UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1C06C6.6C06C6.60chrV 15,990,153contains similarity to Pfam domain PF02206 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domain IPR003125 (Protein of unknown function WSN)
2gcy-35T04D3.4n/achrI 13,329,337C. elegans GCY-35 protein; contains similarity to Pfam domains PF07700 (Heme NO binding) , PF07701 (Heme NO binding associated) , PF00211 (Adenylate and Guanylate cyclase catalytic domain) contains similarity to Interpro domains IPR011644 (Haem NO binding), IPR011645 (Haem NO binding associated), IPR001054 (Adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase)
3Y48A6B.1Y48A6B.1n/achrIII 10,993,565contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
4clec-183T20D3.1n/achrIV 9,328,354C. elegans CLEC-183 protein; contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
5ZK721.4ZK721.4n/achrX 8,780,140contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
6E01G4.1E01G4.1n/achrII 13,445,298contains similarity to Interpro domain IPR000195 (RabGAP/TBC)
7F55C7.2F55C7.2n/achrI 4,005,729
8F54C4.4F54C4.4n/achrIII 87,055
9K11H12.4K11H12.4n/achrIV 674,988contains similarity to Pfam domain PF03409 Protein of unknown function (DUF274) contains similarity to Interpro domain IPR005071 (Protein of unknown function DUF274)
10srh-44B0334.7n/achrII 11,516,530C. elegans SRH-44 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
11Y53C10A.5Y53C10A.5n/achrI 12,000,702contains similarity to Interpro domain IPR000608 (Ubiquitin-conjugating enzyme, E2)
12F29A7.3F29A7.3n/achrII 2,753,579contains similarity to Pfam domain PF08277 PAN-like domain contains similarity to Interpro domain IPR006583 (CW)
13Y39E4B.6Y39E4B.6n/achrIII 13,072,610contains similarity to Rattus norvegicus Nucleolar protein NOP5 (Nucleolar protein 5) (Nopp140 associatedsprotein).; SW:NOP5_RAT
14F13H8.9F13H8.9n/achrII 6,280,371contains similarity to Pfam domain PF00266 Aminotransferase class-V contains similarity to Interpro domains IPR016454 (Cysteine desulphurase, NifS), IPR015422 (Pyridoxal phosphate-dependent transferase, major region, subdomain 2), IPR015424 (Pyridoxal phosphate-dependent transferase, major region), IPR000192 (Aminotransferase, class V/Cysteine desulphurase), IPR015421 (Pyridoxal phosphate-dependent transferase, major region, subdomain 1)
15B0041.5B0041.5n/achrI 4,649,524contains similarity to Interpro domain IPR010916 (TonB box, conserved site)
16Y81G3A.4Y81G3A.4n/achrII 13,092,774contains similarity to Guillardia theta 60S acidic ribosomal protein P0.; TR:Q98S65
17W06G6.10W06G6.10n/achrV 16,646,964contains similarity to Escherichia coli O157:H7 C4-type zinc finger protein (TraR family).; TR:Q8X2P7
18C33E10.5C33E10.5n/achrX 17,276,148contains similarity to Interpro domain IPR000173 (Glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase)
19T11F1.3T11F1.3n/achrII 2,955,703
20F22G12.5F22G12.5n/achrI 13,172,567contains similarity to Interpro domain IPR001765 (Carbonic anhydrase)
21srt-2Y45G12C.5n/achrV 2,545,033C. elegans SRT-2 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
22B0336.3B0336.3n/achrIII 5,713,118contains similarity to Pfam domain PF00642 Zinc finger C-x8-C-x5-C-x3-H type (and similar) contains similarity to Interpro domains IPR000571 (Zinc finger, CCCH-type), IPR000694 (Proline-rich region), IPR000504 (RNA recognition motif, RNP-1), IPR012677 (Nucleotide-binding, alpha-beta plait), IPR001984 (Peptidase S16, Lon protease)
23ins-24ZC334.3n/achrI 14,031,394ins-24 encodes an insulin-like peptide of the insulin superfamily of proteins (OMIM:176730, 147440); INS-24 is one of 38 insulin-like peptides in C. elegans, but as loss of INS-24 function via RNA-mediated interference does not result in any abnormalities, the precise role of INS-24 in C. elegans development is not yet clear.
24T24D5.2T24D5.2n/achrX 12,585,041contains similarity to Plasmodium falciparum DNA-directed RNA polymerase beta chain (EC 2.7.7.6).; SW:RPOB_PLAFA
25C32H11.1C32H11.1n/achrIV 12,913,842contains similarity to Pfam domain PF02408 CUB-like domain contains similarity to Interpro domains IPR000859 (CUB), IPR003366 (CUB-like region)
26F18E3.10F18E3.10n/achrV 7,424,056contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
27D2045.7D2045.7n/achrIII 10,480,900contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
28C34F6.9C34F6.9n/achrX 11,220,316contains similarity to Interpro domain IPR001394 (Peptidase C19, ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 2)
29twk-21T01B4.1n/achrX 16,302,750C. elegans TWK-21 protein; contains similarity to Pfam domain PF07885 Ion channel contains similarity to Interpro domains IPR003280 (Potassium channel, two pore-domain), IPR013099 (Ion transport 2), IPR003092 (Potassium channel, two pore-domain, TASK)
30clec-259M162.1n/achrV 19,786,034C. elegans CLEC-259 protein; contains similarity to Pfam domain PF00337 Galactoside-binding lectin contains similarity to Interpro domains IPR001079 (Galectin, galactose-binding lectin), IPR013320 (Concanavalin A-like lectin/glucanase, subgroup), IPR007233 (Sybindin-like protein), IPR008985 (Concanavalin A-like lectin/glucanase)
31far-5F15B9.3n/achrV 12,996,198far-5 encodes a member of a class of fatty acid-and retinol-binding proteins that are known to be secreted by parasitic nematodes and plants; far-5 binds lipid in fluorescence-based assays, however, the precise function of far-5 is not known.
32fbxb-65C43D7.2n/achrV 19,330,120This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins.
33cyp-33B1C25E10.2n/achrV 9,042,479C. elegans CYP-33B1 protein; contains similarity to Pfam domain PF00067 Cytochrome P450 contains similarity to Interpro domains IPR001128 (Cytochrome P450), IPR002401 (Cytochrome P450, E-class, group I)
34str-252C06B3.9n/achrV 13,917,252C. elegans STR-252 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR008365 (Prostanoid receptor), IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
35K04A8.3K04A8.3n/achrV 6,559,849
36nhr-79T26H2.9n/achrV 19,209,750C. elegans NHR-79 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
37F47G9.4F47G9.4n/achrV 11,319,469contains similarity to Pfam domain PF00643 B-box zinc finger contains similarity to Interpro domains IPR001841 (Zinc finger, RING-type), IPR013083 (Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type), IPR000315 (Zinc finger, B-box)
38T21G5.2T21G5.2n/achrI 6,870,894
39Y39E4B.13Y39E4B.13n/achrIII 13,092,265contains similarity to Caulobacter crescentus Localization factor podJL (Polar organelle development protein)s[Contains: Localization factor podJS].; SW:PODJ_CAUCR
40pqn-84Y41C4A.5n/achrIII 11,701,451The protein product of this gene is predicted to contain a glutamine/asparagine (Q/N)-rich ('prion') domain, by the algorithm of Michelitsch and Weissman (as of the WS77 release of WormBase, i.e., in wormpep77).
41C50A2.4C50A2.4n/achrIV 1,160,591contains similarity to Pfam domain PF00178 Ets-domain contains similarity to Interpro domains IPR000418 (Ets), IPR011991 (Winged helix repressor DNA-binding)
42srd-30F07C4.5n/achrV 7,630,532C. elegans SRD-30 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
43sri-21T24A6.4n/achrV 3,550,559C. elegans SRI-21 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
44F55G7.1F55G7.1n/achrX 11,925,643contains similarity to Galleria mellonella Sericin-2 (Silk gum protein 2) (Fragment).; SW:SER2_GALME
45nca-2C27F2.2n/achrIII 4,972,657nca-2 encodes a novel, four-domain alpha1U Ca2+ channel subunit; nca-2 functions redundantly with a paralog, nca-1, to regulate locomotion and the response to specific volatile anesthetics; in regulating these processes, nca-1 and nca-2 function in the same pathway as unc-79, which encodes a conserved novel protein that positively regulates levels of NCA-1 and NCA-2 protein; nca-2::gfp reporters are expressed in the nervous system in a few pharyngeal neurons, many nerve ring interneurons, most ventral nerve motor cord neurons, and in neurons and muscles in the tail; diffuse expression is also seen in vulval muscles and the intestine.
46C16D6.2C16D6.2n/achrX 12,544,267contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR001402 (Prolactin-releasing peptide receptor), IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000405 (Galanin receptor), IPR000611 (Neuropeptide Y receptor), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
47E01B7.1E01B7.1n/achrV 17,926,717contains similarity to Interpro domains IPR001763 (Rhodanese-like), IPR000694 (Proline-rich region)
48bath-47T07H3.1n/achrII 1,603,204C. elegans BATH-47 protein; contains similarity to Pfam domains PF00651 (BTB/POZ domain) (2), PF00917 (MATH domain) (2)contains similarity to Interpro domains IPR008974 (TRAF-like), IPR002083 (MATH), IPR000694 (Proline-rich region), IPR000210 (BTB/POZ-like), IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR013069 (BTB/POZ)
49F58F9.1F58F9.1n/achrIV 6,251,691contains similarity to Pfam domain PF00268 Ribonucleotide reductase, small chain contains similarity to Interpro domains IPR012348 (Ribonucleotide reductase-related), IPR000358 (Ribonucleotide reductase), IPR009078 (Ferritin/ribonucleotide reductase-like)
50lgc-38F11H8.2n/achrIII 7,014,295F11H8.2 encodes an UNC-49-like GABA receptor subunit.