UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1C02F12.8C02F12.80chrX 3,691,690contains similarity to Interpro domain IPR000694 (Proline-rich region)
2T26E4.5T26E4.5n/achrV 15,787,827contains similarity to Interpro domain IPR008996 ()
3T05E11.6T05E11.6n/achrIV 11,109,297contains similarity to Pfam domain PF01650 Peptidase C13 family contains similarity to Interpro domain IPR001096 (Peptidase C13, legumain)
4T28F2.7T28F2.7n/achrI 3,658,340contains similarity to Pfam domain PF00858 Amiloride-sensitive sodium channel contains similarity to Interpro domains IPR003945 (NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5), IPR001873 (Na+ channel, amiloride-sensitive)
5T20G5.10T20G5.10n/achrIII 10,211,438contains similarity to Pfam domain PF06320 GCN5-like protein 1 (GCN5L1) contains similarity to Interpro domain IPR009395 (GCN5-like 1)
6K02E7.10K02E7.10n/achrII 1,066,288contains similarity to Pfam domain PF00112 Papain family cysteine protease contains similarity to Interpro domains IPR013128 (Peptidase C1A, papain), IPR000668 (Peptidase C1A, papain C-terminal)
7C18B10.6C18B10.6n/achrV 7,480,150contains similarity to Pfam domains PF02958 (Domain of unknown function (DUF227)) , PF07914 (Protein of unknown function (DUF1679)) contains similarity to Interpro domains IPR011009 (Protein kinase-like), IPR012877 (Protein of unknown function DUF1679, Caenorhabditis species), IPR004119 (Protein of unknown function DUF227), IPR015897 (CHK kinase-like)
8mab-21F35G12.6n/achrIII 4,601,861mab-21 encodes a novel protein that is a member of a highly conserved family of proteins with Drosophila and vertebrate orthologs; MAB-21 is cell-autonomously required for specifying the identity of sensory ray 6 in the male tail, and also for backward locomotion, normal body morphology, fecundity, and embryonic morphogenesis; MAB-21 expression begins in embryonic hypodermal cells and continues in larval and adult animals in hypodermis, anterior and ventral cord neurons, some body wall muscles, and ray cells.
9C17B7.5C17B7.5n/achrV 3,336,321contains similarity to Pfam domain PF04721 Domain of unknown function (DUF750) contains similarity to Interpro domains IPR002345 (Lipocalin), IPR006588 (Protein of unknown function PAW)
10lgc-45W10G11.16n/achrII 3,566,681C. elegans LGC-45 protein; contains similarity to Pfam domains PF02931 (Neurotransmitter-gated ion-channel ligand binding domain) , PF02932 (Neurotransmitter-gated ion-channel transmembrane region) contains similarity to Interpro domains IPR006028 (Gamma-aminobutyric acid A receptor), IPR006201 (Neurotransmitter-gated ion-channel), IPR006202 (Neurotransmitter-gated ion-channel ligand-binding), IPR006029 (Neurotransmitter-gated ion-channel transmembrane region)
11twk-36R12G8.2n/achrV 17,745,322C. elegans TWK-36 protein; contains similarity to Pfam domain PF07885 Ion channel contains similarity to Interpro domains IPR003280 (Potassium channel, two pore-domain), IPR013099 (Ion transport 2), IPR003092 (Potassium channel, two pore-domain, TASK)
12K07E8.10K07E8.10n/achrII 666,102
13acr-18F28F8.1n/achrV 15,555,125acr-18 encodes an alpha subunit of nicotinic acetylcholine receptor (nAChR), predicted to be a ligand-gated ion channel regulating fast action of acetylcholine at neuromuscular junctions and in the nervous system; ACR-18 falls into the 'DEG-3' class of nAChR subunits, apparently unique to nematodes, which includes DEG-3, DES-2, ACR-5, ACR-17, ACR-20, and ACR-23.
14ZK1193.3ZK1193.3n/achrX 418,922contains similarity to Interpro domains IPR000742 (EGF-like, type 3), IPR013032 (EGF-like region, conserved site)
15fbxb-5F45C12.14n/achrII 1,721,873This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; its encoded protein also contains a Pfam-B45 motif of presently unknown function.
16M02B7.5M02B7.5n/achrIV 3,813,489contains similarity to Pfam domains PF00612 (IQ calmodulin-binding motif) , PF01369 (Sec7 domain) contains similarity to Interpro domains IPR011993 (Pleckstrin homology-type), IPR000904 (SEC7-like)
17srt-17F48G7.6n/achrV 624,474C. elegans SRT-17 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
18C02G6.2C02G6.2n/achrV 5,873,482contains similarity to Pfam domains PF00675 (Insulinase (Peptidase family M16)) , PF05193 (Peptidase M16 inactive domain) (2)contains similarity to Interpro domains IPR001431 (Peptidase M16, zinc-binding site), IPR011765 (Peptidase M16, N-terminal), IPR011237 (Peptidase M16, core), IPR007863 (Peptidase M16, C-terminal), IPR011249 (Metalloenzyme, LuxS/M16 peptidase-like, metal-binding)
19nph-1M28.7n/achrII 10,650,519nph-1 encodes a novel, SH3 domain-containing protein that is orthologous to mammalian nephrocystin-1.
20T05D4.3T05D4.3n/achrIII 13,568,545contains similarity to Interpro domain IPR005838 (Type III secretion system inner membrane P protein)
21cyp-14A1K09A11.2n/achrX 13,266,131C. elegans CYP-14A1 protein; contains similarity to Pfam domain PF00067 Cytochrome P450 contains similarity to Interpro domains IPR001128 (Cytochrome P450), IPR002401 (Cytochrome P450, E-class, group I), IPR002403 (Cytochrome P450, E-class, group IV), IPR002397 (Cytochrome P450, B-class)
22C42C1.6C42C1.6n/achrIV 12,294,581contains similarity to Drosophila melanogaster Flybase gene name is CG16970-PA; FLYBASE:CG16970-PA
23R13.3R13.3n/achrIV 10,830,875contains similarity to Pfam domain PF01062 Bestrophin contains similarity to Interpro domain IPR000615 (Bestrophin)
24srt-34F54E2.6n/achrV 2,817,549C. elegans SRT-34 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
25ttr-40E02C12.4n/achrV 9,354,969C. elegans TTR-40 protein; contains similarity to Pfam domain PF01060 Transthyretin-like family contains similarity to Interpro domain IPR001534 (Transthyretin-like)
26F28C6.9F28C6.9n/achrII 8,609,707contains similarity to Homo sapiens Hypothetical protein KIAA0562; ENSEMBL:ENSP00000263739
27K07E8.5K07E8.5n/achrII 652,962K07E8.5 encodes a homolog of the functionally active Fmrf Receptor (FR; CG2114) of D. melanogaster; it is thus possible that K07E8.5 is a receptor for one of the FMRF-like neurotransmitters in C. elegans (e.g., FLP-1 through FLP-12).
28clec-254F11D11.5n/achrV 18,753,929C. elegans CLEC-254 protein; contains similarity to Pfam domain PF08277 PAN-like domain contains similarity to Interpro domains IPR006583 (CW), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
29T14C1.2T14C1.2n/achrX 14,400,452contains similarity to Homo sapiens MHC class I molecule; ENSEMBL:ENSP00000252229
30acc-3F55D10.5n/achrX 4,725,216C. elegans ACC-3 protein; contains similarity to Pfam domains PF02931 (Neurotransmitter-gated ion-channel ligand binding domain) , PF02932 (Neurotransmitter-gated ion-channel transmembrane region) contains similarity to Interpro domains IPR001390 (Gamma-aminobutyric-acid A receptor, alpha subunit), IPR006028 (Gamma-aminobutyric acid A receptor), IPR006201 (Neurotransmitter-gated ion-channel), IPR006202 (Neurotransmitter-gated ion-channel ligand-binding), IPR006029 (Neurotransmitter-gated ion-channel transmembrane region)
31C34F6.6C34F6.6n/achrX 11,207,733contains similarity to Pisum sativum 2-dehydro-3-deoxyphosphooctonate aldolase (EC 2.5.1.55) (Phospho-2-sdehydro-3-deoxyoctonate aldolase) (3-deoxy-D-manno-octulosonic acid 8-sphosphate synthetase) (KDO-8-phosphate synthetase) (KDO 8-P synthase)s(KDOPS).; SW:KDSA_PEA
32W04A4.5W04A4.5n/achrI 13,669,210contains similarity to Pfam domain PF02985 HEAT repeat contains similarity to Interpro domains IPR011989 (Armadillo-like helical), IPR000357 (HEAT), IPR016024 (Armadillo-type fold)
33T24D1.2T24D1.2n/achrI 9,954,687contains similarity to Interpro domain IPR001841 (Zinc finger, RING-type)
34D1046.4D1046.4n/achrIV 8,935,680contains similarity to Pfam domain PF07690 Major Facilitator Superfamily contains similarity to Interpro domains IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
35T28F2.1T28F2.1n/achrI 3,640,560contains similarity to Pfam domain PF01531 Glycosyl transferase family 11 contains similarity to Interpro domain IPR002516 (Glycosyl transferase, family 11)
36F28B1.4F28B1.4n/achrV 17,056,226contains similarity to Archaeoglobus fulgidus Ferredoxin (FDX-2).; TR:O30071
37apt-9W04G3.4n/achrX 11,070,152apt-9 gene encodes an ortholog of GGA (Golgi-localizing, gamma-adaptin ear homology, ARF-binding protein), which contains a domain paralogous to the gamma-adaptin subunits of adaptor protein complexes; based on structural similarity, APT-9 may beinvolved in the formation of intracellular transport vesicles.
38mrp-2F57C12.4n/achrX 568,214mrp-2 encodes a predicted multidomain transmembrane protein that is a member of the ATP-binding cassette (ABC) superfamily of transport proteins and is homologous to the human multidrug resistance-associated protein 1 (MRP1, OMIM:158343); by homology, MRP-2 is predicted to function as a membrane pump that couples the energy of ATP hydrolysis to membrane transport; as loss of MRP-2 function via RNA-mediated interference (RNAi) does not result in any abnormalities, the precise role of MRP-2 in C. elegans development and/or behavior is not yet known; mrp-2 expression is, however, upregulated early in the exit from the alternative dauer stage and then remains induced, suggesting that MRP-2 activity is required for the transition to, and maintenance of, a more active metabolic state.
39ZK1055.4ZK1055.4n/achrV 6,586,468contains similarity to Pfam domain PF03314 Protein of unknown function, DUF273 contains similarity to Interpro domain IPR004988 (Protein of unknown function DUF273)
40srh-25C54D10.6n/achrV 12,433,068C. elegans SRH-25 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
41F17H10.4F17H10.4n/achrX 13,126,169contains similarity to Macaca fascicularis Cytochrome oxidase subunit VIII.; TR:Q8SPI5
42F49H6.12F49H6.12n/achrV 17,021,153contains similarity to Phasianus colchicus Gag polyprotein (Fragment).; TR:Q9I9T0
43Y20C6A.3Y20C6A.3n/achrV 17,382,699contains similarity to Saccharomyces cerevisiae Myo1 is a type II myosin, is localized to the actomyosin ring and is important for cytokinesis.; SGD:YHR023W
44epac-1T20G5.5n/achrIII 10,191,417C. elegans EPAC-1 protein; contains similarity to Pfam domains PF00610 (Domain found in Dishevelled, Egl-10, and Pleckstrin) , PF00027 (Cyclic nucleotide-binding domain) (2), PF00617 (RasGEF domain) , PF00618 (Guanine nucleotide exchange factor for Ras-like GTPases; N-terminal motif) contains similarity to Interpro domains IPR008937 (Ras guanine nucleotide exchange factor), IPR011051 (Cupin, RmlC-type), IPR001895 (Guanine-nucleotide dissociation stimulator CDC25), IPR011991 (Winged helix repressor DNA-binding), IPR000595 (Cyclic nucleotide-binding), IPR002373 (cAMP/cGMP-dependent protein kinase), IPR014710 (RmlC-like jelly roll fold), IPR000651 (Guanine nucleotide exchange factor for Ras-like GTPases, N-terminal), IPR000591 (Pleckstrin/ G-protein, interacting region)
45K09F6.7K09F6.7n/achrII 2,291,523contains similarity to Pfam domain PF00097 Zinc finger, C3HC4 type (RING finger) contains similarity to Interpro domains IPR001841 (Zinc finger, RING-type), IPR013083 (Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type), IPR000315 (Zinc finger, B-box)
46ugt-49AC3.2n/achrV 10,373,259C. elegans UGT-49 protein; contains similarity to Pfam domain PF00201 UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase contains similarity to Interpro domain IPR002213 (UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase)
47ZK593.8ZK593.8n/achrIV 10,938,663contains similarity to Pfam domains PF07719 (Tetratricopeptide repeat) , PF02661 (Fic protein family) contains similarity to Interpro domains IPR003812 (Filamentation induced by cAMP protein Fic), IPR011990 (Tetratricopeptide-like helical), IPR013105 (Tetratricopeptide TPR2), IPR013026 (Tetratricopeptide region)
48fbxa-167C31C9.3n/achrII 13,642,551This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
49B0454.5B0454.5n/achrII 3,039,835contains similarity to Homo sapiens 21 kDa protein; VG:OTTHUMP00000165983
50C18H9.1C18H9.1n/achrII 6,699,771