UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description                                       
1B0228.1B0228.19e-124chrII 7,756,388
2nhr-79T26H2.9n/achrV 19,209,750C. elegans NHR-79 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
3ins-4ZK75.1n/achrII 5,996,546ins-4 encodes an insulin-like peptide.
4ZK593.2ZK593.2n/achrIV 10,913,905contains similarity to Paramecium bursaria chlorella virus 1 A105L protein.; TR:Q84426
5C17B7.2C17B7.2n/achrV 3,349,796contains similarity to Pfam domain PF01579 Domain of unknown function DUF19 contains similarity to Interpro domain IPR002542 (Protein of unknown function DUF19)
6ilys-4C55F2.2n/achrIV 7,896,569C. elegans ILYS-4 protein; contains similarity to Pfam domain PF05497 Destabilase contains similarity to Interpro domain IPR008597 (Destabilase)
7F23F1.7F23F1.7n/achrII 39,046contains similarity to Interpro domains IPR011001 (Saposin-like), IPR008139 (Saposin B)
8R07C12.3R07C12.3n/achrIV 4,145,897
9ZC15.1ZC15.1n/achrV 20,302,899contains similarity to Interpro domains IPR001878 (Zn-finger, CCHC type), IPR000345 (Cytochrome c heme-binding site)
10K11D12.8K11D12.8n/achrV 5,040,194
11K09H9.5K09H9.5n/achrI 3,142,441contains similarity to Interpro domain IPR016638 (Uncharacterised conserved protein UPF0376)
12F15D4.3F15D4.3n/achrII 13,237,564contains similarity to Homo sapiens Protein MGR2 homolog; ENSEMBL:ENSP00000338293
13C33H5.13C33H5.13n/achrIV 7,791,950contains similarity to Xenopus tropicalis UPF0467 protein C5orf32 homolog.; SW:Q28H62
14cyp-32A1C26F1.2n/achrV 7,783,180C. elegans CYP-32A1 protein; contains similarity to Pfam domain PF00067 Cytochrome P450 contains similarity to Interpro domains IPR001128 (Cytochrome P450), IPR002401 (Cytochrome P450, E-class, group I), IPR002402 (Cytochrome P450, E-class, group II), IPR000897 (Signal recognition particle, SRP54 subunit, GTPase), IPR002403 (Cytochrome P450, E-class, group IV), IPR002397 (Cytochrome P450, B-class)
15C55H1.1C55H1.1n/achrV 6,851,202contains similarity to Interpro domain IPR002213 (UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase)
16Y37H2C.1Y37H2C.1n/achrV 18,275,256contains similarity to Homo sapiens SIDT1 protein; ENSEMBL:ENSP00000377416
17M03E7.1M03E7.1n/achrV 5,624,123contains similarity to Pfam domain PF00635 MSP (Major sperm protein) domain contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000535 (Major sperm protein)
18F47D12.6F47D12.6n/achrIII 6,286,908
19C25E10.10C25E10.10n/achrV 9,055,890C25E10.10 encodes a putative secreted TIL-domain protease inhibitor paralogous to SWM-1, ISL-1, and the products of 11 other C. elegans genes; C25E10.10 and its relatives are collectively similar to other TIL-domain protease inhibitors from nematodes, insects, and vertebrates; C25E10.10 has no obvious function in mass RNAi assays.
20bra-2F23H11.1n/achrIII 911,744The bra-2 gene encodes a homolog of the human BMP receptor-associated molecule (BRAM1), paralogous to bra-1, that may act upon the SMA-6 TGF-beta signalling pathway
21C34D1.4C34D1.4n/achrV 13,258,178
22C24D10.8C24D10.8n/achrIV 5,165,608n/a
23F14D2.7F14D2.7n/achrII 3,337,168contains similarity to Interpro domain IPR006642 (Zinc finger, Rad18-type putative)
24H32K16.1H32K16.1n/achrI 9,151,388contains similarity to Pfam domain PF01490 Transmembrane amino acid transporter protein contains similarity to Interpro domain IPR013057 (Amino acid transporter, transmembrane)
25C15B12.4C15B12.4n/achrX 6,472,014contains similarity to Interpro domain IPR000158 (Cell division protein FtsZ, N-terminal)
26sue-1F07A5.5n/achrI 7,365,960C. elegans SUE-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF00008 EGF-like domain contains similarity to Interpro domains IPR000742 (EGF-like, type 3), IPR006209 (EGF-like), IPR006210 (EGF), IPR013032 (EGF-like region, conserved site)
27F14D7.5F14D7.5n/achrV 14,299,389contains similarity to Bacteroides thetaiotaomicron Hypothetical protein.; TR:Q8ABS0
28B0524.5B0524.5n/achrIII 1,892,549contains similarity to Homo sapiens hypothetical protein; ENSEMBL:ENSP00000352916
29K03B4.4K03B4.4n/achrV 4,684,430contains similarity to Interpro domain IPR002411 (Cereal allergen/alpha-amylase inhibitor, rice-type)
30F28A10.8F28A10.8n/achrII 838,145contains similarity to Pfam domain PF03762 Vitelline membrane outer layer protein I (VOMI) contains similarity to Interpro domain IPR005515 (Vitelline membrane outer layer protein I (VOMI))
31C49C8.2C49C8.2n/achrIV 8,651,405
32Y8A9A.4Y8A9A.4n/achrII 3,791,066
33acr-15F25G6.4n/achrV 8,554,009A homolog of an alpha type nicotinic acetylcholine receptor subunit involved in the mediation of fast synaptic transmission at neuromuscular junctions.
34ttr-39C04G2.1n/achrIV 10,089,158C. elegans TTR-39 protein; contains similarity to Pfam domain PF01060 Transthyretin-like family contains similarity to Interpro domains IPR008969 (Carboxypeptidase-like, regulatory region), IPR001534 (Transthyretin-like)
35des-2T26H10.1n/achrV 11,417,794des-2 encodes an alpha subunit of nicotinic acetylcholine receptor (nAChR), predicted to be a ligand-gated ion channel regulating the fast action of acetylcholine at neuromuscular junctions and in the nervous system; DES-2 is coexpressed with and genetically interacts with DEG-3, which which it probably forms heteromultimers, and DES-2 falls into the 'DEG-3' class of nAChR subunits, probably unique to nematodes, which includes DEG-3, ACR-5, ACR-17, ACR-18 ACR-20, and ACR-23.
36C49G9.1C49G9.1n/achrI 12,565,152contains similarity to Fugu rubripes Wilms tumour gene.; TR:O93433
37unc-46C04F5.3n/achrV 5,098,120unc-46 encodes a novel protein with a single predicted transmembrane domain; UNC-46 and UNC-47, a novel transmembrane vesicular GABA transporter, are required in GABAergic neurons for all GABA neurotransmission, specifically for loading of GABA into synaptic vesicles, where UNC-46 is localized; UNC-46 localization requires UNC-47, which when overexpressed can rescue unc-46 mutant animals.
38F53F8.4F53F8.4n/achrV 20,686,618contains similarity to Pfam domain PF01682 DB module contains similarity to Interpro domain IPR002602 (Protein of unknown function DB)
39H04M03.12H04M03.12n/achrIV 5,900,480
40srh-100C46E10.10n/achrII 3,713,935C. elegans SRH-100 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
41tig-2F39G3.8n/achrV 4,728,435The tig-2 gene, like dbl-1, daf-7, and unc-129, encodes a TGF-beta-like protein.
42K03A11.5K03A11.5n/achrX 13,066,078contains similarity to Enterobacteria phage RB49 Hypothetical protein.; TR:Q7Y3J5
43rcn-1F54E7.7n/achrIII 5,683,173rcn-1 encodes a calcipressin, which binds and inhibits calcineurin; RCN-1's orthologs include yeast Rcn1p and human DSCR1 (OMIM:602917; overexpressed in Down syndrome and Alzheimer disease); rcn-1 is expressed in hypodermal seam cells, various neurons, vulval epithelial and muscle cells, marginal pharyngeal cells, and in the male tail; rcn-1 transcription is regulated by TAX-6, and RCN-1 binds TAX-6 protein if free Ca[2+] is present; RCN-1 overexpression, like calcineurin deficiency, causes defects in body size, cuticle thickness, fertility, growth rate, and serotonin-resistance in egg-laying.
44C54F6.6C54F6.6n/achrV 7,525,196
45sre-54C50E10.6n/achrII 12,333,899C. elegans SRE-54 protein; contains similarity to Pfam domain PF03125 C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR004151 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor), IPR000366 (Fungal pheromone mating factor STE2 GPCR)
46K03D3.2K03D3.2n/achrIV 16,328,334contains similarity to Sulfolobus tokodaii Hypothetical protein ST0074.; TR:Q976W5
47F11A5.13F11A5.13n/achrV 16,226,353contains similarity to Clostridium acetobutylicum MDR-type permease.; TR:Q97D15
48K10G4.3K10G4.3n/achrV 17,264,477contains similarity to Thermotoga maritima Probable DNA double-strand break repair rad50 ATPase.; SW:RA50_THEMA
49lpr-2T12A7.5n/achrIV 11,783,102C. elegans LPR-2 protein; contains similarity to Interpro domains IPR012674 (Calycin), IPR011038 (Calycin-like), IPR002345 (Lipocalin)
50fip-3C06E1.5n/achrIII 8,589,320C. elegans FIP-3 protein ;