UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1B0222.5B0222.50chrV 9,153,570contains similarity to Pfam domains PF00014 (Kunitz/Bovine pancreatic trypsin inhibitor domain) , PF00086 (Thyroglobulin type-1 repeat) contains similarity to Interpro domains IPR000716 (Thyroglobulin type-1), IPR002223 (Proteinase inhibitor I2, Kunitz metazoa)
2cdr-5K01D12.14n/achrV 12,409,917C. elegans CDR-5 protein; contains similarity to Pfam domain PF00043 Glutathione S-transferase, C-terminal domain contains similarity to Interpro domains IPR012336 (Thioredoxin-like fold), IPR004046 (Glutathione S-transferase, C-terminal), IPR010987 (Glutathione S-transferase, C-terminal-like)
3smgl-1F20G4.1n/achrI 7,922,384C. elegans SMGL-1 protein; contains similarity to Interpro domain IPR011046 (WD40 repeat-like)
4T20D4.12T20D4.12n/achrV 3,397,421contains similarity to Pfam domain PF01579 Domain of unknown function DUF19 contains similarity to Interpro domains IPR016638 (Uncharacterised conserved protein UPF0376), IPR002542 (Protein of unknown function DUF19)
5kin-16M176.7n/achrII 9,435,019kin-16 encodes a novel receptor protein tyrosine kinase; like kin-15, with which it is cotranscribed, kin-16 encodes a protein that displays some unusual features, including a very small extracellular domain (50 amino acids) that lacks a cysteine-rich region typical of ligand-binding domains of known receptor tyrosine kinases, an unusual amino acid substitution in the subdomain VI motif, and a lack of typical autophosphorylation sites in the kinase insert and C-terminal domains; a kin-16 reporter is first detected in young L1 larvae in the hyp7 syncytium; later expression is detected in ventral and lateral cells that fuse with hyp7 as well as in the more anterior hyp6 syncytium late in development; this distinct expression pattern suggests that kin-16 may also play a role in development of the hypodermal syncytium and perhaps be involved in cell-cell interactions regulating postembryonic cell fusions.
6F16H6.5F16H6.5n/achrV 18,202,582contains similarity to Pfam domain PF06162 Caenorhabditis elegans protein of unknown function (DUF976) contains similarity to Interpro domains IPR010381 (Protein of unknown function DUF976, Caenorhabditis species), IPR016125 (Peptidase C15, pyroglutamyl peptidase I-like)
7Y40H7A.9Y40H7A.9n/achrIV 15,207,561contains similarity to Pfam domains PF01461 (7TM chemoreceptor) , PF00112 (Papain family cysteine protease) contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR013128 (Peptidase C1A, papain), IPR000668 (Peptidase C1A, papain C-terminal)
8T20D4.10T20D4.10n/achrV 3,400,606contains similarity to Pfam domain PF01579 Domain of unknown function DUF19 contains similarity to Interpro domains IPR016638 (Uncharacterised conserved protein UPF0376), IPR002542 (Protein of unknown function DUF19)
9C30H6.8C30H6.8n/achrIV 17,382,648contains similarity to Pfam domain PF00085 Thioredoxin contains similarity to Interpro domains IPR012336 (Thioredoxin-like fold), IPR012335 (Thioredoxin fold), IPR013766 (Thioredoxin domain), IPR006662 (Thioredoxin-related)
10R08E3.2R08E3.2n/achrX 4,823,223contains similarity to Interpro domains IPR001438 (EGF-like, type 2), IPR000742 (EGF-like, type 3), IPR013032 (EGF-like region, conserved site)
11C07H4.1C07H4.1n/achrII 9,091,587contains similarity to Oceanobacillus iheyensis Hypothetical conserved protein.; TR:Q8ETI8
12scl-27ZK6.3n/achrV 400,930C. elegans SCL-27 protein; contains similarity to Pfam domain PF00188 SCP-like extracellular protein contains similarity to Interpro domains IPR014044 (SCP-like extracellular), IPR001283 (Allergen V5/Tpx-1 related)
13sptf-2T22C8.5n/achrII 8,626,542C. elegans SPTF-2 protein; contains similarity to Pfam domain PF00096 Zinc finger, C2H2 type contains similarity to Interpro domains IPR015880 (Zinc finger, C2H2-like), IPR013087 (Zinc finger, C2H2-type/integrase, DNA-binding), IPR003656 (Zinc finger, BED-type predicted), IPR007087 (Zinc finger, C2H2-type)
14math-17C16C4.9n/achrII 1,880,205C. elegans MATH-17 protein; contains similarity to Pfam domain PF00917 MATH domain contains similarity to Interpro domains IPR008974 (TRAF-like), IPR002083 (MATH)
15C04E12.6C04E12.6n/achrV 3,355,089contains similarity to Pfam domain PF06162 Caenorhabditis elegans protein of unknown function (DUF976) contains similarity to Interpro domains IPR010381 (Protein of unknown function DUF976, Caenorhabditis species), IPR016125 (Peptidase C15, pyroglutamyl peptidase I-like)
16R09D1.10R09D1.10n/achrII 9,465,285contains similarity to Pfam domain PF00704 Glycosyl hydrolases family 18 contains similarity to Interpro domains IPR011583 (Chitinase II), IPR017853 (Glycoside hydrolase, catalytic core), IPR001223 (Glycoside hydrolase, family 18, catalytic domain), IPR013781 (Glycoside hydrolase, subgroup, catalytic core)
17srh-214T20B3.4n/achrV 16,828,966C. elegans SRH-214 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
18K09E3.5K09E3.5n/achrX 17,109,938contains similarity to Pfam domain PF03353 DUF278 contains similarity to Interpro domain IPR005020 (Protein of unknown function DUF278)
19Y12A6A.1Y12A6A.1n/achrX 13,620,760
20C26E6.1C26E6.1n/achrIII 4,957,176contains similarity to Interpro domain IPR011009 (Protein kinase-like)
21scl-20ZK384.2n/achrV 18,733,634C. elegans SCL-20 protein; contains similarity to Pfam domain PF00188 SCP-like extracellular protein contains similarity to Interpro domains IPR014044 (SCP-like extracellular), IPR002413 (Ves allergen), IPR001283 (Allergen V5/Tpx-1 related)
22ZK228.1ZK228.1n/achrV 18,445,683contains similarity to Mus musculus SOX-13 protein.; SW:SX13_MOUSE
23B0507.9B0507.9n/achrV 8,765,471
24C01B4.6C01B4.6n/achrV 2,501,738contains similarity to Pfam domain PF01263 Aldose 1-epimerase contains similarity to Interpro domains IPR008183 (Aldose 1-epimerase), IPR015443 (Aldose-1-epimerase), IPR011013 (Glycoside hydrolase-type carbohydrate-binding), IPR014718 (Glycoside hydrolase-type carbohydrate-binding, subgroup)
25E04F6.12E04F6.12n/achrII 7,217,217
26snt-2F42G9.7n/achrIII 789,889C. elegans SNT-2 protein; contains similarity to Pfam domain PF00168 C2 domain contains similarity to Interpro domains IPR001565 (Synaptotagmin), IPR008973 (C2 calcium/lipid-binding region, CaLB), IPR000008 (C2 calcium-dependent membrane targeting)
27F25E2.2F25E2.2n/achrX 808,888contains similarity to Pfam domain PF01549 ShK domain-like contains similarity to Interpro domain IPR003582 (Metridin-like ShK toxin)
28F53F10.3F53F10.3n/achrI 3,827,677contains similarity to Pfam domain PF03650 Uncharacterised protein family (UPF0041) contains similarity to Interpro domain IPR005336 (Protein of unknown function UPF0041)
29T22B7.7T22B7.7n/achrX 5,652,816contains similarity to Homo sapiens CGI16-iso; ENSEMBL:ENSP00000368599
30clec-27Y102A5B.1n/achrV 16,855,370C. elegans CLEC-27 protein; contains similarity to Pfam domain PF00059 Lectin C-type domain contains similarity to Interpro domains IPR003990 (Pancreatitis-associated protein), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
31srh-70T21B4.9n/achrII 12,517,220C. elegans SRH-70 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
32bcmo-2F53C3.12n/achrII 3,909,661C. elegans BCMO-2 protein; contains similarity to Pfam domain PF03055 Retinal pigment epithelial membrane protein contains similarity to Interpro domains IPR004294 (Carotenoid oxygenase), IPR015123 (Bcr-Abl oncoprotein oligomerisation)
33tag-244C34H4.3n/achrIV 1,551,970C. elegans TAG-244 protein; contains similarity to Pfam domain PF03409 Protein of unknown function (DUF274) contains similarity to Interpro domain IPR005071 (Protein of unknown function DUF274)
34ZK1193.4ZK1193.4n/achrX 424,854
35T13C5.5T13C5.5n/achrX 6,203,287n/a
36C33A11.2C33A11.2n/achrX 15,367,917contains similarity to Drosophila melanogaster Flybase gene name is CG4025-PA;; FLYBASE:CG4025
37srw-43F14F8.5n/achrV 16,686,204C. elegans SRW-43 protein; contains similarity to Pfam domain PF06976 Protein of unknown function (DUF1300) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR010726 (Protein of unknown function DUF1300), IPR001991 (Sodium:dicarboxylate symporter), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
38gly-14M01F1.1n/achrIII 3,491,809gly-14 encodes a UDP-N-acetyl-D-glucosamine:alpha-3-D-mannoside beta-1, 2-N-acetylglucosaminyltransferase I (GnT 1); GLY-14 exhibits GnT 1 activity when assayed in vitro; a gly-14::lacZ reporter construct is expressed only in the intestine throughout larval and adult stages, with expression generally restricted to the anterior and posterior gut cells.
39C08E8.2C08E8.2n/achrV 18,354,641contains similarity to Pfam domain PF03088 Strictosidine synthase contains similarity to Interpro domains IPR004141 (Strictosidine synthase), IPR011042 (Six-bladed beta-propeller, TolB-like)
40B0432.4B0432.4n/achrII 287,664contains similarity to Pfam domain PF00153 Mitochondrial carrier protein contains similarity to Interpro domains IPR001993 (Mitochondrial substrate carrier), IPR002067 (Mitochondrial carrier protein), IPR002030 (Mitochondrial brown fat uncoupling protein), IPR002113 (Adenine nucleotide translocator 1)
41F09C12.6F09C12.6n/achrII 5,117,137contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
42C08H9.13C08H9.13n/achrII 9,870,236contains similarity to Pfam domain PF00704 Glycosyl hydrolases family 18 contains similarity to Interpro domains IPR003624 (Leukemia inhibitory factor), IPR011583 (Chitinase II), IPR017853 (Glycoside hydrolase, catalytic core), IPR001223 (Glycoside hydrolase, family 18, catalytic domain), IPR013781 (Glycoside hydrolase, subgroup, catalytic core)
43clec-24F49A5.4n/achrV 16,863,042C. elegans CLEC-24 protein; contains similarity to Pfam domain PF00059 Lectin C-type domain contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
44C28F5.1C28F5.1n/achrII 7,506,343
45ceeh-2K07C5.5n/achrV 10,357,064ceeh-2 encodes a soluble epoxide hydrolase (sEH) orthologous to human ABHD7 and ABHD9; recombinant CEEH-2 is biochemically active in vitro on epoxyeicosatrienoic acids and leukotoxins (EpOMEs); conversely, CEEH-2 is inhibited by urea-based antagonists of mammalian sEH that elevate EpOME levels when fed to C. elegans; perhaps because of genetic redundancy with its paralog CEEH-1, CEEH-2 has no obvious function in mass RNAi assays.
46F59D6.2F59D6.2n/achrV 3,028,937contains similarity to Pfam domain PF00026 Eukaryotic aspartyl protease contains similarity to Interpro domains IPR009007 (Peptidase aspartic, catalytic), IPR001461 (Peptidase A1)
47B0564.9B0564.9n/achrIV 13,137,002contains similarity to Pfam domains PF00560 (Leucine Rich Repeat) , PF07723 (Leucine Rich Repeat) contains similarity to Interpro domain IPR006553 (Leucine-rich repeat, cysteine-containing subtype)
48C05E11.2C05E11.2n/achrX 4,587,427
49srbc-22C45H4.8n/achrV 2,157,702C. elegans SRBC-22 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
50K09H11.5K09H11.5n/achrV 5,728,063