Affine Alignment
 
Alignment between Y40H4A.2 (top Y40H4A.2 333aa) and Y40H4A.2 (bottom Y40H4A.2 333aa) score 33801

001 MIQESERVDQDEDSENDQERVAYLKAFISRLMTAPMKEKSPAEVDVTVSKEEIRIISNYA 060
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
001 MIQESERVDQDEDSENDQERVAYLKAFISRLMTAPMKEKSPAEVDVTVSKEEIRIISNYA 060

061 AASFGSFSTLMRVDEDCLPVHIVGDLHGHFGDLRRIFGIHGAPGISHYVFLGDYVDRGRQ 120
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
061 AASFGSFSTLMRVDEDCLPVHIVGDLHGHFGDLRRIFGIHGAPGISHYVFLGDYVDRGRQ 120

121 GIETVMLLMAYHCLYPDHLFLCRGNHEDYNTTMTYGFFDECRMKYGKKGTLAWLHIINAF 180
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
121 GIETVMLLMAYHCLYPDHLFLCRGNHEDYNTTMTYGFFDECRMKYGKKGTLAWLHIINAF 180

181 NHLPLAALILDKVLCMHGGISPHIQKLEDIDKIQRPTFIPSYGLACDLVWSDPEKTSNVG 240
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
181 NHLPLAALILDKVLCMHGGISPHIQKLEDIDKIQRPTFIPSYGLACDLVWSDPEKTSNVG 240

241 WSLSARGISFSFDDITIEKFCQDNGLDLIVRAHQISSEMIRGGHKWHANGRMVTIFSAAN 300
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
241 WSLSARGISFSFDDITIEKFCQDNGLDLIVRAHQISSEMIRGGHKWHANGRMVTIFSAAN 300

301 YLSMGNDSCVIRIDEQKTMQFCLLRPVKKSPKH 333
    |||||||||||||||||||||||||||||||||
301 YLSMGNDSCVIRIDEQKTMQFCLLRPVKKSPKH 333