UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1C05E4.7C05E4.73e-65chrV 742,319
2nhr-178F16B4.9n/achrV 1,605,896C. elegans NHR-178 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
3C32A9.1C32A9.1n/achrX 10,259,366contains similarity to Plasmodium falciparum Hypothetical protein, conserved.; TR:Q8IEA2
4C52D10.3C52D10.3n/achrIV 17,179,526contains similarity to Pelobacter propionicus DSM 2379 Hypothetical protein precursor.; TR:Q3FZT0
5srh-77DC2.6n/achrV 224,988C. elegans SRH-77 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
6F09E10.6F09E10.6n/achrX 1,496,339
7his-4T10C6.11n/achrV 16,040,303his-4 encodes an H2B histone.
8str-205C02E7.9n/achrV 4,929,096C. elegans STR-205 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
9str-61F14F8.1n/achrV 16,670,286C. elegans STR-61 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
10sptf-3Y40B1A.4n/achrI 13,362,400C. elegans SPTF-3 protein; contains similarity to Pfam domain PF00096 Zinc finger, C2H2 type contains similarity to Interpro domains IPR015880 (Zinc finger, C2H2-like), IPR007086 (Zinc finger, C2H2-subtype), IPR013087 (Zinc finger, C2H2-type/integrase, DNA-binding), IPR003656 (Zinc finger, BED-type predicted), IPR007087 (Zinc finger, C2H2-type)
11C02H6.1C02H6.1n/achrV 7,389,111contains similarity to Pfam domain PF01762 Galactosyltransferase contains similarity to Interpro domain IPR002659 (Glycosyl transferase, family 31)
12srg-59C24B9.7n/achrV 2,724,113C. elegans SRG-59 protein; contains similarity to Interpro domain IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
13srh-97F49H6.4n/achrV 17,018,412C. elegans SRH-97 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
14Y48E1B.7Y48E1B.7n/achrII 13,580,236Y48E1B.7 encodes a C2H2-type zinc-finger protein required for embryonic development and fertility; Y48E1B.7 transcript levels are diminished by ERI-1, RDE-3, and RRF-2, perhaps through endogenous RNAi; Y48E1B.7 is paralogous to MCD-1, but has no obvious non-nematode orthologs; Y48E1B.7 contains a single central zinc-finger and a C-terminal low-complexity region, but no other recognizable protein domains.
15srb-18C54F6.7n/achrV 7,516,266C. elegans SRB-18 protein; contains similarity to Pfam domain PF02117 C.elegans Sra family integral membrane protein contains similarity to Interpro domains IPR002184 (Serpentine beta receptor), IPR000344 (Nematode chemoreceptor, Sra)
16C17B7.7C17B7.7n/achrV 3,326,895contains similarity to Pfam domain PF06869 Protein of unknown function (DUF1258) contains similarity to Interpro domain IPR009667 (Protein of unknown function DUF1258)
17clec-165F38A1.10n/achrIV 1,246,135C. elegans CLEC-165 protein; contains similarity to Pfam domain PF00059 Lectin C-type domain contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR001680 (WD40 repeat), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
18C28G1.4C28G1.4n/achrX 8,851,319contains similarity to Interpro domains IPR015880 (Zinc finger, C2H2-like), IPR007087 (Zinc finger, C2H2-type)
19F58E1.7F58E1.7n/achrII 1,678,353contains similarity to Pfam domain PF01030 Receptor L domain contains similarity to Interpro domain IPR000494 (EGF receptor, L domain)
20srj-9T20C4.1n/achrV 3,432,956C. elegans SRJ-9 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
21W08F4.1W08F4.1n/achrII 593,688
22ZK218.1ZK218.1n/achrV 17,092,954contains similarity to Pfam domain PF01549 ShK domain-like contains similarity to Interpro domain IPR003582 (Metridin-like ShK toxin)
23str-246W09D6.3n/achrIII 11,078,457C. elegans STR-246 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
24T11F9.13T11F9.13n/achrV 11,482,664contains similarity to Thermotoga maritima ATP-dependent CLP protease, ATPase subunit.; TR:Q9WY41
25R53.2R53.2n/achrII 9,964,971contains similarity to Pfam domain PF02223 Thymidylate kinase contains similarity to Interpro domain IPR000062 (Thymidylate kinase)
26C48C5.3C48C5.3n/achrX 8,959,409contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
27C50F2.4C50F2.4n/achrI 3,890,325
28R07E5.11R07E5.11n/achrIII 4,415,004contains similarity to Salmonella typhimurium Putative surface-exposed virulence protein bigA precursor.; SW:BIGA_SALTY
29W01H2.2W01H2.2n/achrX 4,218,344
30B0207.6B0207.6n/achrI 5,936,242contains similarity to Pfam domain PF03029 Conserved hypothetical ATP binding protein contains similarity to Interpro domain IPR004130 (Protein of unknown function, ATP binding)
31sptf-2T22C8.5n/achrII 8,626,542C. elegans SPTF-2 protein; contains similarity to Pfam domain PF00096 Zinc finger, C2H2 type contains similarity to Interpro domains IPR015880 (Zinc finger, C2H2-like), IPR013087 (Zinc finger, C2H2-type/integrase, DNA-binding), IPR003656 (Zinc finger, BED-type predicted), IPR007087 (Zinc finger, C2H2-type)
32srh-245F31F4.9n/achrV 655,327C. elegans SRH-245 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
33K08D10.11K08D10.11n/achrIV 4,185,528
34Y47D3B.4Y47D3B.4n/achrIII 11,407,290contains similarity to Pfam domain PF01697 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domain IPR008166 (Protein of unknown function DUF23)
35F47B10.9F47B10.9n/achrX 10,913,178contains similarity to Interpro domains IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR013089 (Kelch related)
36ptr-13K07C10.1n/achrII 11,159,735ptr-13 encodes a nematode-specific member of the sterol sensing domain (SSD) proteins, distantly paralogous to Drosophila PATCHED (PTC) and human PTCH (OMIM:601309, mutated in basal cell nevus syndrome); PTR-13 is weakly required for normal molting from L4 to adult stages; PTR-13 is also required for normal growth to full size and locomotion.
37srw-94H06H21.1n/achrIV 4,815,890C. elegans SRW-94 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
38Y63D3A.4Y63D3A.4n/achrI 14,099,306contains similarity to Pfam domain PF03372 Endonuclease/Exonuclease/phosphatase family contains similarity to Interpro domains IPR005637 (TAP, C-terminal), IPR009060 (UBA-like), IPR005135 (Endonuclease/exonuclease/phosphatase)
39R07E5.15R07E5.15n/achrIII 4,401,952
40nhr-262F09C6.8n/achrV 16,906,069C. elegans NHR-262 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
41sre-8F40G12.1n/achrV 14,258,150C. elegans SRE-8 protein; contains similarity to Pfam domain PF03125 C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR004151 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor)
42F44E5.2F44E5.2n/achrII 11,770,321contains similarity to Pfam domain PF00560 Leucine Rich Repeat
43sri-9Y102A5C.29n/achrV 17,002,496C. elegans SRI-9 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR000565 (DNA topoisomerase, type IIA, subunit B)
44srx-119F49C5.1n/achrII 12,528,893C. elegans SRX-119 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
45srh-247C31B8.13n/achrV 2,933,658C. elegans SRH-247 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
46F31F4.1F31F4.1n/achrV 685,113contains similarity to Pfam domain PF03314 Protein of unknown function, DUF273 contains similarity to Interpro domain IPR004988 (Protein of unknown function DUF273)
47C30E1.8C30E1.8n/achrX 16,917,982contains similarity to Pfam domain PF03409 Protein of unknown function (DUF274) contains similarity to Interpro domain IPR005071 (Protein of unknown function DUF274)
48tmbi-4B0563.4n/achrX 9,155,606C. elegans TMBI-4 protein; contains similarity to Pfam domain PF01027 Uncharacterised protein family UPF0005 contains similarity to Interpro domain IPR006214 (Protein of unknown function UPF0005)
49bath-23Y49F6C.5n/achrII 3,371,722C. elegans BATH-23 protein; contains similarity to Pfam domains PF00651 (BTB/POZ domain) , PF00917 (MATH domain) contains similarity to Interpro domains IPR002083 (MATH), IPR000210 (BTB/POZ-like), IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR013069 (BTB/POZ)
50Y44A6D.1Y44A6D.1n/achrV 20,782,907contains similarity to Escherichia coli TraT.; TR:Q7WUD7