UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1BE10.4BE10.48e-132chrIII 12,815,049contains similarity to Interpro domain IPR000694 (Proline-rich region)
2C50B8.5C50B8.5n/achrV 13,582,800contains similarity to Candida albicans Hypothetical membrane protein.; TR:O94057
3gcy-21F22E5.3n/achrII 2,662,347gcy-21 is predicted to encode a guanylate cyclase.
4wht-6T26A5.1n/achrIII 6,473,428C. elegans WHT-6 protein; contains similarity to Pfam domains PF01061 (ABC-2 type transporter) , PF00005 (ABC transporter) contains similarity to Interpro domains IPR003439 (ABC transporter-like), IPR003593 (AAA+ ATPase, core), IPR013525 (ABC-2 type transporter)
5C32H11.4C32H11.4n/achrIV 12,922,267contains similarity to Pfam domain PF02408 CUB-like domain contains similarity to Interpro domain IPR003366 (CUB-like region)
6F31D5.2F31D5.2n/achrII 4,216,907contains similarity to Pfam domains PF07690 (Major Facilitator Superfamily) , PF05978 (Eukaryotic protein of unknown function (DUF895)) contains similarity to Interpro domains IPR010291 (Protein of unknown function DUF895, eukaryotic), IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
7srd-15C04E6.10n/achrV 5,905,617C. elegans SRD-15 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
8sulp-8ZK287.2n/achrV 9,671,599sulp-8 encodes one of eight C. elegans members of the sulfate permease family of anion transporters; by homology, SULP-8 is predicted to function as an anion transporter that regulates cellular pH and volume via transmembrane movement of electrolytes and fluids; a SULP-8::GFP fusion is expressed in the basolateral membrane of the excretory cell, intestine, and rectal gland cells.
9srh-44B0334.7n/achrII 11,516,530C. elegans SRH-44 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
10C16D6.2C16D6.2n/achrX 12,544,267contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR001402 (Prolactin-releasing peptide receptor), IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000405 (Galanin receptor), IPR000611 (Neuropeptide Y receptor), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
11K09C6.6K09C6.6n/achrV 844,913
12gck-2ZC404.9n/achrV 6,790,540C. elegans GCK-2 protein; contains similarity to Pfam domains PF07714 (Protein tyrosine kinase) , PF00069 (Protein kinase domain) , PF00780 (CNH domain) contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001180 (Citron-like), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
13C01B12.5C01B12.5n/achrII 10,817contains similarity to Pfam domain PF01062 Bestrophin contains similarity to Interpro domains IPR000615 (Bestrophin), IPR000802 (Arsenical pump membrane protein)
14far-5F15B9.3n/achrV 12,996,198far-5 encodes a member of a class of fatty acid-and retinol-binding proteins that are known to be secreted by parasitic nematodes and plants; far-5 binds lipid in fluorescence-based assays, however, the precise function of far-5 is not known.
15srd-30F07C4.5n/achrV 7,630,532C. elegans SRD-30 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
16nas-14F09E8.6n/achrIV 13,172,108nas-14 encodes an astacin-like metalloprotease; large-scale expression studies reveal that a nas-14::GFP promoter fusion is expressed in the pharynx.
17T05A8.5T05A8.5n/achrII 2,733,284contains similarity to Pfam domain PF00400 WD domain, G-beta repeat contains similarity to Interpro domains IPR011046 (WD40 repeat-like), IPR001680 (WD40 repeat), IPR015943 (WD40/YVTN repeat-like)
18gcy-35T04D3.4n/achrI 13,329,337C. elegans GCY-35 protein; contains similarity to Pfam domains PF07700 (Heme NO binding) , PF07701 (Heme NO binding associated) , PF00211 (Adenylate and Guanylate cyclase catalytic domain) contains similarity to Interpro domains IPR011644 (Haem NO binding), IPR011645 (Haem NO binding associated), IPR001054 (Adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase)
19ins-24ZC334.3n/achrI 14,031,394ins-24 encodes an insulin-like peptide of the insulin superfamily of proteins (OMIM:176730, 147440); INS-24 is one of 38 insulin-like peptides in C. elegans, but as loss of INS-24 function via RNA-mediated interference does not result in any abnormalities, the precise role of INS-24 in C. elegans development is not yet clear.
20srx-74F41F3.6n/achrV 4,660,713C. elegans SRX-74 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
21T28D6.7T28D6.7n/achrIII 11,345,403contains similarity to Pfam domain PF01852 START domain contains similarity to Interpro domain IPR002913 (Lipid-binding START)
22srw-140C03A7.3n/achrV 5,166,467C. elegans SRW-140 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
23C56E6.6C56E6.6n/achrII 6,542,233contains similarity to Pfam domain PF00560 Leucine Rich Repeat contains similarity to Interpro domains IPR000483 (Cysteine-rich flanking region, C-terminal), IPR001611 (Leucine-rich repeat), IPR003591 (Leucine-rich repeat, typical subtype)
24F09E5.10F09E5.10n/achrII 5,349,294contains similarity to Interpro domain IPR009079 (Four-helical cytokine-like, core)
25H35B03.1H35B03.1n/achrIV 5,727,641
26C06C6.6C06C6.6n/achrV 15,990,153contains similarity to Pfam domain PF02206 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domain IPR003125 (Protein of unknown function WSN)
27C01G10.9C01G10.9n/achrV 15,083,391contains similarity to Pfam domain PF01008 Initiation factor 2 subunit family contains similarity to Interpro domains IPR000649 (Initiation factor 2B related), IPR011559 (Initiation factor 2B alpha/beta/delta)
28F54C4.4F54C4.4n/achrIII 87,055
29K03H6.5K03H6.5n/achrIV 1,531,807contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
30fbxb-107F29A7.2n/achrII 2,760,240C. elegans FBXB-107 protein; contains similarity to Pfam domain PF07735 F-box associated contains similarity to Interpro domain IPR012885 (F-box associated type 2)
31C33E10.5C33E10.5n/achrX 17,276,148contains similarity to Interpro domain IPR000173 (Glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase)
32C32H11.1C32H11.1n/achrIV 12,913,842contains similarity to Pfam domain PF02408 CUB-like domain contains similarity to Interpro domains IPR000859 (CUB), IPR003366 (CUB-like region)
33F17E5.2F17E5.2n/achrX 12,396,800contains similarity to Pfam domains PF00153 (Mitochondrial carrier protein) (3), PF00036 (EF hand) (3)contains similarity to Interpro domains IPR011992 (EF-Hand type), IPR002048 (Calcium-binding EF-hand), IPR003842 (Vacuolating cytotoxin), IPR002067 (Mitochondrial carrier protein), IPR002030 (Mitochondrial brown fat uncoupling protein), IPR002167 (Graves disease carrier protein), IPR001993 (Mitochondrial substrate carrier), IPR002113 (Adenine nucleotide translocator 1)
34K10G9.2K10G9.2n/achrIII 10,287,161contains similarity to Homo sapiens Similar to Suppressor protein SRP40; VG:OTTHUMP00000170311
35F07G6.2F07G6.2n/achrX 1,728,163
36Y113G7B.24Y113G7B.24n/achrV 20,231,897contains similarity to Pfam domain PF05916 Synthetic lethal mutants of dpb11-1 five contains similarity to Interpro domain IPR008591 (GINS complex, Sld5 component)
37osm-6R31.3n/achrV 11,925,995osm-6 encodes a novel protein that is orthologous to the IFT52 component of the intraflagellar transport particle; osm-6 activity is required cell autonomously for proper sensory cilium structure and thus for normal ciliated sensory neuron function; OSM-6 is a component of the intraflagellar transport particle subcomplex B, and OSM-6::GFP reporter fusions are expressed exclusively in ciliated sensory neurons.
38E01G6.2E01G6.2n/achrX 12,257,730contains similarity to Streptomyces coelicolor;Streptomyces lividans Putative secreted protein (Putative TWIN ARGININ translocationsreceptor).; TR:Q9RJ68
39T23G11.1T23G11.1n/achrI 7,701,721contains similarity to Plasmodium falciparum Hypothetical protein.; TR:Q8I452
40str-4C50B6.10n/achrV 13,338,836C. elegans STR-4 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
41Y7A5A.6Y7A5A.6n/achrX 15,798,435contains similarity to Schizosaccharomyces pombe Putative transcriptional regulatory protein, phd finger.; TR:Q9HDV4
42Y81G3A.4Y81G3A.4n/achrII 13,092,774contains similarity to Guillardia theta 60S acidic ribosomal protein P0.; TR:Q98S65
43C34F6.9C34F6.9n/achrX 11,220,316contains similarity to Interpro domain IPR001394 (Peptidase C19, ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 2)
44T20D3.11T20D3.11n/achrIV 9,349,648contains similarity to Anopheles gambiae str PEST AGAP009276-PA (Fragment).; TR:Q7PVH5
45ist-1C54D1.3n/achrX 7,135,879ist-1 encodes a pleckstrin homology (PH) and phosphotyrosine binding (PTB) domain-containing insulin receptor substrate (IRS) homolog that negatively regulates lifespan and dauer development; IST-1 potentiates insulin-like signaling, although it is not absolutely required for such signaling under most conditions; in addition to acting through the AGE-1/PI3K branch of the insulin-like signaling pathway, IST-1 may also function in a parallel pathway to activate downstream protein-kinase Bs encoded by akt-1 and akt-2.
46Y56A3A.2Y56A3A.2n/achrIII 11,856,255contains similarity to Pfam domain PF02163 Peptidase family M50 contains similarity to Interpro domains IPR008915 (Peptidase M50), IPR006025 (Peptidase M, neutral zinc metallopeptidases, zinc-binding site), IPR001193 (Peptidase M50, mammalian sterol-regulatory element binding protein)
47nhr-79T26H2.9n/achrV 19,209,750C. elegans NHR-79 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
48Y39E4B.6Y39E4B.6n/achrIII 13,072,610contains similarity to Rattus norvegicus Nucleolar protein NOP5 (Nucleolar protein 5) (Nopp140 associatedsprotein).; SW:NOP5_RAT
49ZK524.4ZK524.4n/achrI 7,463,889contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
50pqn-84Y41C4A.5n/achrIII 11,701,451The protein product of this gene is predicted to contain a glutamine/asparagine (Q/N)-rich ('prion') domain, by the algorithm of Michelitsch and Weissman (as of the WS77 release of WormBase, i.e., in wormpep77).