UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1C03A7.2C03A7.28e-178chrV 5,182,798
2F55C5.1F55C5.1n/achrV 12,263,644contains similarity to Pfam domain PF00635 MSP (Major sperm protein) domain contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000535 (Major sperm protein)
3str-77W06D12.4n/achrV 17,720,087C. elegans STR-77 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
4sri-57F22E5.16n/achrII 2,671,336C. elegans SRI-57 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR000175 (Sodium:neurotransmitter symporter), IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
5sru-30C50C10.3n/achrV 9,814,394C. elegans SRU-30 protein; contains similarity to Pfam domain PF02688 Domain of unknown function DUF215 contains similarity to Interpro domain IPR003839 (Protein of unknown function DUF215)
6srx-116W05B10.5n/achrV 12,671,795C. elegans SRX-116 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
7srx-118T21B4.12n/achrII 12,526,763C. elegans SRX-118 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
8srh-248H05B21.2n/achrV 2,954,922C. elegans SRH-248 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR000215 (Protease inhibitor I4, serpin)
9srsx-24C03G6.16n/achrV 7,378,672C. elegans SRSX-24 protein; contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
10Y38H6C.4Y38H6C.4n/achrV 20,500,386contains similarity to Mus musculus Similar to hypothetical protein FLJ21522 (Epidermal growth factorsreceptor pathway substrate 8 related protein 3).; TR:Q91WL0
11srw-103ZK697.5n/achrV 1,718,354C. elegans SRW-103 protein; contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
12C50C3.7C50C3.7n/achrIII 8,160,210contains similarity to Pfam domain PF03372 Endonuclease/Exonuclease/phosphatase family contains similarity to Interpro domains IPR000300 (Inositol polyphosphate related phosphatase), IPR005135 (Endonuclease/exonuclease/phosphatase)
13dmd-3Y43F8C.10n/achrV 19,652,807C. elegans DMD-3 protein; contains similarity to Pfam domain PF00751 DM DNA binding domain contains similarity to Interpro domain IPR001275 (DM DNA-binding)
14F56H6.12F56H6.12n/achrI 12,313,605contains similarity to Pfam domain PF01757 Acyltransferase family contains similarity to Interpro domain IPR002656 (Acyltransferase 3)
15spp-19K04A8.9n/achrV 6,559,648C. elegans SPP-19 protein; contains similarity to Interpro domains IPR011001 (Saposin-like), IPR008139 (Saposin B)
16Y38H6A.3Y38H6A.3n/achrV 20,342,053contains similarity to Interpro domain IPR006150 (Cysteine-rich repeat)
17nhr-250ZK488.1n/achrV 613,820C. elegans NHR-250 protein; contains similarity to Pfam domain PF00105 Zinc finger, C4 type (two domains) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
18amt-3M195.3n/achrII 8,366,108amt-3 encodes one of four C. elegans homologs of AMT1 (AT11_ARATH), a high-affinity ammonium transporter from Arabidopsis thaliana; AMT-3 is closely similar to its paralog AMT-2, with somewhat more distant paralogy to AMT-1 and AMT-4.
19F38C2.1F38C2.1n/achrIV 16,249,570contains similarity to Carnobacterium piscicola ATP-dependent translocator.; TR:Q46317
20C01G6.9C01G6.9n/achrII 9,294,851contains similarity to Plasmodium falciparum SET-domain protein, putative.; TR:Q8IC77
21Y37D8A.3Y37D8A.3n/achrIII 12,833,196contains similarity to Methanosarcina mazei Conserved protein.; TR:Q8Q0P1
22C55A1.1C55A1.1n/achrV 15,622,421contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
23srg-61C24B9.11n/achrV 2,739,518C. elegans SRG-61 protein; contains similarity to Interpro domains IPR000175 (Sodium:neurotransmitter symporter), IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
24T06G6.5T06G6.5n/achrI 12,716,111contains similarity to Interpro domain IPR007087 (Zn-finger, C2H2 type)
25W06D12.1W06D12.1n/achrV 17,736,716contains similarity to Pfam domain PF00100 Zona pellucida-like domain contains similarity to Interpro domain IPR001507 (Endoglin/CD105 antigen)
26C09F5.1C09F5.1n/achrIII 660,714
27fbxa-37ZC47.14n/achrIII 1,286,023This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
28T07D3.6T07D3.6n/achrII 881,565contains similarity to Pfam domain PF06828 Fukutin-related contains similarity to Interpro domain IPR009644 (Fukutin-related)
29C23H5.7C23H5.7n/achrIV 2,107,829contains similarity to Pfam domains PF00027 (Cyclic nucleotide-binding domain) , PF00520 (Ion transport protein) contains similarity to Interpro domains IPR005821 (Ion transport), IPR000595 (Cyclic nucleotide-binding), IPR014710 (RmlC-like jelly roll fold)
30str-209F26G5.5n/achrV 4,949,965C. elegans STR-209 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
31srh-116Y61B8A.1n/achrV 17,253,997C. elegans SRH-116 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
32T07F10.6T07F10.6n/achrV 12,865,830contains similarity to Pfam domain PF06879 Protein of unknown function (DUF1261) contains similarity to Interpro domain IPR009673 (Protein of unknown function DUF1261)
33nhr-215T07C5.4n/achrX 12,699,419C. elegans NHR-215 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
34srh-250C49D10.3n/achrII 3,879,253C. elegans SRH-250 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
35W09G12.9W09G12.9n/achrIV 1,217,448
36Y26D4A.3Y26D4A.3n/achrI 13,072,492contains similarity to Pfam domain PF00059 (Lectin C-type domain short and long forms)
37ugt-20K08B4.4n/achrIV 6,082,263C. elegans UGT-20 protein; contains similarity to Pfam domains PF04101 (Glycosyltransferase family 28 C-terminal domain) , PF00201 (UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase) contains similarity to Interpro domains IPR002213 (UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase), IPR007235 (Glycosyl transferase, family 28, C-terminal)
38lips-1F45E6.4n/achrX 12,494,285C. elegans LIPS-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF01674 Lipase (class 2) contains similarity to Interpro domain IPR002918 (Lipase, class 2)
39C47D12.8C47D12.8n/achrII 11,700,677C47D12.8 encodes an ortholog of the DNA repair protein XPF/ERCC4, which when mutated in humans leads to xeroderma pigmentosum (complementation group F; OMIM:133520); C47D12.8(RNAi) animals are hypersensitive to ultraviolet radiation, with increased germ cell apoptosis and embryonic lethality; C47D12.8 protein interacts with F10G8.7 (an ERCC1 ortholog) in yeast two-hybrid assays; C47D12.8 is expressed broadly in both embryonic and postembryonic animals, and is required for embryonic development; C47D12.8 is upregulated in dauers, and shares an operon with kel-1 and VF13D12L.3.
40pdhk-2ZK370.5n/achrIII 8,739,634C. elegans PDHK-2 protein; contains similarity to Pfam domain PF02518 Histidine kinase-, DNA gyrase B-, and HSP90-like ATPase contains similarity to Interpro domains IPR005467 (Signal transduction histidine kinase, core), IPR004358 (Signal transduction histidine kinase-related protein, C-terminal), IPR003594 (ATP-binding region, ATPase-like)
41Y17D7C.1Y17D7C.1n/achrV 18,709,792contains similarity to Trypanosoma brucei Hypothetical protein.; TR:Q7YVJ9
42Y54E2A.8Y54E2A.8n/achrII 14,780,444contains similarity to Interpro domains IPR000694 (Proline-rich region), IPR003882 (Pistil-specific extensin-like protein)
43F13A2.1F13A2.1n/achrV 4,381,556
44str-149Y32B12B.5n/achrV 16,574,182C. elegans STR-149 protein ;
45rrf-3F10B5.7n/achrII 8,165,532rrf-3 encodes an RNA-directed RNA polymerase (RdRP) homolog that inhibits somatic RNAi, and thus promotes activity of repeated genes (e.g., multicopy transgenic arrays); the effect of RRF-3 on RNAi is opposite to that of RRF-1 (which stimulates somatic RNAi), which might arise from competition by RRF-3 with RRF-1 or EGO-1 in RNAi formation; rrf-3(allele) or rrf-3(allele2) mutants are hypersensitive to somatic RNAi, and conversely suppress the activity of an integrated rol6 (su1006) transgene.
46T10E9.8T10E9.8n/achrI 6,540,502
47K08E3.2K08E3.2n/achrIII 13,747,959contains similarity to Pfam domain PF00635 MSP (Major sperm protein) domain contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000535 (Major sperm protein)
48F40G12.9F40G12.9n/achrV 14,282,717contains similarity to Pfam domain PF04942 (CC domain)
49srh-18C50B6.5n/achrV 13,319,254C. elegans SRH-18 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
50nhr-75C49D10.6n/achrII 3,867,513C. elegans NHR-75 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)