Affine Alignment
  
Alignment between aqp-3 (top Y69E1A.7 421aa) and aqp-3 (bottom Y69E1A.7 421aa) score 42123

001 MLSDSSCSSSDRSFKFPFDTTDALSIHELAVKDLPKPDAENPFSVAMHSPPGSPPFAVDR 060
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
001 MLSDSSCSSSDRSFKFPFDTTDALSIHELAVKDLPKPDAENPFSVAMHSPPGSPPFAVDR 060

061 KSVDNSVVAVTDTPFEFAPSQKSSQHTNRPPPFVKPEEEMMYINHVERLKPKFAIGNELI 120
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
061 KSVDNSVVAVTDTPFEFAPSQKSSQHTNRPPPFVKPEEEMMYINHVERLKPKFAIGNELI 120

121 RAFLAELFCTGFLVFGGECVNAQYVLSQGKNNEWIGISVGWGLVLMLAVLMGSKISGAHL 180
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
121 RAFLAELFCTGFLVFGGECVNAQYVLSQGKNNEWIGISVGWGLVLMLAVLMGSKISGAHL 180

181 NPAVSFFQLTQGKINLIRFLVYAVAQNIGAFLGAFGVFCVYYDAINVFEGGNRTVTGPTA 240
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
181 NPAVSFFQLTQGKINLIRFLVYAVAQNIGAFLGAFGVFCVYYDAINVFEGGNRTVTGPTA 240

241 TASIFATYPGPFLGTFNAIVDQIAGTLVLCLGVAAITDRRNGIPAFLQPAWIGALLAFLG 300
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
241 TASIFATYPGPFLGTFNAIVDQIAGTLVLCLGVAAITDRRNGIPAFLQPAWIGALLAFLG 300

301 MSLALNAGYAINPARDFAPRLFNLCAGYGWEVFSYRNYKWFWIPIICPMIGGVLGAWLYE 360
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
301 MSLALNAGYAINPARDFAPRLFNLCAGYGWEVFSYRNYKWFWIPIICPMIGGVLGAWLYE 360

361 FFIGFHIQDEDAVSLDSESDKQLKTMIDNMVDIENQLPEYTDKKQLSDIASIHQNPSLRN 420
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
361 FFIGFHIQDEDAVSLDSESDKQLKTMIDNMVDIENQLPEYTDKKQLSDIASIHQNPSLRN 420

421 I 421
    |
421 I 421