UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1sra-8AH6.120chrII 9,538,328C. elegans SRA-8 protein; contains similarity to Pfam domain PF02117 C.elegans Sra family integral membrane protein contains similarity to Interpro domain IPR000344 (Nematode chemoreceptor, Sra)
2C54G4.4C54G4.4n/achrI 7,999,947contains similarity to Pfam domain PF00084 Sushi domain (SCR repeat) contains similarity to Interpro domains IPR002396 (Selectin (CD62E/L/P antigen)), IPR006585 (Fucolectin tachylectin-4 pentraxin-1), IPR000436 (Sushi/SCR/CCP), IPR000694 (Proline-rich region), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016060 (Complement control module), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
3srz-47Y68A4A.2n/achrV 17,191,554C. elegans SRZ-47 protein ;
4T23F6.5T23F6.5n/achrIV 12,736,831contains similarity to Escherichia coli O157:H7 Hypothetical protein ECs1561.; TR:Q8X5G5
5gpa-13F18E2.5n/achrV 12,753,806gpa-13 encodes a member of the G protein alpha subunit family of heterotrimeric GTPases; it is expressed in ADF, ASH, AWC, PHA, and PHB.
6tsp-20B0198.1n/achrX 12,032,731C. elegans TSP-20 protein; contains similarity to Pfam domain PF00335 Tetraspanin family contains similarity to Interpro domains IPR000301 (CD9/CD37/CD63 antigen), IPR008952 (Tetraspanin)
7C46H11.1C46H11.1n/achrI 5,055,865
8W10G11.4W10G11.4n/achrII 3,563,054contains similarity to Pfam domain PF01579 Domain of unknown function DUF19 contains similarity to Interpro domains IPR016638 (Uncharacterised conserved protein UPF0376), IPR002542 (Protein of unknown function DUF19)
9C37E2.3C37E2.3n/achrX 14,180,268contains similarity to Pfam domain PF04750 FAR-17a/AIG1-like protein contains similarity to Interpro domains IPR006838 (FAR-17a/AIG1-like protein), IPR002208 (SecY protein)
10K02D3.2K02D3.2n/achrX 13,710,264contains similarity to Pfam domain PF01852 START domain contains similarity to Interpro domain IPR002913 (Lipid-binding START)
11B0495.6B0495.6n/achrII 7,698,778contains similarity to Pfam domain PF07189 Splicing factor 3B subunit 10 (SF3b10) contains similarity to Interpro domain IPR009846 (Splicing factor 3B subunit 5/RDS3 complex subunit 10)
12srw-136K12D9.10n/achrV 3,009,736C. elegans SRW-136 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
13nhr-255ZK678.2n/achrX 15,743,376C. elegans NHR-255 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000679 (Zinc finger, GATA-type), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
14F13B12.3F13B12.3n/achrIV 10,441,433contains similarity to Tetraodon nigroviridis Chromosome 12 SCAF8721, whole genome shotgun sequence. (Fragment).; TR:Q4T6K3
15M6.4M6.4n/achrX 631,028
16C17B7.10C17B7.10n/achrV 3,341,460C17B7.10 encodes a neprilysin; neprilysins are thermolysin-like zinc metallopeptidases, found on the outer surface of animal cells, that negatively regulate small signalling peptides (e.g., enkephalin, tachykinin, insulin, and natriuretic peptides) by cleaving them; C17B7.10 has no clear orthologs in other organisms.
17T21H8.5T21H8.5n/achrX 13,878,684contains similarity to Interpro domain IPR000515 (Binding-protein-dependent transport systems inner membrane component)
18cyp-25A5F42A6.4n/achrIV 3,328,559C. elegans CYP-25A5 protein; contains similarity to Pfam domain PF00067 Cytochrome P450 contains similarity to Interpro domains IPR001128 (Cytochrome P450), IPR002401 (Cytochrome P450, E-class, group I), IPR002402 (Cytochrome P450, E-class, group II), IPR002403 (Cytochrome P450, E-class, group IV), IPR002397 (Cytochrome P450, B-class)
19T23F6.2T23F6.2n/achrIV 12,722,330
20ZK1240.2ZK1240.2n/achrII 2,324,281contains similarity to Pfam domain PF00097 Zinc finger, C3HC4 type (RING finger) contains similarity to Interpro domains IPR001841 (Zinc finger, RING-type), IPR013083 (Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type), IPR000315 (Zinc finger, B-box)
21nhr-241Y69H2.8n/achrV 18,700,186C. elegans NHR-241 protein
22srd-69H04J21.2n/achrIII 2,364,601C. elegans SRD-69 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
23fut-2EGAP9.2n/achrV 6,574,873fut-2 encodes a unique alpha 1,2-fucosyltransferase specifically expressed in intestinal cells of larval and adult animals; recombinant FUT-2 expressed in human 293T cells exhibits a novel acceptor specificity profile compared with mammalian alpha 1,2-fucosyltransferases and the predicted protein shares very low amino acid identity with human alpha 1,2-fucosyltransferases, but its predicted type 2 topology and domain structure are typical of other glucosyltransferases.
24his-45B0035.10n/achrIV 11,326,794his-45 encodes an H3 histone.
25T05G5.5T05G5.5n/achrIII 9,750,414contains similarity to Pfam domain PF01121 Dephospho-CoA kinase contains similarity to Interpro domains IPR000764 (Uridine kinase), IPR001977 (Dephospho-CoA kinase)
26scl-27ZK6.3n/achrV 400,930C. elegans SCL-27 protein; contains similarity to Pfam domain PF00188 SCP-like extracellular protein contains similarity to Interpro domains IPR014044 (SCP-like extracellular), IPR001283 (Allergen V5/Tpx-1 related)
27srj-29F22B8.1n/achrV 16,076,456C. elegans SRJ-29 protein; contains similarity to Pfam domains PF00060 (Ligand-gated ion channel) , PF01094 (Receptor family ligand binding region) contains similarity to Interpro domains IPR001638 (Bacterial extracellular solute-binding protein, family 3), IPR015683 (Glutamate receptor-related), IPR001320 (Ionotropic glutamate receptor), IPR001828 (Extracellular ligand-binding receptor), IPR001508 (NMDA receptor)
28str-225C07G3.6n/achrV 3,508,534C. elegans STR-225 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR001307 (Thiosulphate sulphurtransferase, conserved site)
29F52E1.9F52E1.9n/achrV 8,398,736contains similarity to Interpro domain IPR011332 (Ribosomal protein, zinc-binding)
30tbx-31C36C9.2n/achrX 1,672,652tbx-31 encodes a diverged member of the T-box transcription factor family; by homology, TBX-31 is predicted to function as a transcriptional regulator during development, but as loss of tbx-31 activity via RNAi results in no obvious defects, the precise role of TBX-31 in C. elegans development and/or behavior is not yet known.
31srj-44T03D3.11n/achrV 2,845,216C. elegans SRJ-44 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
32sma-3R13F6.9n/achrIII 6,862,404sma-3 encodes a Smad protein; during development, SMA-3 functions as part of a DBL-1/SMA-6 TGF-beta-related signaling pathway that controls body size and male tail sensory ray and spicule formation; sma-3 is widely expressed at all developmental stages, beginning during embryogenesis, continuing through all larval stages, and seen very strongly in adult hermaphrodites and males; a SMA-3::GFP is detected in the pharynx, intestine, and hypodermis and localizes to the nucleus; sma-3 expression in the hypodermis is necessary and sufficient for normal body size; SMA-3 can physically interact with the LIN-31 forkhead transcription factor.
33F38B6.6F38B6.6n/achrX 6,687,229contains similarity to Pfam domains PF07719 (Tetratricopeptide repeat) (4), PF08409 (Domain of unknown function (DUF1736)) , PF00515 (Tetratricopeptide repeat) (5)contains similarity to Interpro domains IPR011990 (Tetratricopeptide-like helical), IPR013618 (Region of unknown function DUF1736), IPR008940 (Protein prenyltransferase), IPR001440 (Tetratricopeptide TPR-1), IPR013105 (Tetratricopeptide TPR2), IPR013026 (Tetratricopeptide region)
34C39D10.1C39D10.1n/achrX 7,906,986
35C01B12.3C01B12.3n/achrII 14,491C01B12.3 is orthologous to the human gene VITELLIFORM MACULAR DYSTROPHY PROTEIN (VMD2; OMIM:153700), which when mutated leads to disease.
36Y39A1A.8Y39A1A.8n/achrIII 10,627,062contains similarity to Pfam domain PF03083 MtN3/saliva family contains similarity to Interpro domain IPR004316 (MtN3 and saliva related transmembrane protein)
37B0302.4B0302.4n/achrX 17,176,549
38clec-182C33D9.2n/achrIV 8,797,600C. elegans CLEC-182 protein; contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
39Y62H9A.7Y62H9A.7n/achrX 11,885,307contains similarity to Mus musculus Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterases1A (EC 3.1.4.17) (Cam-PDE 1A) (61 kDa Cam-PDE).; SW:CN1A_MOUSE
40str-23C55A1.5n/achrV 15,645,650C. elegans STR-23 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
41str-256T01G6.9n/achrV 500,551C. elegans STR-256 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
42F10E7.2F10E7.2n/achrII 7,123,253contains similarity to Schistocerca gregaria Homeobox protein abdominal-A homolog (Fragment).; SW:P29556
43srw-79T11F1.5n/achrII 2,947,802C. elegans SRW-79 protein; contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
44F40D4.12F40D4.12n/achrV 17,161,146contains similarity to Pfam domains PF01827 (FTH domain) , PF00646 (F-box domain) contains similarity to Interpro domains IPR002900 (Protein of unknown function DUF38, Caenorhabditis species), IPR001810 (Cyclin-like F-box)
45srx-68K07C6.11n/achrV 3,913,635C. elegans SRX-68 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
46F14E5.1F14E5.1n/achrII 8,418,639contains similarity to Pfam domains PF07690 (Major Facilitator Superfamily) , PF00083 (Sugar (and other) transporter) contains similarity to Interpro domains IPR007114 (Major facilitator superfamily), IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR005829 (Sugar transporter, conserved site), IPR005828 (General substrate transporter), IPR003663 (Sugar transporter), IPR002455 (GPCR, family 3, gamma-aminobutyric acid receptor, type B), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
47B0507.5B0507.5n/achrV 8,754,261
48T10H10.2T10H10.2n/achrX 2,296,444contains similarity to Pfam domains PF04777 (Erv1 / Alr family) , PF00085 (Thioredoxin) contains similarity to Interpro domains IPR012336 (Thioredoxin-like fold), IPR012335 (Thioredoxin fold), IPR006863 (Erv1/Alr), IPR013766 (Thioredoxin domain), IPR006662 (Thioredoxin-related)
49B0399.2B0399.2n/achrV 19,551,938contains similarity to Pfam domain PF01757 Acyltransferase family contains similarity to Interpro domain IPR002656 (Acyltransferase 3)
50F15A4.5F15A4.5n/achrII 12,470,242contains similarity to Plasmodium falciparum Hypothetical protein.; TR:Q8ICX2