UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1srsx-18C04E6.23e-163chrV 5,923,404C. elegans SRSX-18 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
2scl-4C39E9.1n/achrIV 13,062,457C. elegans SCL-4 protein; contains similarity to Pfam domain PF00188 SCP-like extracellular protein contains similarity to Interpro domains IPR014044 (SCP-like extracellular), IPR002413 (Ves allergen), IPR001283 (Allergen V5/Tpx-1 related), IPR000480 (Glutelin)
3nhr-288Y51A2B.3n/achrV 18,381,620C. elegans NHR-288 protein; contains similarity to Pfam domain PF00104 Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
4K07D4.5K07D4.5n/achrII 4,022,169
5srw-109ZK488.9n/achrV 607,863C. elegans SRW-109 protein; contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR008075 (Lipocalin-1 receptor)
6F29A7.4F29A7.4n/achrII 2,750,080contains similarity to Homo sapiens Uncharacterized protein C2orf32; ENSEMBL:ENSP00000263655
7R11A5.6R11A5.6n/achrI 7,867,741contains similarity to Rattus norvegicus Aa2-141.; TR:Q7TP81
8srh-241F37B4.6n/achrV 2,868,696C. elegans SRH-241 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR000215 (Protease inhibitor I4, serpin)
9sre-30F57G9.2n/achrII 12,405,637C. elegans SRE-30 protein; contains similarity to Pfam domain PF03125 C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR004151 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor)
10srj-19Y45G12C.14n/achrV 2,569,809C. elegans SRJ-19 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
11gei-14K01C8.5n/achrII 8,274,744gei-14 encodes a novel protein that interacts with GEX-3 in yeast two-hybrid assays.
12srh-219C06B8.6n/achrV 15,496,906C. elegans SRH-219 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
13B0507.9B0507.9n/achrV 8,765,471
14clec-39T25E12.7n/achrV 16,740,408C. elegans CLEC-39 protein; contains similarity to Pfam domain PF00059 Lectin C-type domain contains similarity to Interpro domains IPR003990 (Pancreatitis-associated protein), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
15sri-14M01G12.1n/achrI 12,135,356C. elegans SRI-14 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
16gld-1T23G11.3n/achrI 7,696,949gld-1 encodes a protein containing a K homology RNA binding domain that is required for meiotic cell cycle progression during oogenesis in parallel with gld-2, and also affects spermatogenesis; it physically interacts with its putative mRNA targets in vitro and with FOG-2, and is expressed in the cytoplasm at high levels during meiotic prophase.
17Y79H2A.2Y79H2A.2n/achrIII 12,029,742contains similarity to Interpro domain IPR003091 (Voltage-dependent potassium channel)
18srt-36F47D2.5n/achrV 4,267,330C. elegans SRT-36 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domains IPR002651 (Protein of unknown function DUF32), IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
19ZK20.1ZK20.1n/achrII 11,647,844contains similarity to Interpro domain IPR001124 (Lipid-binding serum glycoprotein)
20clec-240F49H6.1n/achrV 17,011,082C. elegans CLEC-240 protein; contains similarity to Pfam domain PF00059 Lectin C-type domain contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
21fbxa-134F47H4.11n/achrV 17,351,442C. elegans FBXA-134 protein; contains similarity to Pfam domain PF01827 FTH domain contains similarity to Interpro domain IPR002900 (Protein of unknown function DUF38, Caenorhabditis species)
22srbc-22C45H4.8n/achrV 2,157,702C. elegans SRBC-22 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
23lgc-32T19D7.1n/achrX 674,438C. elegans LGC-32 protein; contains similarity to Interpro domain IPR006202 (Neurotransmitter-gated ion-channel ligand-binding)
24C13B9.2C13B9.2n/achrIII 6,621,178contains similarity to Pfam domain PF05161 MOFRL family contains similarity to Interpro domain IPR007835 (MOFRL)
25math-10C16C4.15n/achrII 1,872,348C. elegans MATH-10 protein; contains similarity to Pfam domain PF00917 MATH domain contains similarity to Interpro domains IPR008974 (TRAF-like), IPR002083 (MATH)
26srd-73Y45G12C.7n/achrV 2,528,611C. elegans SRD-73 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
27F44D12.7F44D12.7n/achrIV 10,035,774contains similarity to Pfam domain PF00635 MSP (Major sperm protein) domain contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000535 (Major sperm protein)
28T04G9.6T04G9.6n/achrX 783,076contains similarity to Interpro domain IPR001759 (Pentaxin)
29srw-44F14F8.6n/achrV 16,681,440C. elegans SRW-44 protein; contains similarity to Pfam domain PF06976 Protein of unknown function (DUF1300) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR010726 (Protein of unknown function DUF1300), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
30T28A11.18T28A11.18n/achrV 3,267,438contains similarity to Pfam domain PF01579 Domain of unknown function DUF19 contains similarity to Interpro domains IPR016638 (Uncharacterised conserved protein UPF0376), IPR002542 (Protein of unknown function DUF19)
31pik-1K09B11.1n/achrIV 13,419,126The pik-1 gene encodes a pelle/IRAK kinase homolog that may be involved in apoptosis.
32srg-30W02F12.7n/achrV 6,717,559C. elegans SRG-30 protein; contains similarity to Pfam domain PF02118 C.elegans Srg family integral membrane protein contains similarity to Interpro domain IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
33F56A11.4F56A11.4n/achrIV 550,691contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
34ZK643.7ZK643.7n/achrIII 8,925,977
35F26A1.14F26A1.14n/achrIII 4,849,521contains similarity to Interpro domains IPR003593 (AAA+ ATPase, core), IPR008431 (Cyclic nucleotide phosphodiesterase)
36srbc-25F40D4.6n/achrV 17,174,753C. elegans SRBC-25 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
37T02G6.1T02G6.1n/achrI 11,796,907contains similarity to Plasmodium falciparum Hypothetical protein.; TR:Q8I4U4
38srz-54Y102A5C.25n/achrV 16,981,243C. elegans SRZ-54 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
39str-145F58G4.7n/achrV 8,097,583C. elegans STR-145 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
40C46G7.3C46G7.3n/achrIV 6,007,411contains similarity to Interpro domain IPR001878 (Zinc finger, CCHC-type)
41ceh-27F46F3.1n/achrV 11,663,161ceh-27 encodes a homeodomain protein of the NK-2 class that contains Drosophila scarecrow and human NKX-2 (OMIM:606727); CEH-27 activity is essential for embryogenesis and appears to be required for maintaining hypodermal integrity during movement as embryos lacking CEH-27 burst at a breach in the ventral hypodermis upon commencement of muscle contractions; CEH-27 expression is first detected in the ~100-cell embryo in what appear to be MS-derived cells while in later embryos expression is seen in a number of cells in the anterior head region.
42srh-69T21B4.7n/achrII 12,514,088C. elegans SRH-69 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
43srh-180F57G8.1n/achrV 16,318,159C. elegans SRH-180 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
44srd-69H04J21.2n/achrIII 2,364,601C. elegans SRD-69 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
45srj-6F31F4.8n/achrV 653,904C. elegans SRJ-6 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
46C25D7.9C25D7.9n/achrV 15,065,202
47sra-23T06G6.1n/achrI 12,704,070C. elegans SRA-23 protein; contains similarity to Pfam domain PF02117 C.elegans Sra family integral membrane protein contains similarity to Interpro domain IPR000344 (Nematode chemoreceptor, Sra)
48daf-10F23B2.4n/achrIV 9,141,552daf-10 encodes a WD- and WAA-repeat containing protein that is the C. elegans ortholog of intraflagellar transport (IFT) complex A component IFT122; daf-10 activity is required for intraflagellar transport and thus for proper development of amphid and phasmid neurons, dauer development, chemotaxis, and normal lifespan; a DAF-10::GFP fusion protein undergoes both anterograde and retrograde intraflagellar transport in amphid or phasmid sensory neurons.
49str-123T22H6.4n/achrX 12,790,964C. elegans STR-123 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
50W06B3.1W06B3.1n/achrX 12,015,209contains similarity to Pfam domain PF01467 Cytidylyltransferase contains similarity to Interpro domains IPR004821 (Cytidyltransferase-related), IPR005248 (Probable nicotinate-nucleotide adenylyltransferase), IPR014729 (Rossmann-like alpha/beta/alpha sandwich fold), IPR004820 (Cytidylyltransferase)