UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1sra-2AH6.60chrII 9,529,242C. elegans SRA-2 protein; contains similarity to Pfam domain PF02117 C.elegans Sra family integral membrane protein contains similarity to Interpro domain IPR000344 (Nematode chemoreceptor, Sra)
2W05F2.7W05F2.7n/achrI 3,357,913contains similarity to Interpro domain IPR000694 (Proline-rich region)
3nhr-79T26H2.9n/achrV 19,209,750C. elegans NHR-79 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
4skr-9C52D10.7n/achrIV 17,163,837skr-9 encodes a homolog of Skp1 in S. cerevisiae, a component of the SCF (Skp1, Cullin, F-box) ubiquitin-ligase complex that regulates ubiquitin-mediated protein degradation; SKR-9 is required for posterior body morphogenesis, embryonic and larval development, and postembryonic cell proliferation.
5dnj-9F11G11.7n/achrII 4,854,916This gene encodes a protein containing a DnaJ ('J') domain.
6cyp-33C3F41B5.4n/achrV 2,243,821C. elegans CYP-33C3 protein; contains similarity to Pfam domain PF00067 Cytochrome P450 contains similarity to Interpro domains IPR001128 (Cytochrome P450), IPR002401 (Cytochrome P450, E-class, group I), IPR002403 (Cytochrome P450, E-class, group IV), IPR002397 (Cytochrome P450, B-class)
7srh-282T21D12.5n/achrIV 272,850C. elegans SRH-282 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
8F22G12.1F22G12.1n/achrI 13,140,448contains similarity to Interpro domain IPR000423 (Flagellar protein FlgJ type-1)
9T06C12.11T06C12.11n/achrV 15,893,552contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
10srg-28T09D3.2n/achrV 5,335,592C. elegans SRG-28 protein; contains similarity to Pfam domain PF02118 C.elegans Srg family integral membrane protein contains similarity to Interpro domain IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
11sra-21F28C12.57.999999999999999e-19chrI 12,700,219C. elegans SRA-21 protein; contains similarity to Pfam domain PF02117 C.elegans Sra family integral membrane protein contains similarity to Interpro domain IPR000344 (Nematode chemoreceptor, Sra)
12twk-4ZK1067.5n/achrII 9,192,128C. elegans TWK-4 protein; contains similarity to Pfam domain PF07885 Ion channel contains similarity to Interpro domains IPR003280 (Potassium channel, two pore-domain), IPR003938 (Potassium channel, voltage-dependent, EAG/ELK/ERG), IPR013099 (Ion transport 2), IPR003092 (Potassium channel, two pore-domain, TASK)
13C01B7.5C01B7.5n/achrV 8,800,549contains similarity to Pfam domain PF00595 PDZ domain (Also known as DHR or GLGF) contains similarity to Interpro domain IPR001478 (PDZ/DHR/GLGF)
14math-49ZK250.7n/achrII 1,954,675C. elegans MATH-49 protein; contains similarity to Pfam domain PF00917 MATH domain contains similarity to Interpro domains IPR008974 (TRAF-like), IPR002083 (MATH)
15fbxb-46K05F6.9n/achrII 1,570,610This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; its encoded protein also contains a Pfam-B45 motif of presently unknown function.
16ceh-33C10G8.7n/achrV 5,323,911ceh-33 encodes a Six/sine oculis class homeodomain transcription factor; preliminary RNAi experiments suggest that CEH-33 activity may be required for gonad development; a ceh-33::gfp reporter shows very weak pharyngeal expression in late embryos and early larvae.
17T22C8.2T22C8.2n/achrII 8,616,005contains similarity to Pfam domain PF01630 Hyaluronidase contains similarity to Interpro domains IPR013785 (Aldolase-type TIM barrel), IPR001968 (Glycoside hydrolase, family 56), IPR000742 (EGF-like, type 3), IPR017853 (Glycoside hydrolase, catalytic core), IPR013032 (EGF-like region, conserved site), IPR017430 (Glycoside hydrolase,family 56,Hyaluronidase), IPR001329 (Glycoside hydrolase, family 56, allergen Api/Dol m 2)
18C26C6.6C26C6.6n/achrI 7,506,305contains similarity to Pfam domain PF00412 LIM domain contains similarity to Interpro domain IPR001781 (Zinc finger, LIM-type)
19srb-11F23F12.10n/achrIII 6,492,077C. elegans SRB-11 protein; contains similarity to Pfam domains PF02117 (C.elegans Sra family integral membrane protein) , PF02175 (C.elegans integral membrane protein Srb) contains similarity to Interpro domains IPR002184 (Serpentine beta receptor), IPR000344 (Nematode chemoreceptor, Sra)
20Y75B12B.8Y75B12B.8n/achrV 15,201,905contains similarity to Homo sapiens Xylosyltransferase I; ENSEMBL:ENSP00000261381
21T09E11.6T09E11.6n/achrI 12,367,467contains similarity to Pfam domain PF02485 Core-2/I-Branching enzyme contains similarity to Interpro domain IPR003406 (Glycosyl transferase, family 14)
22E02C12.9E02C12.9n/achrV 9,374,371contains similarity to Pfam domains PF02958 (Domain of unknown function (DUF227)) , PF07914 (Protein of unknown function (DUF1679)) contains similarity to Interpro domains IPR011009 (Protein kinase-like), IPR012877 (Protein of unknown function DUF1679, Caenorhabditis species), IPR004119 (Protein of unknown function DUF227), IPR015897 (CHK kinase-like)
23C02E7.10C02E7.10n/achrV 4,931,908
24F36H5.9F36H5.9n/achrII 1,752,922This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; its encoded protein also contains a Pfam-B45 motif of presently unknown function.
25ZK250.9ZK250.9n/achrII 1,965,500contains similarity to Pfam domain PF05970 Eukaryotic protein of unknown function (DUF889) contains similarity to Interpro domains IPR010285 (Protein of unknown function DUF889, eukaryote), IPR003593 (AAA+ ATPase, core), IPR006034 (Asparaginase/glutaminase)
26C04B4.4C04B4.4n/achrX 12,291,546contains similarity to Saccharomyces cerevisiae Nucleolar protein involved in exit from mitosis; SGD:YJL076W
27E01G4.5E01G4.5n/achrII 13,473,085contains similarity to Interpro domains IPR002345 (Lipocalin), IPR000215 (Protease inhibitor I4, serpin)
28ZC376.1ZC376.1n/achrV 14,179,216contains similarity to Pfam domain PF00135 Carboxylesterase contains similarity to Interpro domain IPR002018 (Carboxylesterase, type B)
29T05H4.3T05H4.3n/achrV 6,444,929contains similarity to Pfam domain PF00560 Leucine Rich Repeat contains similarity to Interpro domains IPR001611 (Leucine-rich repeat), IPR003591 (Leucine-rich repeat, typical subtype), IPR003603 (U2A'/phosphoprotein 32 family A, C-terminal)
30str-64T28A11.1n/achrV 3,283,924C. elegans STR-64 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
31srh-276F21A3.1n/achrV 15,530,042C. elegans SRH-276 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
32sra-18F28C12.20.000000000000001chrI 12,692,935C. elegans SRA-18 protein; contains similarity to Pfam domain PF02117 C.elegans Sra family integral membrane protein contains similarity to Interpro domain IPR000344 (Nematode chemoreceptor, Sra)
33C03B1.4C03B1.4n/achrX 6,365,064
34srd-27T26E4.12n/achrV 15,803,891C. elegans SRD-27 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
35scrm-2ZK1053.5n/achrI 13,235,906scrm-2 encodes a putative phospholipid scramblase homologous to human PLSCR1-5, and paralogous to other C. elegans SCRMs (e.g., SCRM-1); in apoptotic germline cells, SCRM-2 is fully dispensable for normally rapid engulfment and largely dispensable for phosphatidylserine exposure; SCRM-2 does not bind WAH-1 in vitro, and scrm-2(tm650) mutants have no obvious phenotype.
36srbc-67T24A6.10n/achrV 3,539,627C. elegans SRBC-67 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
37srz-14K05D4.3n/achrV 16,184,163C. elegans SRZ-14 protein ;
38F28G4.2F28G4.2n/achrV 16,281,423contains similarity to Pfam domain PF03407 Protein of unknown function (DUF271) contains similarity to Interpro domain IPR005069 (Protein of unknown function DUF271)
39srx-42C06B3.11n/achrV 13,921,696C. elegans SRX-42 protein; contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
40T22H9.1T22H9.1n/achrV 361,718contains similarity to Pfam domain PF06102 Domain of unknown function (DUF947) contains similarity to Interpro domain IPR009292 (Protein of unknown function DUF947)
41F31A9.4F31A9.4n/achrX 1,779,978
42T22D1.11T22D1.11n/achrIV 6,927,277contains similarity to Pfam domain PF00135 Carboxylesterase contains similarity to Interpro domain IPR002018 (Carboxylesterase, type B)
43C47E8.6C47E8.6n/achrV 14,690,485contains similarity to Pfam domains PF07735 (F-box associated) , PF00646 (F-box domain) contains similarity to Interpro domains IPR001810 (Cyclin-like F-box), IPR012885 (F-box associated type 2)
44nhr-72C17A2.8n/achrII 3,849,882C. elegans NHR-72 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
45R05H5.4R05H5.4n/achrII 10,198,961contains similarity to Pfam domains PF07714 (Protein tyrosine kinase) , PF00069 (Protein kinase domain) contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related), IPR000980 (SH2 motif), IPR008266 (Tyrosine protein kinase, active site)
46srsx-37M01B2.7n/achrV 15,258,341C. elegans SRSX-37 protein; contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
47rsp-2W02B12.2n/achrII 11,452,115C. elegans RSP-2 protein; contains similarity to Pfam domain PF00076 RNA recognition motif. (a.k.a. RRM, RBD, or RNP domain) contains similarity to Interpro domains IPR012677 (Nucleotide-binding, alpha-beta plait), IPR000504 (RNA recognition motif, RNP-1)
48F20D1.9F20D1.9n/achrX 15,002,884contains similarity to Pfam domain PF00153 Mitochondrial carrier protein contains similarity to Interpro domains IPR002067 (Mitochondrial carrier protein), IPR001993 (Mitochondrial substrate carrier), IPR002113 (Adenine nucleotide translocator 1)
49T20D4.9T20D4.9n/achrV 3,404,051T20D4.9 encodes a neprilysin; neprilysins are thermolysin-like zinc metallopeptidases, found on the outer surface of animal cells, that negatively regulate small signalling peptides (e.g., enkephalin, tachykinin, insulin, and natriuretic peptides) by cleaving them; T20D4.9 has no clear orthologs in other organisms.
50srx-17F55B12.8n/achrV 13,841,443C. elegans SRX-17 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)