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Alignment between xrn-1 (top Y39G8C.1 1195aa) and xrn-1 (bottom Y39G8C.1 1195aa) score 120403 0001 MGVPKFYRWTSERYPCLSEVINESQIPEFDNLYLDMNGIIHNCSHPNDDDVTFRITEDEI 0060 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 0001 MGVPKFYRWTSERYPCLSEVINESQIPEFDNLYLDMNGIIHNCSHPNDDDVTFRITEDEI 0060 0061 FVNIFAYIENLYNLIRPQKVFFMAVDGVAPRAKMNQQRARRFMSARTAHTQLAKALENGE 0120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 0061 FVNIFAYIENLYNLIRPQKVFFMAVDGVAPRAKMNQQRARRFMSARTAHTQLAKALENGE 0120 0121 IMPSEARFDSNCITPGTYFMTRLHQKLDDWIKTKSATDSRWQGRKIILSGHNVPGEGEHK 0180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 0121 IMPSEARFDSNCITPGTYFMTRLHQKLDDWIKTKSATDSRWQGRKIILSGHNVPGEGEHK 0180 0181 IMDFIRTERAGSSYDPNTRHCMYGLDADLIMLGIVSHEPHFSLLREEVTFNTRPRKNDNK 0240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 0181 IMDFIRTERAGSSYDPNTRHCMYGLDADLIMLGIVSHEPHFSLLREEVTFNTRPRKNDNK 0240 0241 ATKKPKRTDSDVKKFHLLHLSLLREYLAWEFADVKDSLPFEYEMERIVDDWILLGLLVGN 0300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 0241 ATKKPKRTDSDVKKFHLLHLSLLREYLAWEFADVKDSLPFEYEMERIVDDWILLGLLVGN 0300 0301 DFLPHLPNIHIHDDALPLLYSTYKKVLPTLDGYINEAGYLNLSRFEAFLAELALNDKTSF 0360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 0301 DFLPHLPNIHIHDDALPLLYSTYKKVLPTLDGYINEAGYLNLSRFEAFLAELALNDKTSF 0360 0361 MERLEDEQFMESKRIRVVDPEQQELAEPELVAFESSDVEDEAGAEESKDEAGGAGAEDDE 0420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 0361 MERLEDEQFMESKRIRVVDPEQQELAEPELVAFESSDVEDEAGAEESKDEAGGAGAEDDE 0420 0421 DDAAFVSDHEEDGDDLEPGSGSDELLLSNLDAQLLEDEFNDELATLALSGMNDADFANDV 0480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 0421 DDAAFVSDHEEDGDDLEPGSGSDELLLSNLDAQLLEDEFNDELATLALSGMNDADFANDV 0480 0481 EACWTKTINNQFKRHKKTYYSDKLRYKNISKQQLREQAEGYVRAIQWNLHYYYHGCVSWS 0540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 0481 EACWTKTINNQFKRHKKTYYSDKLRYKNISKQQLREQAEGYVRAIQWNLHYYYHGCVSWS 0540 0541 WFYPHHYAPFISDVRGFVGMRMEFELSEPFHPFEQLLAVLPEASADCLPRPLRELMSSDP 0600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 0541 WFYPHHYAPFISDVRGFVGMRMEFELSEPFHPFEQLLAVLPEASADCLPRPLRELMSSDP 0600 0601 AKSPICDFYPANFETDLNGKRNEWEAVVLIPFIEEKRLLEAIEAKRSRLTSEENARNSHG 0660 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 0601 AKSPICDFYPANFETDLNGKRNEWEAVVLIPFIEEKRLLEAIEAKRSRLTSEENARNSHG 0660 0661 SHIQCISSPEPPNSQGQWRTVRSEIPQDSFRIPRSQVKWGLLPNVKMDVYFPGFPTMKHL 0720 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 0661 SHIQCISSPEPPNSQGQWRTVRSEIPQDSFRIPRSQVKWGLLPNVKMDVYFPGFPTMKHL 0720 0721 SHLGELRFANCNIFGMASRKESMVLKVENERAHTDIIELGSELCDEEVCIDWPILKVAKI 0780 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 0721 SHLGELRFANCNIFGMASRKESMVLKVENERAHTDIIELGSELCDEEVCIDWPILKVAKI 0780 0781 DSIWGGDDKIVRKCDDEIIVKDMSEEEKRQWQAHANQLTEHLMTRFAIEIAAQKDSKGKH 0840 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 0781 DSIWGGDDKIVRKCDDEIIVKDMSEEEKRQWQAHANQLTEHLMTRFAIEIAAQKDSKGKH 0840 0841 IRPAVAWVRKFTGLVYEAQGGGKEPSVLKACKQWSSPQQLMPVLLPLVVKDVLLENSRVL 0900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 0841 IRPAVAWVRKFTGLVYEAQGGGKEPSVLKACKQWSSPQQLMPVLLPLVVKDVLLENSRVL 0900 0901 ADLPMKQAYPKQSIVWITDPKFALFGMPGMVNGFSNEKSADCRIEVIGMSTQNKVDKMEA 0960 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 0901 ADLPMKQAYPKQSIVWITDPKFALFGMPGMVNGFSNEKSADCRIEVIGMSTQNKVDKMEA 0960 0961 LRKKMEQKSLRWMGGYDCARQCQVDTRLFARITGTMFLWNEPRERVEKGQQISSSDSKIN 1020 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 0961 LRKKMEQKSLRWMGGYDCARQCQVDTRLFARITGTMFLWNEPRERVEKGQQISSSDSKIN 1020 1021 CGLALKYSRRDLCVADYTDRTEHTNQRGVTNKVWFYTNLATRLVSEYRRKFPDVWKYLET 1080 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1021 CGLALKYSRRDLCVADYTDRTEHTNQRGVTNKVWFYTNLATRLVSEYRRKFPDVWKYLET 1080 1081 IGLTQQDDVYYTEDIWSNEKTREKRFGELSEFLGGLPSLEAEQLKCGTVYADRQLITEIE 1140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1081 IGLTQQDDVYYTEDIWSNEKTREKRFGELSEFLGGLPSLEAEQLKCGTVYADRQLITEIE 1140 1141 MILAEPDEKKPVMNKYMMAPGALFRYELYNGKVHADPAADFQILDRVALMSSDTV 1195 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1141 MILAEPDEKKPVMNKYMMAPGALFRYELYNGKVHADPAADFQILDRVALMSSDTV 1195