UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description                                       
1B0365.7B0365.70chrV 13,144,616contains similarity to Pfam domain PF08393 Dynein heavy chain, N-terminal region 2 contains similarity to Interpro domains IPR013602 (Dynein heavy chain, N-terminal region 2), IPR000215 (Protease inhibitor I4, serpin)
2T15B7.7T15B7.7n/achrV 6,824,981contains similarity to Pfam domain PF03385 Protein of unknown function, DUF288 contains similarity to Interpro domain IPR005049 (Protein of unknown function DUF288)
3xbx-4C23H5.3n/achrIV 2,115,124C. elegans XBX-4 protein ;
4hlh-26C17C3.8n/achrII 5,533,262C. elegans HLH-26 protein; contains similarity to Pfam domain PF00010 Helix-loop-helix DNA-binding domain contains similarity to Interpro domains IPR001092 (Basic helix-loop-helix dimerisation region bHLH), IPR011598 (Helix-loop-helix DNA-binding)
5F52E1.3F52E1.3n/achrV 8,395,551
6C04A11.2C04A11.2n/achrX 13,667,311contains similarity to Homo sapiens Putative protein TPRXL; ENSEMBL:ENSP00000322097
7C27C7.7C27C7.7n/achrI 11,422,886contains similarity to Pfam domain PF07149 Pes-10 contains similarity to Interpro domain IPR009819 (Pes-10)
8T26E4.5T26E4.5n/achrV 15,787,827contains similarity to Interpro domain IPR008996 ()
9F19H6.3F19H6.3n/achrX 12,369,640contains similarity to Homo sapiens Hypothetical protein; ENSEMBL:ENSP00000302021
10srw-87F57G8.4n/achrV 16,337,424C. elegans SRW-87 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
11F09F9.1F09F9.1n/achrX 4,116,127contains similarity to Dirofilaria immitis Cuticular antigen.; TR:Q965D8
12C08B11.3C08B11.3n/achrII 8,025,126contains similarity to Pfam domain PF01388 ARID/BRIGHT DNA binding domain contains similarity to Interpro domains IPR015880 (Zinc finger, C2H2-like), IPR016024 (Armadillo-type fold), IPR007087 (Zinc finger, C2H2-type), IPR001606 (AT-rich interaction region)
13srg-41T19C4.3n/achrV 11,161,148C. elegans SRG-41 protein; contains similarity to Interpro domains IPR000500 (Connexins), IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
14K10F12.6K10F12.6n/achrIII 399,060
15D1044.4D1044.4n/achrIII 5,521,831
16C07E3.8C07E3.8n/achrII 10,352,798contains similarity to Pfam domain PF06542 Protein of unknown function (DUF1114) contains similarity to Interpro domain IPR009497 (Protein of unknown function DUF1114)
17C06G4.1C06G4.1n/achrIII 7,988,768contains similarity to Pfam domain PF00013 KH domain contains similarity to Interpro domains IPR004087 (K Homology), IPR004088 (K Homology, type 1)
18F16G10.14F16G10.14n/achrII 2,398,093contains similarity to Pfam domain PF02343 Domain of unknown function DUF130 contains similarity to Interpro domain IPR003326 (Protein of unknown function DUF130)
19F46F5.14F46F5.14n/achrII 800,774contains similarity to Pfam domain PF03314 Protein of unknown function, DUF273 contains similarity to Interpro domain IPR004988 (Protein of unknown function DUF273)
20F21D9.8F21D9.8n/achrV 19,279,623contains similarity to Medicago truncatula Pectin methyl-esterase PER precursor (EC 3.1.1.11).; TR:Q9SC90
21taf-13C14A4.10n/achrII 10,605,243taf-13 encodes a predicted member of the transcription initiation factor IID, 18kDa subunit family with similarity to Drosophila Taf13.
22scl-21Y43F8B.5n/achrV 19,495,187C. elegans SCL-21 protein; contains similarity to Pfam domain PF00188 SCP-like extracellular protein contains similarity to Interpro domains IPR014044 (SCP-like extracellular), IPR001283 (Allergen V5/Tpx-1 related)
23W06G6.12W06G6.12n/achrV 16,652,565contains similarity to Methanosarcina mazei Hypothetical protein MM2681.; TR:Q8PTN2
24C18A11.6C18A11.6n/achrX 8,034,037
25F52C6.14F52C6.14n/achrII 1,932,827contains similarity to Interpro domain IPR013032 (EGF-like region, conserved site)
26C10B5.1C10B5.1n/achrV 8,582,501contains similarity to Pfam domain PF00400 WD domain, G-beta repeat contains similarity to Interpro domains IPR011046 (WD40 repeat-like), IPR001680 (WD40 repeat), IPR016160 (Aldehyde dehydrogenase, conserved site), IPR015943 (WD40/YVTN repeat-like)
27Y75B8A.31Y75B8A.31n/achrIII 12,353,159contains similarity to Homo sapiens Isoform 1 of UPF0528 protein C5orf21 precursor; ENSEMBL:ENSP00000265139
28C23G10.5C23G10.5n/achrIII 6,191,540contains similarity to Pfam domain PF07735 F-box associated contains similarity to Interpro domain IPR012885 (F-box associated type 2)
29F44F4.1F44F4.1n/achrII 10,881,580contains similarity to Interpro domain IPR016054 (Ly-6 antigen / uPA receptor -like)
30C48B4.7C48B4.7n/achrIII 9,558,981contains similarity to Xenopus laevis Hypothetical protein.; TR:Q7ZYB3
31F38E9.4F38E9.4n/achrX 16,452,168
32str-233C06C6.2n/achrV 16,008,971C. elegans STR-233 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
33K02E11.6K02E11.6n/achrV 14,251,141contains similarity to Interpro domain IPR002213 (UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase)
34unc-3Y16B4A.1n/achrX 14,778,472The unc-3 gene encodes a protein with homology to immunoglobulin (Ig) domain-containing transcription factors such as OLF-1 or SU(H).
35F55C9.11F55C9.11n/achrV 19,307,376This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins.
36hlh-27C17C3.10n/achrII 5,540,531C. elegans HLH-27 protein; contains similarity to Pfam domain PF00010 Helix-loop-helix DNA-binding domain contains similarity to Interpro domains IPR001092 (Basic helix-loop-helix dimerisation region bHLH), IPR011598 (Helix-loop-helix DNA-binding)
37C32B5.4C32B5.4n/achrII 980,130contains similarity to Interpro domains IPR000931 (Adenovirus fibre protein), IPR008893 (WGR)
38C18H9.2C18H9.2n/achrII 6,690,893contains similarity to Xenopus laevis PERQ amino acid-rich with GYF domain-containing protein 2s(Trinucleotide repeat-containing gene 15 protein).; SW:Q5U236
39srt-61T27C10.1n/achrI 10,905,441C. elegans SRT-61 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
40T24D8.6T24D8.6n/achrX 2,365,815
41C18E3.4C18E3.4n/achrI 4,202,730
42ZK816.3ZK816.3n/achrX 3,348,370
43C14E2.6C14E2.6n/achrX 1,828,107contains similarity to Pfam domain PF01764 Lipase (class 3) contains similarity to Interpro domain IPR002921 (Lipase, class 3)
44C13A2.2C13A2.2n/achrV 7,286,774contains similarity to Pfam domain PF01697 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domain IPR008166 (Protein of unknown function DUF23)
45srx-112T24E12.8n/achrII 3,764,010C. elegans SRX-112 protein ;
46R52.4R52.4n/achrII 2,107,797
47srbc-23C45H4.9n/achrV 2,154,343C. elegans SRBC-23 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
48sre-40T05A7.8n/achrII 4,682,734C. elegans SRE-40 protein; contains similarity to Pfam domain PF03125 C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR004151 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor)
49srh-140Y6E2A.6n/achrV 15,723,067C. elegans SRH-140 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR000484 (Photosynthetic reaction centre, L and M subunits)
50R119.2R119.2n/achrI 370,004contains similarity to Pfam domain PF00557 metallopeptidase family M24 contains similarity to Interpro domains IPR000994 (Peptidase M24, catalytic core), IPR001714 (Peptidase M24, methionine aminopeptidase)