UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1fbxa-154B0391.60chrV 15,603,958This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
2gnrr-2C15H11.2n/achrV 14,410,464C. elegans GNRR-2 protein; contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like), IPR001817 (Vasopressin receptor)
3rsr-1F28D9.1n/achrI 11,179,945C. elegans RSR-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF01480 PWI domain contains similarity to Interpro domains IPR002483 (Splicing factor PWI), IPR000694 (Proline-rich region), IPR005819 (Histone H5), IPR002185 (Dopamine D4 receptor)
4ZK1010.8ZK1010.8n/achrIII 12,998,222contains similarity to Homo sapiens BRG1-binding protein ELD/OSA1 isoform 1; TR:Q8IZY8
5T11A5.6T11A5.6n/achrV 9,884,090contains similarity to Pfam domain PF00648 Calpain family cysteine protease contains similarity to Interpro domains IPR001300 (Peptidase C2, calpain), IPR001876 (Zinc finger, RanBP2-type)
6F41C3.11F41C3.11n/achrII 4,732,558contains similarity to Pfam domain PF03407 Protein of unknown function (DUF271) contains similarity to Interpro domains IPR002345 (Lipocalin), IPR005069 (Protein of unknown function DUF271)
7ttr-11F46B3.3n/achrV 20,599,260C. elegans TTR-11 protein; contains similarity to Pfam domain PF01060 Transthyretin-like family contains similarity to Interpro domain IPR001534 (Transthyretin-like)
8hhat-2Y57G11C.17n/achrIV 14,827,743C. elegans HHAT-2 protein; contains similarity to Pfam domain PF03062 MBOAT family contains similarity to Interpro domain IPR004299 (Membrane bound O-acyl transferase, MBOAT)
9F36F12.1F36F12.1n/achrV 2,101,648contains similarity to Pfam domain PF01697 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domains IPR008167 (Protein of unknown function DUF23, C-terminal), IPR008166 (Protein of unknown function DUF23)
10skr-9C52D10.7n/achrIV 17,163,837skr-9 encodes a homolog of Skp1 in S. cerevisiae, a component of the SCF (Skp1, Cullin, F-box) ubiquitin-ligase complex that regulates ubiquitin-mediated protein degradation; SKR-9 is required for posterior body morphogenesis, embryonic and larval development, and postembryonic cell proliferation.
11K10B3.5K10B3.5n/achrX 3,104,756contains similarity to Interpro domains IPR015880 (Zinc finger, C2H2-like), IPR007087 (Zinc finger, C2H2-type)
12F58H7.1F58H7.1n/achrIV 933,095contains similarity to Homo sapiens Isoform 8 of Collagen alpha-2(XI) chain precursor; ENSEMBL:ENSP00000355123
13R06C1.2R06C1.2n/achrI 11,920,861contains similarity to Pfam domain PF00348 Polyprenyl synthetase contains similarity to Interpro domains IPR000092 (Polyprenyl synthetase), IPR008949 (Terpenoid synthase)
14C09G5.8C09G5.8n/achrII 10,723,744contains similarity to Mus musculus Protein fantom (RPGR-interacting protein 1-like protein) (RPGRIP1-likesprotein).; SW:Q8CG73
15F27D9.4F27D9.4n/achrX 7,653,722
16F13A7.11F13A7.11n/achrV 16,394,527contains similarity to Plasmodium falciparum Hypothetical protein, expressed.; TR:Q8IBS8
17F49D11.7F49D11.7n/achrI 10,923,733
18srd-40F17A2.12n/achrX 12,324,508C. elegans SRD-40 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
19str-57T06C12.2n/achrV 15,871,734C. elegans STR-57 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
20F25A2.1F25A2.1n/achrV 1,180,578contains similarity to Rattus norvegicus C-X-C chemokine receptor type 7 (CXC-R7) (CXCR-7) (G-protein coupledsreceptor RDC1 homolog) (RDC-1) (Chemokine orphan receptor 1).; SW:O89039
21srw-129C44C3.2n/achrV 2,972,716C. elegans SRW-129 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
22C34D4.14C34D4.14n/achrIV 7,139,438contains similarity to Pfam domains PF06701 (Mib_herc2) , PF07738 (Sad1 / UNC-like C-terminal) , PF02985 (HEAT repeat) , PF00023 (Ankyrin repeat) (2), PF00632 (HECT-domain (ubiquitin-transferase)) contains similarity to Interpro domains IPR012919 (Sad1/UNC-like, C-terminal), IPR011989 (Armadillo-like helical), IPR000569 (HECT), IPR008979 (Galactose-binding like), IPR002110 (Ankyrin), IPR010606 (Mib-herc2), IPR016024 (Armadillo-type fold)
23F46A8.6F46A8.6n/achrI 11,244,411contains similarity to Homo sapiens hypothetical protein; ENSEMBL:ENSP00000352916
24F56C3.5F56C3.5n/achrX 1,363,402
25ZC518.4ZC518.4n/achrIV 12,367,373contains similarity to Neurospora crassa Hypothetical protein B8B8.120.; TR:Q872S5
26fbxa-153B0391.54e-25chrV 15,608,029fbxa-153 encodes a protein with an N-terminal F-box domain and a C-terminal FTH domain; FBXA-153 has no obvious non-nematode orthologs; FBXA-153 shares N-terminal UNC-13 binding, and thus may share at least some functions, with ERI-1, W04D2.6, and Y55F3AM.13; FBXA-153 has no obvious function in mass RNAi assays.
27F35A5.5F35A5.5n/achrX 3,794,638contains similarity to Interpro domains IPR000694 (Proline-rich region), IPR000976 (Wilm's tumour protein)
28ZC204.6ZC204.6n/achrII 1,644,534
29F33A8.6F33A8.6n/achrII 11,051,217contains similarity to Pfam domain PF00481 Protein phosphatase 2C contains similarity to Interpro domains IPR001932 (Protein phosphatase 2C-related), IPR000222 (), IPR014045 (Protein phosphatase 2C, N-terminal), IPR015655 (Protein phosphatase 2C)
30srab-7C36C5.11n/achrV 3,154,327C. elegans SRAB-7 protein ;
31ptr-9F54G8.5n/achrIII 9,159,358ptr-9 encodes an ortholog of Drosophila and human PTCHD3, which defines one of seven paralogous families of sterol sensing domain (SSD) proteins; PTR-9 is required for normal development in mass RNAi assays.
32H14E04.1H14E04.1n/achrIII 2,404,160contains similarity to Pfam domains PF02353 (Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase) , PF08242 (Methyltransferase domain) , PF08241 (Methyltransferase domain) , PF01209 (ubiE/COQ5 methyltransferase family) contains similarity to Interpro domains IPR004033 (UbiE/COQ5 methyltransferase), IPR003333 (Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase), IPR013217 (Methyltransferase type 12), IPR013216 (Methyltransferase type 11)
33F48B9.8F48B9.8n/achrX 2,175,203contains similarity to Homo sapiens Protein FAM8A1; ENSEMBL:ENSP00000259963
34ceh-10W03A3.1n/achrIII 5,800,012ceh-10 encodes a member of the Paired-like class of homeodomain proteins; the CEH-10 homeodomain is closely related to the homeodomains of two vertebrate retina proteins (Chx10 from mice and Vsx-1 from goldfish); ceh-10 is required for CAN cell fate specification and migration, complete loss of ceh-10 function results in failure of CAN cell migration and loss of expression of CEH-23 and CEH-10 itself in the CAN and AIY interneurons; CEH-10, along with TTX-3 and CEH-23, constitutes a regulatory cascade of transcription factors that controls all sub-type specific features of the AIY interneurons.
35fbxa-81T24C2.49e-18chrX 14,541,293This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
36C14E2.3C14E2.3n/achrX 1,811,106
37ugt-59R11A8.3n/achrIV 10,362,030C. elegans UGT-59 protein; contains similarity to Pfam domain PF00201 UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase contains similarity to Interpro domain IPR002213 (UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase)
38srbc-59R09E12.1n/achrV 779,433C. elegans SRBC-59 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
39F08D12.12F08D12.12n/achrII 2,784,540contains similarity to Homo sapiens hypothetical protein; VG:OTTHUMP00000024537
40C09F5.1C09F5.1n/achrIII 660,714
41W05B2.2W05B2.2n/achrIII 10,963,526contains similarity to Pfam domains PF01683 (EB module) (2), PF00014 (Kunitz/Bovine pancreatic trypsin inhibitor domain) (6)contains similarity to Interpro domains IPR002223 (Proteinase inhibitor I2, Kunitz metazoa), IPR006150 (Cysteine-rich repeat), IPR006149 (Nematode-specific EB region)
42dpr-1R10D12.2n/achrV 13,941,139dpr-1 encodes a putative nuclear hormone receptor that affects endoderm differentiation and may promote entry into the dauer state and maintenance of the dauer state; expressed in the endoderm lineage and localization appears dependent on growth conditions.
43C15A7.2C15A7.2n/achrX 12,072,281contains similarity to Xenopus laevis Transmembrane protein 145.; SW:Q5U239
44srt-12E03D2.4n/achrV 4,241,727C. elegans SRT-12 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
45scl-8C39E9.6n/achrIV 13,072,085C. elegans SCL-8 protein; contains similarity to Pfam domain PF00188 SCP-like extracellular protein contains similarity to Interpro domains IPR014044 (SCP-like extracellular), IPR002413 (Ves allergen), IPR001283 (Allergen V5/Tpx-1 related)
46srh-28ZC404.5n/achrV 6,774,975C. elegans SRH-28 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
47T07C12.8T07C12.8n/achrV 9,954,532contains similarity to Interpro domain IPR000998 (MAM)
48set-24Y43F11A.5n/achrII 12,122,894set-24 encodes a protein with an N-terminal SET domain, followed by two SPK domains; SET-24's domain organization resembles that of SET-5, but SET-24 has no known non-nematode orthologs or C. elegans paralogs; neither set-24(n4909) nor set-24(RNAi) have any obvious phenotypes.
49sri-71D2062.3n/achrII 2,628,473C. elegans SRI-71 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
50C27F2.8C27F2.8n/achrIII 4,994,766contains similarity to Interpro domain IPR000694 (Proline-rich region)