UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1nhr-150C06B8.10chrV 15,480,433C. elegans NHR-150 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
2clec-34T25E12.8n/achrV 16,736,555C. elegans CLEC-34 protein; contains similarity to Pfam domain PF00059 Lectin C-type domain contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
3Y51H1A.7Y51H1A.7n/achrII 13,897,024contains similarity to Interpro domains IPR000637 (HMG-I and HMG-Y, DNA-binding), IPR000783 (RNA polymerase, subunit H/Rpb5 C-terminal)
4fkh-5F26A1.2n/achrIII 4,845,567fkh-5 encodes a member of the forkhead domain transcription factor family.
5F56C3.7F56C3.7n/achrX 1,370,660
6sre-45F54F11.3n/achrII 13,520,326C. elegans SRE-45 protein; contains similarity to Pfam domain PF03125 C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR004151 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor)
7clec-195Y116A8C.21n/achrIV 17,044,558C. elegans CLEC-195 protein; contains similarity to Pfam domain PF08277 PAN-like domain contains similarity to Interpro domains IPR006583 (CW), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
8Y75B8A.11Y75B8A.11n/achrIII 12,188,150contains similarity to Lymnaea stagnalis Neuropeptide Y precursor.; TR:Q9U0S9
9srx-46E02C12.2n/achrV 9,353,867C. elegans SRX-46 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
10srz-96Y68A4A.6n/achrV 17,200,545C. elegans SRZ-96 protein; contains similarity to Interpro domain IPR000418 (Ets)
11nhr-190F48G7.110.001chrV 641,845C. elegans NHR-190 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
12nhr-268K06B4.6n/achrV 15,690,903C. elegans NHR-268 protein
13C40A11.5C40A11.5n/achrII 2,134,686contains similarity to Pfam domain PF00102 Protein-tyrosine phosphatase contains similarity to Interpro domains IPR003595 (Protein-tyrosine phosphatase, catalytic), IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type), IPR000387 (Protein-tyrosine phosphatase)
14srj-38T02B11.5n/achrV 883,302C. elegans SRJ-38 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
15srw-4F37B4.8n/achrV 2,887,985C. elegans SRW-4 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
16B0432.1B0432.1n/achrII 298,462
17Y43F8B.13Y43F8B.13n/achrV 19,459,852contains similarity to Puumala virus Nucleocapsid protein (Fragment).; TR:Q8B3A4
18F20E11.5F20E11.5n/achrV 17,461,590contains similarity to Pfam domain PF03436 Domain of unknown function (DUF281) contains similarity to Interpro domain IPR005098 (Protein of unknown function DUF281)
19F37H8.2F37H8.2n/achrII 11,173,534contains similarity to Saccharomyces cerevisiae Structural maintenance of chromosomes (SMC) protein; SGD:YOL034W
20Y39A1A.17Y39A1A.17n/achrIII 10,688,996contains similarity to Interpro domain IPR001611 (Leucine-rich repeat)
21C03E10.1C03E10.1n/achrV 11,291,855contains similarity to Anopheles quadrimaculatus NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4 (EC 1.6.5.3).; SW:NU4M_ANOQU
22ZK218.4ZK218.4n/achrV 17,100,011contains similarity to Interpro domain IPR000434 (Polycystic kidney disease type 1 protein)
23F52B11.5F52B11.5n/achrIV 14,102,592contains similarity to Clostridium perfringens Hypothetical protein CPE2159.; TR:Q8XIG1
24Y49E10.25Y49E10.25n/achrIII 12,490,261contains similarity to Pfam domain PF01764 Lipase (class 3) contains similarity to Interpro domain IPR002921 (Lipase, class 3)
25C27F2.1C27F2.1n/achrIII 4,989,295contains similarity to Interpro domains IPR011046 (WD40 repeat-like), IPR001680 (WD40 repeat), IPR015943 (WD40/YVTN repeat-like)
26B0198.2B0198.2n/achrX 12,030,645contains similarity to Dictyostelium discoideum Non-receptor tyrosine kinase spore lysis A (EC 2.7.1.112) (Tyrosine-sprotein kinase 1).; SW:KYK1_DICDI
27clec-177E03H12.2n/achrIV 4,987,125C. elegans CLEC-177 protein; contains similarity to Pfam domain PF08277 PAN-like domain contains similarity to Interpro domains IPR006583 (CW), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR001304 (C-type lectin)
28R08C7.11R08C7.11n/achrIV 4,454,848
29tag-263C11E4.3n/achrX 9,590,518C. elegans TAG-263 protein; contains similarity to Pfam domain PF00858 Amiloride-sensitive sodium channel contains similarity to Interpro domain IPR001873 (Na+ channel, amiloride-sensitive)
30F22E5.12F22E5.12n/achrII 2,646,586contains similarity to Pfam domain PF02214 K+ channel tetramerisation domain contains similarity to Interpro domains IPR000210 (BTB/POZ-like), IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR003131 (Potassium channel, voltage dependent, Kv, tetramerisation)
31C17H1.3C17H1.3n/achrI 13,105,263contains similarity to Trichomonas vaginalis G3 Smooth muscle caldesmon, putative.; TR:A2FBI1
32srh-295ZK1037.8n/achrV 15,331,670C. elegans SRH-295 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
33F18H3.1F18H3.1n/achrX 13,520,521contains similarity to Pfam domain PF00622 SPRY domain contains similarity to Interpro domains IPR001870 (B302, (SPRY)-like), IPR003877 (SPla/RYanodine receptor SPRY)
34Y43F8C.13Y43F8C.13n/achrV 19,691,051contains similarity to Pfam domain PF01156 Inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase contains similarity to Interpro domain IPR001910 (Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase)
35srh-18C50B6.5n/achrV 13,319,254C. elegans SRH-18 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
36F54D5.11F54D5.11n/achrII 11,541,574contains similarity to Pfam domain PF02186 TFIIE beta subunit core domain contains similarity to Interpro domains IPR011991 (Winged helix repressor DNA-binding), IPR016656 (Transcription initiation factor IIE, beta subunit), IPR003166 (Transcription factor TFIIE beta subunit, core)
37osm-12Y75B8A.12n/achrIII 12,196,633C. elegans OSM-12 protein; contains similarity to Interpro domain IPR016575 (Bardet-Biedl syndrome 7 protein)
38F58A3.4F58A3.4n/achrX 11,010,149contains similarity to Pfam domain PF00635 MSP (Major sperm protein) domain contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000535 (Major sperm protein)
39C23G10.5C23G10.5n/achrIII 6,191,540contains similarity to Pfam domain PF07735 F-box associated contains similarity to Interpro domain IPR012885 (F-box associated type 2)
40Y37E11B.9Y37E11B.9n/achrIV 3,602,566
41Y7A5A.7Y7A5A.7n/achrX 15,802,663contains similarity to Murine herpesvirus 72 Membrane virion glycoprotein 150.; TR:Q9DYE3
42F43B10.1F43B10.1n/achrX 16,662,035
43nhr-220T19H12.8n/achrV 4,883,423C. elegans NHR-220 protein; contains similarity to Pfam domain PF00105 Zinc finger, C4 type (two domains) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
44F16G10.8F16G10.8n/achrII 2,382,692contains similarity to Pfam domain PF02343 Domain of unknown function DUF130 contains similarity to Interpro domain IPR003326 (Protein of unknown function DUF130)
45ZK512.2ZK512.2n/achrIII 9,143,217contains similarity to Pfam domains PF00270 (DEAD/DEAH box helicase) , PF00271 (Helicase conserved C-terminal domain) contains similarity to Interpro domains IPR011545 (DNA/RNA helicase, DEAD/DEAH box type, N-terminal), IPR000629 (RNA helicase, ATP-dependent, DEAD-box, conserved site), IPR014021 (Helicase, superfamily 1 and 2, ATP-binding), IPR014001 (DEAD-like helicase, N-terminal), IPR001650 (DNA/RNA helicase, C-terminal)
46ZC317.2ZC317.2n/achrV 5,460,748
47C18H7.1C18H7.1n/achrIV 618,237contains similarity to Pfam domain PF00092 von Willebrand factor type A domain contains similarity to Interpro domain IPR002035 (von Willebrand factor, type A)
48K10B4.4K10B4.4n/achrII 124,170contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR002286 (P2 purinoceptor), IPR005390 (Neuromedin U receptor), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
49C01G5.7C01G5.7n/achrIV 6,518,588
50K05G3.2K05G3.2n/achrX 16,497,319