (Cytochrome P450), IPR002401 (Cytochrome P450, E-class, group I), IPR002402 (Cytochrome P450, E-class, group II), IPR002403 (Cytochrome P450, E-class, group IV)
18srh-32Y26G10.2n/achrV 17,702,215C. elegans SRH-32 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
19sri-37D2062.2n/achrII 2,630,401C. elegans SRI-37 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
20C17B7.3C17B7.3n/achrV 3,343,332contains similarity to Pfam domain PF01579 Domain of unknown function DUF19 contains similarity to Interpro domains IPR016638 (Uncharacterised conserved protein UPF0376), IPR002542 (Protein of unknown function DUF19)
21srv-10F53F1.9n/achrV 13,424,568C. elegans SRV-10 protein; contains similarity to Interpro domain IPR001411 (Tetracycline resistance protein, TetB)
22K06A9.2K06A9.2n/achrX 1,538,348This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins.
23C03A7.13C03A7.13n/achrV 5,191,814contains similarity to Interpro domains IPR002048 (Calcium-binding EF-hand), IPR002213 (UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase)
24R160.5R160.5n/achrX 4,370,650
25F14D7.5F14D7.5n/achrV 14,299,389contains similarity to Bacteroides thetaiotaomicron Hypothetical protein.; TR:Q8ABS0
26Y41E3.13Y41E3.13n/achrIV 15,058,268contains similarity to Interpro domain IPR007985 (Haemolysin expression modulating)
27kin-23W04G5.6n/achrI 11,641,436kin-23 encodes a predicted protein tyrosine kinase; like KIN-30, KIN-23 contains an unusual K to R substitution in kinase subdomain VII; kin-23 mRNA is expressed strongly during the L1/L2 larval stages, weakly in L3 and L4 stages, and at undetectable levels in adults.
28F46F5.14F46F5.14n/achrII 800,774contains similarity to Pfam domain PF03314 Protein of unknown function, DUF273 contains similarity to Interpro domain IPR004988 (Protein of unknown function DUF273)
29str-145F58G4.7n/achrV 8,097,583C. elegans STR-145 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
30T25B6.5T25B6.5n/achrX 9,021,091
31F11D5.6F11D5.6n/achrX 3,325,709
32F16B4.6F16B4.6n/achrV 1,588,179contains similarity to Pfam domain PF00550 Phosphopantetheine attachment site contains similarity to Interpro domains IPR006163 (Phosphopantetheine-binding), IPR009081 (Acyl carrier protein-like), IPR003231 (Acyl carrier protein (ACP))
33sri-15F15H9.2n/achrI 12,152,667C. elegans SRI-15 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
34K09C6.1K09C6.1n/achrV 860,591contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core)
35srsx-13C13D9.6n/achrV 4,982,486C. elegans SRSX-13 protein; contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
36acl-12C01C10.3n/achrX 7,440,941C. elegans ACL-12 protein; contains similarity to Interpro domain IPR002123 (Phospholipid/glycerol acyltransferase)
37T25B6.6T25B6.6n/achrX 9,022,315contains similarity to Interpro domain IPR001360 (Glycoside hydrolase, family 1)
38grl-8ZC487.5n/achrV 6,732,495grl-8 encodes a hedgehog-like protein, with an N-terminal signal sequence and a C-terminal Ground-like (Grl) domain; the Grl domain is predicted to form a cysteine-crosslinked protein involved in intercellular signalling, and it has subtle similarity to the N-terminal Hedge domain of HEDGEHOG proteins.
39C44C10.6C44C10.6n/achrX 11,698,664contains similarity to Streptococcus pneumoniae GtrA family protein.; TR:Q97R28
40Y49F6C.6Y49F6C.6n/achrII 3,364,648contains similarity to Pfam domain PF01744 GLTT repeat (6 copies) contains similarity to Interpro domain IPR008164 (Repeat of unknown function XGLTT)
41clec-264F31D4.4n/achrV 20,844,595C. elegans CLEC-264 protein; contains similarity to Pfam domains PF01466 (Skp1 family, dimerisation domain) , PF03931 (Skp1 family, tetramerisation domain) contains similarity to Interpro domains IPR001232 (SKP1 component), IPR016072 (SKP1 component, dimerisation), IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR016073 (SKP1 component, POZ)
42F40B5.1F40B5.1n/achrX 8,376,670F40B5.1 encodes a neprilysin; neprilysins are thermolysin-like zinc metallopeptidases, found on the outer surface of animal cells, that negatively regulate small signalling peptides (e.g., enkephalin, tachykinin, insulin, and natriuretic peptides) by cleaving them; F40B5.1 has no clear orthologs in other organisms.
43nhr-17C02B4.2n/achrX 12,665,768nhr-17 encodes a member of the superfamily of nuclear receptors, which is one of the most abundant class of transcriptional regulators; nuclear receptors have a well conserved DNA binding domain and a less conserved C-terminal ligand binding domain.
44T22B2.2T22B2.2n/achrX 3,922,438
45B0524.3B0524.3n/achrIII 1,888,918
46T28A11.3T28A11.3n/achrV 3,275,745contains similarity to Pfam domain PF01579 Domain of unknown function DUF19 contains similarity to Interpro domains IPR016638 (Uncharacterised conserved protein UPF0376), IPR002542 (Protein of unknown function DUF19)
47srh-100C46E10.10n/achrII 3,713,935C. elegans SRH-100 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
48str-106K05D4.2n/achrV 16,181,228C. elegans STR-106 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
49F28A10.8F28A10.8n/achrII 838,145contains similarity to Pfam domain PF03762 Vitelline membrane outer layer protein I (VOMI) contains similarity to Interpro domain IPR005515 (Vitelline membrane outer layer protein I (VOMI))
50F42A6.2F42A6.2n/achrIV 3,341,612