UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1C01G6.7C01G6.70chrII 9,292,949contains similarity to Pfam domain PF00501 AMP-binding enzyme contains similarity to Interpro domain IPR000873 (AMP-dependent synthetase and ligase)
2nhr-79T26H2.9n/achrV 19,209,750C. elegans NHR-79 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
3F40G12.9F40G12.9n/achrV 14,282,717contains similarity to Pfam domain PF04942 (CC domain)
4srb-6R05H5.6n/achrII 10,195,792C. elegans SRB-6 protein; contains similarity to Pfam domains PF02117 (C.elegans Sra family integral membrane protein) , PF02175 (C.elegans integral membrane protein Srb) contains similarity to Interpro domains IPR002184 (Serpentine beta receptor), IPR000344 (Nematode chemoreceptor, Sra)
5ugt-20K08B4.4n/achrIV 6,082,263C. elegans UGT-20 protein; contains similarity to Pfam domains PF04101 (Glycosyltransferase family 28 C-terminal domain) , PF00201 (UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase) contains similarity to Interpro domains IPR002213 (UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase), IPR007235 (Glycosyl transferase, family 28, C-terminal)
6T24D5.2T24D5.2n/achrX 12,585,041contains similarity to Plasmodium falciparum DNA-directed RNA polymerase beta chain (EC 2.7.7.6).; SW:RPOB_PLAFA
7del-4T28B8.5n/achrI 8,140,996C. elegans DEL-4 protein; contains similarity to Pfam domain PF00858 Amiloride-sensitive sodium channel contains similarity to Interpro domain IPR001873 (Na+ channel, amiloride-sensitive)
8ZK945.8ZK945.8n/achrII 10,108,812contains similarity to Pfam domain PF07491 Protein phosphatase inhibitor contains similarity to Interpro domain IPR011107 (Protein phosphatase inhibitor)
9F58G1.8F58G1.8n/achrII 12,925,362contains similarity to Interpro domain IPR009022 (Elongation factor G, III and V)
10F17C8.6F17C8.6n/achrIII 4,745,411F17C8.6 encodes an alpha1 Ca2+ channel subunit; large-scale RNAi experiments indicate that during development F17C8.6, along with nca-2, may play a role in regulating egg size and shape.
11amt-3M195.3n/achrII 8,366,108amt-3 encodes one of four C. elegans homologs of AMT1 (AT11_ARATH), a high-affinity ammonium transporter from Arabidopsis thaliana; AMT-3 is closely similar to its paralog AMT-2, with somewhat more distant paralogy to AMT-1 and AMT-4.
12str-77W06D12.4n/achrV 17,720,087C. elegans STR-77 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
13srh-169C49G7.2n/achrV 4,048,582C. elegans SRH-169 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
14F55G7.1F55G7.1n/achrX 11,925,643contains similarity to Galleria mellonella Sericin-2 (Silk gum protein 2) (Fragment).; SW:SER2_GALME
15W02B8.2W02B8.2n/achrII 13,911,962contains similarity to Pfam domains PF00169 (PH domain) , PF00780 (CNH domain) , PF00130 (Phorbol esters/diacylglycerol binding domain (C1 domain)) contains similarity to Interpro domains IPR001849 (Pleckstrin-like), IPR011993 (Pleckstrin homology-type), IPR000533 (Tropomyosin), IPR001180 (Citron-like), IPR002219 (Protein kinase C, phorbol ester/diacylglycerol binding)
16R06A10.3R06A10.3n/achrI 1,078,831
17R09H10.1R09H10.1n/achrIV 10,601,257contains similarity to Pfam domain PF01482 Domain of unknown function DUF13 contains similarity to Interpro domain IPR002485 (Protein of unknown function DUF13)
18K08E3.2K08E3.2n/achrIII 13,747,959contains similarity to Pfam domain PF00635 MSP (Major sperm protein) domain contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000535 (Major sperm protein)
19K05G3.1K05G3.1n/achrX 16,501,554contains similarity to Pfam domain PF01612 3'-5' exonuclease contains similarity to Interpro domain IPR002562 (3'-5' exonuclease)
20F15A8.4F15A8.4n/achrX 4,408,576
21F18E3.10F18E3.10n/achrV 7,424,056contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
22T13A10.2T13A10.2n/achrIV 6,253,526contains similarity to Pfam domain PF00097 Zinc finger, C3HC4 type (RING finger) contains similarity to Interpro domains IPR001841 (Zinc finger, RING-type), IPR013083 (Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type)
23R12C12.3R12C12.3n/achrII 6,030,297contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR002184 (Serpentine beta receptor), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
24C51E3.6C51E3.6n/achrV 10,165,329contains similarity to Pfam domain PF00860 Permease family contains similarity to Interpro domain IPR006043 (Xanthine/uracil/vitamin C permease)
25srr-2T26H2.8n/achrV 19,215,331C. elegans SRR-2 protein; contains similarity to Pfam domain PF03268 Caenorhabditis protein of unknown function, DUF267 contains similarity to Interpro domains IPR004950 (Protein of unknown function DUF267, Caenorhabditis species), IPR002455 (GPCR, family 3, gamma-aminobutyric acid receptor, type B)
26srt-19F47D2.1n/achrV 4,286,112C. elegans SRT-19 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domains IPR002651 (Protein of unknown function DUF32), IPR002232 (5-Hydroxytryptamine 6 receptor)
27T20G5.4T20G5.4n/achrIII 10,213,504contains similarity to Pfam domain PF01062 Bestrophin contains similarity to Interpro domain IPR000615 (Bestrophin)
28F53B6.6F53B6.6n/achrI 8,956,012contains similarity to Pfam domain PF00100 Zona pellucida-like domain contains similarity to Interpro domain IPR001507 (Endoglin/CD105 antigen)
29cmk-1K07A9.2n/achrIV 1,829,288cmk-1 encodes a Ca+2/calmodulin-dependent protein kinase I (CaMK1); CMK-1 activity is required, cell autonomously and downstream of the cyclic nucleotide-gated channel TAX-4, for several aspects of AFD thermosensory neuron differentiation, including expression of the gcy-8 guanylyl cyclase and nhr-38 nuclear hormone receptor genes and morphology of the AFD sensory endings; cmk-1 activity is thus also required for normal thermosensory behavior; a cmk-1::gfp reporter is expressed in head sensory and interneurons as well as in the ventral nerve cord; expression is seen specifically in the neurons of the thermosensory circuit, AFD, AIY, and AIZ; CMK-1 localizes exclusively to the cytoplasm.
30R01H2.4R01H2.4n/achrIII 7,062,521contains similarity to Interpro domain IPR000215 (Protease inhibitor I4, serpin)
31C14A11.5C14A11.5n/achrX 2,806,295
32T21B10.6T21B10.6n/achrII 8,945,096contains similarity to Pfam domain PF00100 Zona pellucida-like domain contains similarity to Interpro domain IPR001507 (Endoglin/CD105 antigen)
33E03H4.12E03H4.12n/achrI 12,436,494contains similarity to Pfam domain PF03360 Glycosyltransferase family 43 contains similarity to Interpro domain IPR005027 (Glycosyl transferase, family 43)
34W04C9.5W04C9.5n/achrI 464,897contains similarity to Pfam domain PF00071 Ras family contains similarity to Interpro domains IPR003577 (Ras small GTPase, Ras type), IPR001806 (Ras GTPase), IPR003579 (Ras small GTPase, Rab type), IPR013753 (Ras)
35str-181R11D1.6n/achrV 12,717,648C. elegans STR-181 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
36srh-116Y61B8A.1n/achrV 17,253,997C. elegans SRH-116 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
37nhr-217T09E11.2n/achrI 12,341,975C. elegans NHR-217 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
38C25E10.7C25E10.7n/achrV 9,050,528C25E10.7 encodes a putative secreted TIL-domain protease inhibitor paralogous to SWM-1, ISL-1, and the products of 11 other C. elegans genes; C25E10.7 and its relatives are collectively similar to other TIL-domain protease inhibitors from nematodes, insects, and vertebrates; C25E10.7 has no obvious function in mass RNAi assays.
39F16B12.7F16B12.7n/achrX 14,109,051contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
40C46A5.1C46A5.1n/achrIV 7,765,495contains similarity to Pfam domain PF00102 Protein-tyrosine phosphatase contains similarity to Interpro domains IPR003595 (Protein-tyrosine phosphatase, catalytic), IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type), IPR000387 (Protein-tyrosine phosphatase)
41B0041.5B0041.5n/achrI 4,649,524contains similarity to Interpro domain IPR010916 (TonB box, conserved site)
42R10F2.6R10F2.6n/achrIII 2,940,362contains similarity to Pfam domain PF00102 Protein-tyrosine phosphatase contains similarity to Interpro domains IPR003595 (Protein-tyrosine phosphatase, catalytic), IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type)
43col-187C30F2.1n/achrX 16,073,795C. elegans COL-187 protein; contains similarity to Pfam domains PF01484 (Nematode cuticle collagen N-terminal domain) , PF01391 (Collagen triple helix repeat (20 copies)) (2)contains similarity to Interpro domains IPR002486 (Nematode cuticle collagen, N-terminal), IPR000694 (Proline-rich region), IPR008161 (Collagen helix repeat), IPR008160 (Collagen triple helix repeat)
44F38H4.5F38H4.5n/achrIV 11,852,639contains similarity to Pfam domain PF02274 Amidinotransferase contains similarity to Interpro domain IPR003198 (Amidinotransferase)
45F55C5.1F55C5.1n/achrV 12,263,644contains similarity to Pfam domain PF00635 MSP (Major sperm protein) domain contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000535 (Major sperm protein)
46fbxa-32ZC47.6n/achrIII 1,268,313This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
47Y75B8A.28Y75B8A.28n/achrIII 12,320,885contains similarity to Saccharomyces cerevisiae Required for START A of cell cycle, and glucose and nitrogen repression of sporulation; SGD:YJL005W
48C44E4.2C44E4.2n/achrI 4,632,370contains similarity to Interpro domain IPR016024 (Armadillo-type fold)
49D2023.3D2023.3n/achrV 11,804,015contains similarity to Pfam domain PF00168 C2 domain contains similarity to Interpro domains IPR008973 (C2 calcium/lipid-binding region, CaLB), IPR000008 (C2 calcium-dependent membrane targeting)
50R10F2.5R10F2.5n/achrIII 2,924,200contains similarity to Interpro domain IPR000443 (Islet amyloid polypeptide)