UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description                                       
1C06E1.7C06E1.70chrIII 8,592,089contains similarity to Pfam domain PF01531 Glycosyl transferase family 11 contains similarity to Interpro domain IPR002516 (Glycosyl transferase, family 11)
2T26E4.5T26E4.55e-23chrV 15,787,827contains similarity to Interpro domain IPR008996 ()
3F34H10.4F34H10.4n/achrX 9,649,656contains similarity to Interpro domain IPR002253 (Flavin-containing monooxygenase (FMO) 1)
4T05E12.3T05E12.3n/achrV 17,077,410contains similarity to Pfam domain PF02214 K+ channel tetramerisation domain contains similarity to Interpro domains IPR000210 (BTB/POZ-like), IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR003131 (Potassium channel, voltage dependent, Kv, tetramerisation)
5F19C7.6F19C7.6n/achrIV 4,595,282
6F44A6.4F44A6.4n/achrX 10,214,952contains similarity to Salmonella typhi Anaerobic sulfite reductase subunit A (EC 1.8.2.-).; TR:Q8Z4M7
7F59F5.7F59F5.7n/achrX 10,563,070contains similarity to Interpro domain IPR006609 (Region of unknown function DM13, Skeletor)
8lgc-12R13A5.4n/achrIII 7,563,273C. elegans LGC-12 protein; contains similarity to Pfam domains PF02931 (Neurotransmitter-gated ion-channel ligand binding domain) , PF02932 (Neurotransmitter-gated ion-channel transmembrane region) contains similarity to Interpro domains IPR002394 (Nicotinic acetylcholine receptor, N-terminal), IPR006201 (Neurotransmitter-gated ion-channel), IPR006202 (Neurotransmitter-gated ion-channel ligand-binding), IPR006029 (Neurotransmitter-gated ion-channel transmembrane region)
9C43D7.4C43D7.4n/achrV 19,322,158contains similarity to Saccharomyces cerevisiae Protein of unknown function, rich in asparagine residues; SGD:YDL167C
10C13F10.4C13F10.4n/achrV 7,210,243contains similarity to Pfam domain PF02985 HEAT repeat contains similarity to Interpro domain IPR016024 (Armadillo-type fold)
11unc-31ZK897.1n/achrIV 12,780,334unc-31 encodes a pleckstrin homology (PH) domain-containing protein that is the C. elegans ortholog of human CADPS/CAPS (calcium-dependent activator protein for secretion OMIM:604667); UNC-31 functions in post-docking calcium-regulated dense-core vesicle fusion that is required for egg laying, locomotion, pharyngeal pumping, and recovery from the dauer larval stage; in addition, UNC-31 functions in the insulin receptor signaling pathway that regulates adult life span where it may control Ca[2+]-regulated secretion of an insulin-like ligand; UNC-31 is not required for synaptic vesicle exocytosis; unc-31::gfp transcriptional reporters are expressed in most, if not all, neurons, vulval muscles, vulval cells, the spermatheca, and secretory cells such as the uterine UV1 cells; UNC-31::GFP translational fusions localize to neuronal cell bodies, axonal projections and to sites of synaptic contact, consistent with other dense-core vesicle proteins.
12dhp-2C47E12.8n/achrIV 9,979,451The dhp-2 gene encodes an ortholog of the human gene DIHYDROPYRIMIDINASE (DPYS), which when mutated leads to dihydropyrimidinuria (OMIM:222748).
13ugt-14H23N18.2n/achrV 4,907,256C. elegans UGT-14 protein; contains similarity to Pfam domain PF00201 UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase contains similarity to Interpro domain IPR002213 (UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase)
14mab-10R166.1n/achrII 10,532,058C. elegans MAB-10 protein; contains similarity to Pfam domains PF04905 (NAB conserved region 2 (NCD2)) , PF04904 (NAB conserved region 1 (NCD1)) contains similarity to Interpro domains IPR010993 (Sterile alpha motif homology), IPR006988 (Nab, N-terminal), IPR006989 (Nab, central region)
15clec-29T25E12.9n/achrV 16,738,407C. elegans CLEC-29 protein; contains similarity to Pfam domain PF00059 Lectin C-type domain contains similarity to Interpro domains IPR003990 (Pancreatitis-associated protein), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
16F21H12.6F21H12.6n/achrII 6,095,139F21H12.6 encodes the C. elegans tripeptidyl peptidase II ortholog; loss of F21H12.6 activity via RNAi indicates that the product of F21H12.6 promotes fat formation; an F21H12.6::GFP reporter fusion is expressed in the intestine, the site of fat storage, and in a subset of nerve ring neurons.
17T28F3.9T28F3.9n/achrIV 17,310,065contains similarity to Pfam domain PF02485 Core-2/I-Branching enzyme contains similarity to Interpro domain IPR003406 (Glycosyl transferase, family 14)
18ubh-1F46E10.8n/achrV 6,510,664ubh-1 encodes a putative ubiquitin C-terminal hydrolase orthologous to human UCHL1 (OMIM:191342, mutated in Parkinson disease).
19gcy-8C49H3.1n/achrIV 7,930,918gcy-8 encodes a receptor-type guanylyl cyclase that, along with gcy-18 and gcy-23, constitutes a subfamily of guanylyl cyclase genes in C. elegans; gcy-8 functions redundantly with gcy-18 and gcy-23, and upstream of tax-4, to regulate thermotaxis via the AFD thermosensory neurons, although of the three guanylyl cyclases required, genetic analyses suggest that GCY-18 is the primary guanylyl cyclase required; GCY-8 is expressed exclusively in the AFD thermosensory neurons where it localizes to sensory endings; GCY-8 expression in the AFD neurons requires activity of the TAX-2/4 cyclic nucleotide gated channel and the CMK-1 Ca2+/calmodulin-dependent protein kinase I, while maintenance of GCY-8 expression requires the OTD/OTX homeodomain protein TTX-1.
20C30F12.2C30F12.2n/achrI 6,969,030contains similarity to Pfam domain PF03969 AFG1-like ATPase contains similarity to Interpro domains IPR005654 (AFG1-like ATPase), IPR003593 (AAA+ ATPase, core)
21F46G10.4F46G10.4n/achrX 13,335,352contains similarity to Pfam domain PF01764 Lipase (class 3) contains similarity to Interpro domain IPR002921 (Lipase, class 3)
22srw-88T06G6.7n/achrI 12,721,084C. elegans SRW-88 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
23glr-4C06A8.9n/achrII 7,789,680glr-4 encodes a putative non-NMDA ionotropic glutamate receptor subunit, most closely related to GLR-3 and less so to GLR-7, possibly of the kainate subfamily; glr-4 is expressed in various sensory neurons and interneurons from embyrogenesis onward; glr-4 expression requires UNC-42, as well as CFI-1 in URA cells.
24C02G6.1C02G6.1n/achrV 5,878,092contains similarity to Pfam domains PF00675 (Insulinase (Peptidase family M16)) , PF05193 (Peptidase M16 inactive domain) (2)contains similarity to Interpro domains IPR001431 (Peptidase M16, zinc-binding site), IPR011765 (Peptidase M16, N-terminal), IPR011237 (Peptidase M16, core), IPR007863 (Peptidase M16, C-terminal), IPR011249 (Metalloenzyme, LuxS/M16 peptidase-like, metal-binding)
25dcr-1K12H4.8n/achrIII 8,076,021The dcr-1 gene encodes a bidentate ribonuclease that is homologous to E. coli RNAse III; dcr-1 is required both for RNA interference and for synthesis of small developmental RNAs; DCR-1 interacts in vivo with RDE-4, a double-stranded RNA (dsRNA) binding protein required for RNAi that interacts with trigger dsRNAs and may function to deliver dsRNAs to DCR-1 for endonucleolytic processing.
26srh-195R52.7n/achrII 2,115,763C. elegans SRH-195 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
27R09D1.7R09D1.7n/achrII 9,455,937contains similarity to Pfam domain PF00704 Glycosyl hydrolases family 18 contains similarity to Interpro domains IPR011583 (Chitinase II), IPR017853 (Glycoside hydrolase, catalytic core), IPR001223 (Glycoside hydrolase, family 18, catalytic domain), IPR013781 (Glycoside hydrolase, subgroup, catalytic core), IPR001574 (Ribosome-inactivating protein)
28srw-58H24D24.2n/achrV 15,947,853C. elegans SRW-58 protein; contains similarity to Pfam domain PF06976 Protein of unknown function (DUF1300) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR010726 (Protein of unknown function DUF1300), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
29fbxa-111Y102A5C.14n/achrV 16,949,135This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
30srh-27W05H5.4n/achrII 12,449,129C. elegans SRH-27 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
31ZK849.4ZK849.4n/achrI 14,207,136contains similarity to Pfam domain PF01062 Bestrophin contains similarity to Interpro domains IPR000615 (Bestrophin), IPR000694 (Proline-rich region)
32F36D4.2F36D4.2n/achrV 9,401,020contains similarity to Pfam domain PF04099 Sybindin-like family contains similarity to Interpro domains IPR011012 (Longin-like), IPR007233 (Sybindin-like protein)
33hlh-15C43H6.8n/achrX 2,413,123C. elegans HLH-15 protein; contains similarity to Pfam domain PF00010 Helix-loop-helix DNA-binding domain contains similarity to Interpro domains IPR001092 (Basic helix-loop-helix dimerisation region bHLH), IPR011598 (Helix-loop-helix DNA-binding)
34pink-1EEED8.9n/achrII 5,394,469pink-1 encodes a predicted serine/threonine protein kinase that is most similar to the Drosophila and human PINK1 (PTEN-induced kinase) protein kinases, the latter of which has been implicated in familial forms of Parkinson's disease; although loss of C. elegans pink-1 activity via large-scale RNAi screens results in no obvious abnormalities, studies in Drosophila indicate that Drosophila PINK1 is a mitochondrial protein that genetically interacts with Drosophila parkin and is essential for maintaining mitochondrial function and integrity in several tissues, including flight muscles and dopaminergic neurons.
35ZC376.3ZC376.3n/achrV 14,169,887contains similarity to Pfam domain PF00135 Carboxylesterase contains similarity to Interpro domain IPR002018 (Carboxylesterase, type B)
36K09E3.2K09E3.2n/achrX 17,117,739
37R11F4.3R11F4.3n/achrII 4,071,458contains similarity to Interpro domains IPR000694 (Proline-rich region), IPR016054 (Ly-6 antigen / uPA receptor -like)
38clec-160F09G8.8n/achrIII 8,274,384C. elegans CLEC-160 protein; contains similarity to Pfam domains PF00092 (von Willebrand factor type A domain) , PF00059 (Lectin C-type domain) contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin), IPR002035 (von Willebrand factor, type A)
39F32A11.1F32A11.1n/achrII 13,158,777contains similarity to Interpro domains IPR016071 (Staphylococcal nuclease (SNase-like), OB-fold), IPR006021 (Staphylococcal nuclease (SNase-like))
40B0432.4B0432.4n/achrII 287,664contains similarity to Pfam domain PF00153 Mitochondrial carrier protein contains similarity to Interpro domains IPR001993 (Mitochondrial substrate carrier), IPR002067 (Mitochondrial carrier protein), IPR002030 (Mitochondrial brown fat uncoupling protein), IPR002113 (Adenine nucleotide translocator 1)
41nspb-5F38A5.9n/achrIV 6,599,329C. elegans NSPB-5 protein; contains similarity to Pfam domain PF07312 Protein of unknown function (DUF1459) contains similarity to Interpro domain IPR009924 (Protein of unknown function DUF1459)
42ZK1037.6ZK1037.6n/achrV 15,326,789contains similarity to Pfam domain PF02408 CUB-like domain contains similarity to Interpro domains IPR000859 (CUB), IPR003366 (CUB-like region)
43F53G2.3F53G2.3n/achrII 2,480,856
44F46C5.7F46C5.7n/achrII 8,839,705contains similarity to Homo sapiens Splice isoform 1 of Q8WXQ8 Carboxypeptidase A5 precursor; ENSEMBL:ENSP00000289573
45W07E11.1W07E11.1n/achrX 10,093,967contains similarity to Pfam domains PF04898 (Glutamate synthase central domain) , PF01645 (Conserved region in glutamate synthase) , PF01266 (FAD dependent oxidoreductase) , PF00310 (Glutamine amidotransferases class-II) , PF07992 (Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase) , PF00070 (Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase) , PF01493 (GXGXG motif) contains similarity to Interpro domains IPR013027 (FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase), IPR000583 (Glutamine amidotransferase, class-II), IPR013785 (Aldolase-type TIM barrel), IPR006076 (FAD dependent oxidoreductase), IPR006005 (Glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit 1), IPR000759 (Adrenodoxin reductase), IPR006982 (Glutamate synthase, central-N), IPR002932 (Glutamate synthase, central-C), IPR000103 (Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, class-II), IPR002489 (Glutamate synthase, alpha subunit, C-terminal), IPR012285 (Fumarate reductase, C-terminal), IPR001327 (Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, NAD-binding region), IPR016040 (NAD(P)-binding), IPR012220 (Glutamate synthase, eukaryotic), IPR001100 (Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, class I)
46srv-31T13A10.9n/achrIV 6,270,882C. elegans SRV-31 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR001209 (Ribosomal protein S14), IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
47H41C03.2H41C03.2n/achrII 5,851,169contains similarity to Pfam domain PF01764 Lipase (class 3) contains similarity to Interpro domain IPR002921 (Lipase, class 3)
48ZK1058.9ZK1058.9n/achrIII 3,924,612contains similarity to Borrelia burgdorferi Probable O-sialoglycoprotein endopeptidase (EC 3.4.24.57)s(Glycoprotease).; SW:GCP_BORBU
49F32B4.6F32B4.6n/achrI 11,516,108contains similarity to Pfam domains PF07819 (PGAP1-like protein) , PF00561 (alpha/beta hydrolase fold) contains similarity to Interpro domains IPR000073 (Alpha/beta hydrolase fold-1), IPR012908 (PGAP1-like)
50T25F10.1T25F10.1n/achrV 6,768,591