UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1rpb-6C06A1.55e-46chrII 10,579,552C. elegans RPB-6 protein; contains similarity to Pfam domain PF01192 RNA polymerase Rpb6 contains similarity to Interpro domains IPR006110 (RNA polymerase Rpb6), IPR002048 (Calcium-binding EF-hand), IPR006111 (DNA-directed RNA polymerase, 14 to 18 kDa subunit), IPR012293 (RNA polymerase subunit, RPB6/omega)
2C10A4.6C10A4.6n/achrX 7,391,386
3ZK856.4ZK856.4n/achrV 10,183,835contains similarity to Interpro domain IPR011001 (Saposin-like)
4srh-45T03F7.2n/achrV 11,304,292C. elegans SRH-45 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR002259 (Delayed-early response protein/equilibrative nucleoside transporter), IPR008075 (Lipocalin-1 receptor)
5K07D4.2K07D4.2n/achrII 4,045,127
6W05H7.2W05H7.2n/achrX 1,435,503
7W02D7.6W02D7.6n/achrV 8,300,526contains similarity to Pfam domain PF00096 Zinc finger, C2H2 type contains similarity to Interpro domains IPR015880 (Zinc finger, C2H2-like), IPR007087 (Zinc finger, C2H2-type)
8C34E10.8C34E10.8n/achrIII 5,251,598contains similarity to Leishmania major strain Friedlin Proteophosphoglycan 5.; TR:Q4FX62
9B0207.8B0207.8n/achrI 5,951,441
10T05E7.3T05E7.3n/achrI 6,190,389contains similarity to Interpro domain IPR000463 (Cytosolic fatty-acid binding)
11hex-3Y39A1C.4n/achrIII 10,851,789hex-3 encodes a beta-N-acetylhexosaminidase.
12H37A05.2H37A05.2n/achrV 13,632,011contains similarity to Pfam domains PF02958 (Domain of unknown function (DUF227)) , PF07914 (Protein of unknown function (DUF1679)) contains similarity to Interpro domains IPR011009 (Protein kinase-like), IPR012877 (Protein of unknown function DUF1679, Caenorhabditis species), IPR004119 (Protein of unknown function DUF227), IPR015897 (CHK kinase-like)
13srj-8T28A11.9n/achrV 3,248,476C. elegans SRJ-8 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
14ZC239.16ZC239.16n/achrII 3,225,022contains similarity to Pfam domain PF02214 K+ channel tetramerisation domain contains similarity to Interpro domains IPR000210 (BTB/POZ-like), IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR003131 (Potassium channel, voltage dependent, Kv, tetramerisation)
15srh-215T20B3.3n/achrV 16,831,260C. elegans SRH-215 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR001356 (Homeobox)
16T07E3.3T07E3.3n/achrIII 6,904,401contains similarity to Interpro domain IPR012336 (Thioredoxin-like fold)
17K10C2.2K10C2.2n/achrX 6,433,006contains similarity to Interpro domain IPR000832 (GPCR, family 2, secretin-like)
18adr-2T20H4.4n/achrIII 7,231,956adr-2 encodes an adenosine deaminase that acts on RNA (ADAR); ADARs are RNA-editing enzymes that deaminate adenosines to create inosines in double-stranded RNA (dsRNA); adr-2 is expressed ubiquitously in early embryos, as well as in the germline of early adults; ADR-2 is required for ADAR activity in vivo, and for normal chemotaxis.
19T21C9.4T21C9.4n/achrV 10,578,742contains similarity to Pfam domain PF01133 Enhancer of rudimentary contains similarity to Interpro domain IPR000781 (Enhancer of rudimentary)
20T09F3.4T09F3.4n/achrII 10,396,159T09F3.4 encodes a novel protein.
21F21E9.2F21E9.2n/achrX 1,329,400
22ZK402.5ZK402.5n/achrX 1,399,783contains similarity to Pfam domain PF04435 Domain of unknown function (DUF545) contains similarity to Interpro domain IPR006570 (SPK)
23F21A3.5F21A3.5n/achrV 15,540,560contains similarity to Pfam domain PF01966 HD domain contains similarity to Interpro domains IPR002048 (Calcium-binding EF-hand), IPR000209 (Peptidase S8 and S53, subtilisin, kexin, sedolisin), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR006674 (Metal-dependent phosphohydrolase, HD region, subdomain)
24sra-25T26E3.9n/achrI 12,687,150C. elegans SRA-25 protein; contains similarity to Pfam domain PF02117 C.elegans Sra family integral membrane protein contains similarity to Interpro domains IPR003945 (NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5), IPR000344 (Nematode chemoreceptor, Sra)
25C06A8.2C06A8.2n/achrII 7,780,233contains similarity to Homo sapiens snRNA-activating protein complex subunit 1; ENSEMBL:ENSP00000216294
26F54D10.4F54D10.4n/achrII 3,806,515
27C27D8.4C27D8.4n/achrIV 12,705,410contains similarity to Interpro domains IPR002198 (Short-chain dehydrogenase/reductase SDR), IPR016040 (NAD(P)-binding)
28C33H5.8C33H5.8n/achrIV 7,778,475contains similarity to Pfam domain PF00515 Tetratricopeptide repeat contains similarity to Interpro domains IPR011990 (Tetratricopeptide-like helical), IPR001440 (Tetratricopeptide TPR-1), IPR013026 (Tetratricopeptide region)
29D1046.3D1046.3n/achrIV 8,931,564contains similarity to Pfam domain PF00153 Mitochondrial carrier protein contains similarity to Interpro domains IPR002067 (Mitochondrial carrier protein), IPR001993 (Mitochondrial substrate carrier)
30F54D11.3F54D11.3n/achrV 4,636,257
31srh-123F08E10.3n/achrV 17,474,702C. elegans SRH-123 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
32F48A11.2F48A11.2n/achrII 198,605
33srx-1F59E11.1n/achrV 9,004,313C. elegans SRX-1 protein; contains similarity to Interpro domains IPR000366 (Fungal pheromone mating factor STE2 GPCR), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
34Y54G11A.1Y54G11A.1n/achrII 14,262,654contains similarity to Mesocricetus auratus Nucleolin (Protein C23).; SW:NUCL_MESAU
35sre-29F57G9.4n/achrII 12,400,560C. elegans SRE-29 protein; contains similarity to Pfam domain PF03125 C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR004151 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor)
36R08F11.1R08F11.1n/achrV 3,781,014contains similarity to Pfam domain PF04685 Protein of unknown function, DUF608 contains similarity to Interpro domains IPR006775 (Protein of unknown function DUF608), IPR014551 (Beta-glucosidase, GBA2 type), IPR008928 (Six-hairpin glycosidase-like)
37Y116A8C.8Y116A8C.8n/achrIV 16,932,518contains similarity to Interpro domain IPR001283 (Allergen V5/Tpx-1 related)
38srd-50F15A2.4n/achrX 13,480,135C. elegans SRD-50 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
39ZC513.5ZC513.5n/achrV 8,037,288contains similarity to Pfam domain PF03901 Alg9-like mannosyltransferase family contains similarity to Interpro domain IPR005599 (Alg9-like mannosyltransferase)
40T09B4.2T09B4.2n/achrI 6,184,694
41pfd-6F21C3.5n/achrI 7,283,387pfd-6 encodes a putative prefoldin 6 subunit, orthologous to human PFDN6 (OMIM:605660), required for normal microtubule growth and distal tip cell migration; PFD-6 is expressed cytoplasmically in most, if not all, tissues, including the germline; in mass RNAi assays, PFD-6 is required for normal mitotic spindle position, embryonic and larval viability, fertility, body shape, vulval development, and locomotion, and for normally rapid growth; pfd-6(RNAi) embryos show a reduced microtubule growth rate.
42srd-17Y2H9A.2n/achrV 13,431,663C. elegans SRD-17 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
43F55B11.3F55B11.3n/achrIV 14,425,099contains similarity to Lactococcus lactis Unknown protein.; TR:Q9CF31
44nhr-33ZK455.6n/achrX 11,319,573C. elegans NHR-33 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
45srab-2C04F5.5n/achrV 5,104,023C. elegans SRAB-2 protein; contains similarity to Pfam domain PF02175 C.elegans integral membrane protein Srb contains similarity to Interpro domains IPR001005 (SANT, DNA-binding), IPR002184 (Serpentine beta receptor), IPR007087 (Zinc finger, C2H2-type)
46F46C3.2F46C3.2n/achrX 11,417,473contains similarity to Interpro domain IPR016196 (MFS general substrate transporter)
47btb-13ZC204.11n/achrII 1,654,256C. elegans BTB-13 protein; contains similarity to Pfam domain PF00651 BTB/POZ domain contains similarity to Interpro domains IPR000209 (Peptidase S8 and S53, subtilisin, kexin, sedolisin), IPR000210 (BTB/POZ-like), IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR013069 (BTB/POZ)
48F38H4.10F38H4.10n/achrIV 11,861,497contains similarity to Pfam domain PF03637 Mob1/phocein family contains similarity to Interpro domain IPR005301 (Mob1/phocein)
49hap-1ZC395.7n/achrIII 5,264,428C. elegans HAP-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF01725 Ham1 family contains similarity to Interpro domain IPR002637 (Ham1-like protein)
50F41G4.1F41G4.1n/achrX 16,841,928contains similarity to Strongylocentrotus purpuratus 33 kDa inner dynein arm light chain, axonemal (p33).; SW:Q26630