Affine Alignment
 
Alignment between dpy-28 (top Y39A1B.3 1499aa) and dpy-28 (bottom Y39A1B.3 1499aa) score 145521

0001 MPRKQRVVTTPSPPTSDEDEDMDFGSTSQQQQQQPTRNNDGLSGFKSITEIIAEADNNIP 0060
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0001 MPRKQRVVTTPSPPTSDEDEDMDFGSTSQQQQQQPTRNNDGLSGFKSITEIIAEADNNIP 0060

0061 SEQIDKDIDSFSSYSDISDWRGIPKFFPSLSSLSRRASTYENWENRFKVVDYLVSCSGAL 0120
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0061 SEQIDKDIDSFSSYSDISDWRGIPKFFPSLSSLSRRASTYENWENRFKVVDYLVSCSGAL 0120

0121 KDSVSDYVADYFEKNESGEDHSVDVELVHAVSMFVILTQRLTVQLQLYVSKSIASANQQA 0180
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0121 KDSVSDYVADYFEKNESGEDHSVDVELVHAVSMFVILTQRLTVQLQLYVSKSIASANQQA 0180

0181 KRGTGRGGRQVDLDDDIVKWKDIQRHRMINCLLELLELRVDTVAGTKKKAIQYVFAPDVM 0240
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0181 KRGTGRGGRQVDLDDDIVKWKDIQRHRMINCLLELLELRVDTVAGTKKKAIQYVFAPDVM 0240

0241 EKDFLLRFLDTVVQLLEDPENMARSSQQWISHYFRILKVLSADYGMTKDVANCLFTALSH 0300
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0241 EKDFLLRFLDTVVQLLEDPENMARSSQQWISHYFRILKVLSADYGMTKDVANCLFTALSH 0300

0301 SYLEAANTFPFIEPLVTLMKENGEGSGRIYQPLRNVLQLVICRVGNLYAGERAEKPPPKA 0360
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0301 SYLEAANTFPFIEPLVTLMKENGEGSGRIYQPLRNVLQLVICRVGNLYAGERAEKPPPKA 0360

0361 FCMMVQSLAINVHDLMLQDITHVYRLLQNQHVNVRMSTLHALADMFSSSYLSQSLCDTFA 0420
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0361 FCMMVQSLAINVHDLMLQDITHVYRLLQNQHVNVRMSTLHALADMFSSSYLSQSLCDTFA 0420

0421 SRRLKREGIFKRLLAHTNDEATNVRSKAVSLLRNIMENRRIPEEFESCGLLSIVGSRLND 0480
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0421 SRRLKREGIFKRLLAHTNDEATNVRSKAVSLLRNIMENRRIPEEFESCGLLSIVGSRLND 0480

0481 KSVQVRKSAIQFLTTFLDNNRHGHDFNREMHQLKLNAKCSELRNAEEPQSKAIQGAENAF 0540
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0481 KSVQVRKSAIQFLTTFLDNNRHGHDFNREMHQLKLNAKCSELRNAEEPQSKAIQGAENAF 0540

0541 RQNLFTLTAGVRVEVYDIFRRRYRVEPERSITDILTGLFSPGSGNRLVRYYVAQENFPFR 0600
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0541 RQNLFTLTAGVRVEVYDIFRRRYRVEPERSITDILTGLFSPGSGNRLVRYYVAQENFPFR 0600

0601 DRIPSLRERRSDDMEDDDDDTVSLEDDDMTSLVSEVVKWVVAQAEEDYVTFKVQLTQMDD 0660
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0601 DRIPSLRERRSDDMEDDDDDTVSLEDDDMTSLVSEVVKWVVAQAEEDYVTFKVQLTQMDD 0660

0661 DQLLENEQEARDRNNQIMQLRAQVQQLINKMSIEQELSRCVTIALRCVLNGETAEIKEGI 0720
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0661 DQLLENEQEARDRNNQIMQLRAQVQQLINKMSIEQELSRCVTIALRCVLNGETAEIKEGI 0720

0721 RFLTRCKLFEITGADDAIRSMCSLVWRPSADILNELIEAAEDMFISRLDGNEKASERDSS 0780
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0721 RFLTRCKLFEITGADDAIRSMCSLVWRPSADILNELIEAAEDMFISRLDGNEKASERDSS 0780

0781 TVENLMKAMNGVTEKDRPSVEEVIYLLAATELVHVDSDKNKVPRKRRPIEANVINKLWMI 0840
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0781 TVENLMKAMNGVTEKDRPSVEEVIYLLAATELVHVDSDKNKVPRKRRPIEANVINKLWMI 0840

0841 ALDMSHGINSRKIDALRILYPISRSERGIAEARSRLRVVQKKLMDPELAVDALRIISILG 0900
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0841 ALDMSHGINSRKIDALRILYPISRSERGIAEARSRLRVVQKKLMDPELAVDALRIISILG 0900

0901 TPTKLENEQDAYSRPLFKIHQDDSLWKSIEKLFFYEIMKADDNPDRDWFGVIRLTITTIL 0960
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0901 TPTKLENEQDAYSRPLFKIHQDDSLWKSIEKLFFYEIMKADDNPDRDWFGVIRLTITTIL 0960

0961 SLSMDVNVMLPKLASHFVYRTKRISDFFLFYCDQVDDATDDTRKKMAQRRREYWALTYCR 1020
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0961 SLSMDVNVMLPKLASHFVYRTKRISDFFLFYCDQVDDATDDTRKKMAQRRREYWALTYCR 1020

1021 VMEKLMAFIGEVAVQLNAYIQVTIPKLHTRYVSKMVDAEKNDANIREEPVRFLSDLEKSV 1080
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1021 VMEKLMAFIGEVAVQLNAYIQVTIPKLHTRYVSKMVDAEKNDANIREEPVRFLSDLEKSV 1080

1081 AQRKTIFTVPQDTTPGATSNDLHHLVSVMCDKRLFVPNKLMGRLLPIVVYGMRCKIMPTR 1140
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1081 AQRKTIFTVPQDTTPGATSNDLHHLVSVMCDKRLFVPNKLMGRLLPIVVYGMRCKIMPTR 1140

1141 IRHAATVAYGKMMPLSAEISAFAAPSFFSAMTKSSSILLRCNLVAACCDFAFAQPTLFEL 1200
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1141 IRHAATVAYGKMMPLSAEISAFAAPSFFSAMTKSSSILLRCNLVAACCDFAFAQPTLFEL 1200

1201 FAQSLFRMSQDESPLARESTILVLSHLMSNDMIQTRGVLSEAARCICDPTRAVRDVAQSF 1260
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1201 FAQSLFRMSQDESPLARESTILVLSHLMSNDMIQTRGVLSEAARCICDPTRAVRDVAQSF 1260

1261 FKELNSRTDTIIQLLPEFLYHLSNGNERMSFKSYKTVFEFLIQLLKDKPKASADSMIDRV 1320
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1261 FKELNSRTDTIIQLLPEFLYHLSNGNERMSFKSYKTVFEFLIQLLKDKPKASADSMIDRV 1320

1321 CIKFSNTDMNDSETPKYLLVALAKFVQNDGGLHRLQDNWRHWSKFMCHPSVAKEYRMMVE 1380
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1321 CIKFSNTDMNDSETPKYLLVALAKFVQNDGGLHRLQDNWRHWSKFMCHPSVAKEYRMMVE 1380

1381 HMHSTSKNDEFKSQCVELIDNINKIESEGLRKEDVAIGSSITKNKGRAKKNPTTMSGSSR 1440
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1381 HMHSTSKNDEFKSQCVELIDNINKIESEGLRKEDVAIGSSITKNKGRAKKNPTTMSGSSR 1440

1441 TTSRAANSRRRAPPPAQSDEDDSDSDDAPAAPRSAARRKAKKSAVADDDSDSDEFMLDD 1499
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1441 TTSRAANSRRRAPPPAQSDEDDSDSDDAPAAPRSAARRKAKKSAVADDDSDSDEFMLDD 1499