UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1B0524.6B0524.66e-136chrIII 1,903,905
2str-177T18H9.4n/achrV 9,198,343C. elegans STR-177 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
3F56A8.1F56A8.1n/achrIII 13,252,041contains similarity to Pfam domain PF04547 Protein of unknown function, DUF590 contains similarity to Interpro domain IPR007632 (Protein of unknown function DUF590)
4C07D8.2C07D8.2n/achrX 7,362,559contains similarity to Interpro domain IPR000104 (Antifreeze protein, type I)
5T22F3.10T22F3.10n/achrV 3,608,429contains similarity to Pfam domain PF07690 Major Facilitator Superfamily contains similarity to Interpro domains IPR007114 (Major facilitator superfamily), IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
6F16B12.5F16B12.5n/achrX 14,100,488contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
7F22H10.5F22H10.5n/achrX 16,687,280contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core)
8Y17G7B.12Y17G7B.12n/achrII 12,024,783contains similarity to Pfam domain PF00929 Exonuclease contains similarity to Interpro domains IPR013520 (Exonuclease, RNase T and DNA polymerase III), IPR006055 (Exonuclease), IPR012337 (Polynucleotidyl transferase, Ribonuclease H fold)
9C05B5.5C05B5.5n/achrIII 10,002,152This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins.
10R102.6R102.6n/achrIV 10,699,884contains similarity to Interpro domains IPR000694 (Proline-rich region), IPR000976 (Wilm's tumour protein)
11pkc-1F57F5.5n/achrV 12,019,252pkc-1 encodes a serine/threonine protein kinase that is orthologous to mammalian protein kinase C epsilon (PRKCE), a member of the nPKC subgroup of the protein kinase C superfamily; together with UNC-13, PKC-1 may act downstream of goa-1 to modulate phorbol ester-induced stimulation of acetylcholine release at NMJs; PKC-1 positively regulates locomotion, and affects thermotaxis and chemotaxis together with kin-11; PKC-1 is required for regulating several behaviors including sensation of volatile and soluble compounds, osmolarity, and temperature (thermosensation); PKC-1 is also required for phorbolester-induced stimulation of acetylcholine release at neuromuscular junctions; PKC-1 localizes to the processes and cell bodies of approximately 75 sensory neurons and interneurons, and pkc-1 mRNA is detectable at varying levels during larval and adult stages.
12Y18D10A.9Y18D10A.9n/achrI 12,855,664contains similarity to Pfam domain PF00400 WD domain, G-beta repeat contains similarity to Interpro domains IPR011046 (WD40 repeat-like), IPR001680 (WD40 repeat), IPR011042 (Six-bladed beta-propeller, TolB-like), IPR015943 (WD40/YVTN repeat-like)
13nhr-226T27B7.3n/achrV 2,295,897C. elegans NHR-226 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR000083 (Fibronectin, type I), IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
14srh-41Y54G11A.12n/achrII 14,286,480C. elegans SRH-41 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR000264 (Serum albumin), IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
15F33H12.1F33H12.1n/achrII 2,601,167contains similarity to Pfam domain PF00533 BRCA1 C Terminus (BRCT) domain contains similarity to Interpro domain IPR001357 (BRCT)
16K04G11.3K04G11.3n/achrX 14,346,393contains similarity to Pfam domain PF07547 RSD-2 N-terminal domain contains similarity to Interpro domain IPR011508 (RSD-2, N-terminal)
17T08E11.8T08E11.8n/achrII 1,834,708contains similarity to Pfam domain PF01827 FTH domain contains similarity to Interpro domain IPR002900 (Protein of unknown function DUF38, Caenorhabditis species)
18skr-9C52D10.7n/achrIV 17,163,837skr-9 encodes a homolog of Skp1 in S. cerevisiae, a component of the SCF (Skp1, Cullin, F-box) ubiquitin-ligase complex that regulates ubiquitin-mediated protein degradation; SKR-9 is required for posterior body morphogenesis, embryonic and larval development, and postembryonic cell proliferation.
19nas-1F45G2.1n/achrIII 13,407,525nas-1 encodes an astacin-like metalloprotease.
20F47C12.1F47C12.1n/achrIV 4,001,937contains similarity to Pfam domains PF00008 (EGF-like domain) (4), PF00754 (F5/8 type C domain) , PF07645 (Calcium binding EGF domain) (2), PF07699 (GCC2 and GCC3) (3), PF00431 (CUB domain) , PF07974 (EGF-like domain) , PF02494 (HYR domain) (2), PF00084 (Sushi domain (SCR repeat)) (6)contains similarity to Interpro domains IPR001438 (EGF-like, type 2), IPR000742 (EGF-like, type 3), IPR003410 (Hyalin), IPR000436 (Sushi/SCR/CCP), IPR006209 (EGF-like), IPR000152 (Aspartic acid and asparagine hydroxylation site), IPR006210 (EGF), IPR002049 (EGF-like, laminin), IPR008979 (Galactose-binding like), IPR000859 (CUB), IPR011641 (GCC2 and GCC3), IPR001881 (EGF-like calcium-binding), IPR016060 (Complement control module), IPR009030 (Growth factor, receptor), IPR013032 (EGF-like region, conserved site), IPR000421 (Coagulation factor 5/8 type, C-terminal), IPR013111 (EGF, extracellular), IPR013091 (EGF calcium-binding)
21F22H10.6F22H10.6n/achrX 16,690,126
22str-247B0213.9n/achrV 3,954,734C. elegans STR-247 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
23ZK892.3ZK892.3n/achrII 10,002,830contains similarity to Pfam domains PF07690 (Major Facilitator Superfamily) , PF00083 (Sugar (and other) transporter) contains similarity to Interpro domains IPR007114 (Major facilitator superfamily), IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR005829 (Sugar transporter, conserved site), IPR005828 (General substrate transporter), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
24VW02B12L.2VW02B12L.2n/achrII 11,439,443contains similarity to Pfam domain PF00102 Protein-tyrosine phosphatase contains similarity to Interpro domains IPR003595 (Protein-tyrosine phosphatase, catalytic), IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type), IPR000387 (Protein-tyrosine phosphatase)
25srh-8K09D9.8n/achrV 4,006,527C. elegans SRH-8 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR005394 (P2Y12 purinoceptor)
26T11F9.7T11F9.7n/achrV 11,476,386contains similarity to Interpro domain IPR008880 (Trigger factor, C-terminal, bacterial)
27W04G5.9W04G5.9n/achrI 11,644,012contains similarity to Pfam domain PF04721 Domain of unknown function (DUF750) contains similarity to Interpro domain IPR006588 (Protein of unknown function PAW)
28F55A4.4F55A4.4n/achrX 1,025,409contains similarity to Pfam domain PF00035 Double-stranded RNA binding motif contains similarity to Interpro domains IPR001159 (Double-stranded RNA binding), IPR014720 (Double-stranded RNA-binding-like)
29nspb-12F09F7.8n/achrIII 5,568,450C. elegans NSPB-12 protein ;
30ZK550.2ZK550.2n/achrIV 17,247,626contains similarity to Pfam domain PF07690 Major Facilitator Superfamily contains similarity to Interpro domains IPR007114 (Major facilitator superfamily), IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
31clec-21T07H3.4n/achrII 1,583,563C. elegans CLEC-21 protein; contains similarity to Pfam domains PF00431 (CUB domain) , PF00059 (Lectin C-type domain) (2)contains similarity to Interpro domains IPR000859 (CUB), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
32srx-35T01C4.5n/achrV 7,121,587C. elegans SRX-35 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR002651 (Protein of unknown function DUF32), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
33pqn-29F10F2.9n/achrIII 4,645,137The protein product of this gene is predicted to contain a glutamine/asparagine (Q/N)-rich ('prion') domain, by the algorithm of Michelitsch and Weissman (as of the WS77 release of WormBase, i.e., in wormpep77).
34ZC482.3ZC482.3n/achrIII 12,762,606contains similarity to Pfam domain PF01030 Receptor L domain contains similarity to Interpro domain IPR000494 (EGF receptor, L domain)
35nas-18K03B8.3n/achrV 11,396,823nas-18 encodes an astacin-like metalloprotease; loss of nas-18 activity via RNAi results in a reduction of fat content suggesting an abnormality in lipid metabolism.
36srg-45C51F7.2n/achrV 12,308,051C. elegans SRG-45 protein; contains similarity to Interpro domain IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
37srt-5C50H11.14n/achrV 3,080,169C. elegans SRT-5 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
38C29F7.7C29F7.7n/achrX 13,442,218contains similarity to Peromyscus maniculatus Alcohol dehydrogenase 2 (EC 1.1.1.1).; SW:ADH2_PERMA
39F42G8.7F42G8.7n/achrIV 8,127,262contains similarity to Pfam domain PF00085 Thioredoxin contains similarity to Interpro domains IPR001763 (Rhodanese-like), IPR012336 (Thioredoxin-like fold), IPR012335 (Thioredoxin fold), IPR013766 (Thioredoxin domain)
40F59E12.8F59E12.8n/achrII 5,635,699contains similarity to Interpro domain IPR015683 (Glutamate receptor-related)
41Y37E11B.6Y37E11B.6n/achrIV 3,598,943Y37E11B.6 encodes an ortholog of Rpp21 (Rpr2), a protein subunit of the endoribonuclease RNAse P, which cleaves tRNA precursors to produce their mature 5' end.
42ZC395.4ZC395.4n/achrIII 5,270,595contains similarity to Homo sapiens Putative uncharacterized protein (Fragment); ENSEMBL:ENSP00000333119
43F35E8.2F35E8.2n/achrV 15,906,320contains similarity to Trichomonas vaginalis G3 Viral A-type inclusion protein, putative.; TR:A2DZ81
44cyp-33E3F42A9.4n/achrIV 8,615,428C. elegans CYP-33E3 protein; contains similarity to Pfam domain PF00067 Cytochrome P450 contains similarity to Interpro domains IPR001128 (Cytochrome P450), IPR002401 (Cytochrome P450, E-class, group I)
45C39E9.7C39E9.7n/achrIV 13,074,688contains similarity to Pfam domain PF07690 Major Facilitator Superfamily contains similarity to Interpro domains IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
46K06A9.3K06A9.3n/achrX 1,534,681contains similarity to Pfam domain PF00008 EGF-like domain contains similarity to Interpro domains IPR000742 (EGF-like, type 3), IPR006209 (EGF-like), IPR001881 (EGF-like calcium-binding), IPR013032 (EGF-like region, conserved site)
47ZK418.7ZK418.7n/achrIII 7,079,862contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR003842 (Vacuolating cytotoxin), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
48T08A9.5T08A9.5n/achrX 7,312,937
49ugt-61F39G3.1n/achrV 4,743,888C. elegans UGT-61 protein; contains similarity to Pfam domain PF00201 UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase contains similarity to Interpro domain IPR002213 (UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase)
50M01B2.10M01B2.10n/achrV 15,261,657contains similarity to Homo sapiens Phytanoyl-CoA 2-hydroxylase-interacting protein-like; ENSEMBL:ENSP00000362987