UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1B0416.4B0416.41.9999999999999998e-122chrX 9,279,335contains similarity to Pfam domain PF00097 Zinc finger, C3HC4 type (RING finger) contains similarity to Interpro domains IPR000533 (Tropomyosin), IPR001841 (Zinc finger, RING-type), IPR000956 (Stathmin), IPR013083 (Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type)
2F54F7.6F54F7.6n/achrX 11,866,107contains similarity to Homo sapiens Golgi autoantigen, golgin subfamily B member 1; ENSEMBL:ENSP00000315938
3C13A2.9C13A2.9n/achrV 7,263,287contains similarity to Pfam domain PF01482 Domain of unknown function DUF13 contains similarity to Interpro domain IPR002485 (Protein of unknown function DUF13)
4sra-25T26E3.9n/achrI 12,687,150C. elegans SRA-25 protein; contains similarity to Pfam domain PF02117 C.elegans Sra family integral membrane protein contains similarity to Interpro domains IPR003945 (NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5), IPR000344 (Nematode chemoreceptor, Sra)
5W06D11.1W06D11.1n/achrX 12,294,462
6T19H5.4T19H5.4n/achrII 9,487,245contains similarity to Gallus gallus Homeobox prospero-like protein PROX1 (PROX 1).; SW:PRX1_CHICK
7ZK177.1ZK177.1n/achrII 5,527,848
8mxl-1T19B10.11n/achrV 11,245,345mxl-1 encodes a basic helix-loop-helix protein similar to the vertebrate MAX transcriptional regulators; in vitro, MXL-1 can heterodimerize, and bind an E-box DNA sequence, with MDL-1, a C. elegans MAD-like bHLH protein; mxl-1::gfp reporter fusions are expressed in the posterior intestine and in head and tail neurons.
9meg-2K02B9.2n/achrX 13,924,518meg-2 encodes a novel protein that localizes exclusively to P granules; originally identified by microarray analyses of germline-enriched transcripts, loss of meg-2 activity by itself results in no obvious abnormalities, but loss of meg-2 activity in meg-1 mutant animals indicates that meg-1 and meg-2 likely have redundant functions in germline development; meg-2 may also function redundantly with mes-1; meg-2 expression in the proximal germline is positively regulated by MPK-1, the C. elegans MAP kinase ortholog; a GFP::MEG-2 fusion protein localizes exclusively to P granules in the embryonic germ cell lineage.
10fbxb-35F07E5.2n/achrII 2,052,208This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; its encoded protein also contains a Pfam-B45 motif of presently unknown function.
11clec-127W10G11.5n/achrII 3,568,702C. elegans CLEC-127 protein; contains similarity to Pfam domain PF00059 Lectin C-type domain contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
12srw-48F26D2.9n/achrV 16,421,858C. elegans SRW-48 protein ; contains similarity to Homo sapiens Uncharacterized protein MPHOSPH1; ENSEMBL:ENSP00000377830
13F28C6.2F28C6.2n/achrII 8,595,158F28C6.2 encodes an AP-2-like transcription factor that is ~60% identical to that of F28C6.1, which lies adjacent to F28C6.1 on chromosome II; loss of F28C6.2 activity via large-scale RNAi results in some embryonic lethality and low levels of larval arrest, body morphology defects, and uncoordinated locomotion.
142L52.12L52.1n/achrII 3,2652L52.1 encodes a protein with sequence similarity to GLI-family zinc-finger transcription factors; deletion mutations in 2L52.1 are reported to be homozygous viable.
15F14H3.3F14H3.3n/achrV 16,052,681contains similarity to Homo sapiens Trichohyalin; ENSEMBL:ENSP00000357794
16F36F12.8F36F12.8n/achrV 2,091,148contains similarity to Pfam domain PF00096 Zinc finger, C2H2 type contains similarity to Interpro domains IPR015880 (Zinc finger, C2H2-like), IPR007087 (Zinc finger, C2H2-type)
17C48B6.3C48B6.3n/achrI 6,915,508contains similarity to Homo sapiens UPF0472 protein C16orf72; ENSEMBL:ENSP00000331720
18B0334.4B0334.4n/achrII 11,496,096contains similarity to Pfam domain PF04707 PRELI-like family contains similarity to Interpro domain IPR006797 (MSF1)
19C13A2.5C13A2.5n/achrV 7,277,113contains similarity to Pfam domain PF01697 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domains IPR008167 (Protein of unknown function DUF23, C-terminal), IPR008166 (Protein of unknown function DUF23)
20clec-223C03E10.5n/achrV 11,275,618C. elegans CLEC-223 protein; contains similarity to Pfam domain PF01391 Collagen triple helix repeat (20 copies) contains similarity to Interpro domains IPR000694 (Proline-rich region), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin), IPR008160 (Collagen triple helix repeat)
21C02B10.2C02B10.2n/achrIV 5,090,651contains similarity to Homo sapiens SNARE-associated protein Snapin; ENSEMBL:ENSP00000357674
22T22C8.4T22C8.4n/achrII 8,623,075contains similarity to Interpro domains IPR003656 (Zinc finger, BED-type predicted), IPR007087 (Zinc finger, C2H2-type)
23F13E6.3F13E6.3n/achrX 10,681,621contains similarity to Interpro domains IPR001965 (Zinc finger, PHD-type), IPR011011 (Zinc finger, FYVE/PHD-type)
24nhr-192F57A8.5n/achrV 10,069,976C. elegans NHR-192 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
25mdt-22ZK970.3n/achrII 10,301,446C. elegans MDT-22 protein; contains similarity to Pfam domain PF06179 Surfeit locus protein 5 contains similarity to Interpro domain IPR009332 (Surfeit locus 5)
26ZK686.1ZK686.1n/achrIII 7,773,406contains similarity to Interpro domain IPR004038 (Ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45)
27C49C8.3C49C8.3n/achrIV 8,644,987
28fbxb-67F49B2.2n/achrI 14,297,764This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; its encoded protein also contains a Pfam-B45 motif of presently unknown function.
29Y106G6H.16Y106G6H.16n/achrI 10,475,167contains similarity to Salmonella typhimurium Putative cytoplasmic protein (STMF1.42 protein).; TR:Q9L9K2
30B0563.8B0563.8n/achrX 9,174,023
31C16C8.5C16C8.5n/achrII 3,445,041contains similarity to Pfam domain PF00240 Ubiquitin family contains similarity to Interpro domain IPR000626 (Ubiquitin)
32M110.3M110.3n/achrII 8,215,496contains similarity to Pfam domain PF00097 Zinc finger, C3HC4 type (RING finger) contains similarity to Interpro domains IPR001841 (Zinc finger, RING-type), IPR013083 (Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type), IPR011016 (Zinc finger, variant RING-type)
33F02D10.6F02D10.6n/achrX 13,450,586contains similarity to Cryptophlebia leucotreta granulosis virus Hypothetical protein.; TR:Q7T5R9
34F46F5.14F46F5.14n/achrII 800,774contains similarity to Pfam domain PF03314 Protein of unknown function, DUF273 contains similarity to Interpro domain IPR004988 (Protein of unknown function DUF273)
35sdz-36ZK1251.7n/achrIV 9,691,129C. elegans SDZ-36 protein
36E02H9.7E02H9.7n/achrIII 2,445,442contains similarity to Homo sapiens Uncharacterized protein MUC17 (Fragment); ENSEMBL:ENSP00000368750
37Y57G11C.25Y57G11C.25n/achrIV 14,919,983Y57G11C.25 encodes a CCCH tandem zinc finger (TZF) protein; based upon its sequence similarity to C. elegans POS-1, the product of Y57G11C.25 is predicted to function as an RNA-binding protein.
38F37D6.4F37D6.4n/achrI 10,488,809This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins.
39K09E3.7K09E3.7n/achrX 17,132,904contains similarity to Homo sapiens Conserved hypothetical protein; HI:HIT000048720
40R06C7.2R06C7.2n/achrI 7,234,078contains similarity to Dictyostelium discoideum Hypothetical protein.; TR:Q86KG8
41F40G9.7F40G9.7n/achrIII 165,986
42EEED8.13EEED8.13n/achrII 5,411,874contains similarity to Interpro domain IPR011038 (Calycin-like)
43W02D7.5W02D7.5n/achrV 8,298,506contains similarity to Interpro domain IPR016181 (Acyl-CoA N-acyltransferase)
44C41G6.13C41G6.13n/achrV 15,208,853contains similarity to Homo sapiens Xylosyltransferase I; ENSEMBL:ENSP00000261381
45M116.1M116.1n/achrIV 8,411,585
46F53B7.4F53B7.4n/achrV 11,001,724contains similarity to Interpro domains IPR004090 (Chemotaxis methyl-accepting receptor), IPR002172 (Low density lipoprotein-receptor, class A, cysteine-rich)
47W06A11.2W06A11.2n/achrII 4,060,321
48F31B9.3F31B9.3n/achrX 15,924,034contains similarity to Homo sapiens Similar to polymerase (RNA) III; ENSEMBL:ENSP00000334758
49T14E8.2T14E8.2n/achrX 6,542,867contains similarity to Interpro domain IPR002172 (Low density lipoprotein-receptor, class A, cysteine-rich)
50F53F4.4F53F4.4n/achrV 13,596,162contains similarity to Candida albicans Chitinase 3 precursor (EC 3.2.1.14).; SW:CHI3_CANAL