Affine Alignment
 
Alignment between srd-17 (top Y2H9A.2 339aa) and srd-17 (bottom Y2H9A.2 339aa) score 33307

001 MHAFFEIWHCIWALLGCSFNLMLIYMAIYKSPKTIRSYATLIINFAVTDFFECALDLFIQ 060
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
001 MHAFFEIWHCIWALLGCSFNLMLIYMAIYKSPKTIRSYATLIINFAVTDFFECALDLFIQ 060

061 IRLMPAPGDVTVIYILNGSCKYISQFACKIGLSLFLPCITHSVWSLLLSFGYRYYILHYS 120
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
061 IRLMPAPGDVTVIYILNGSCKYISQFACKIGLSLFLPCITHSVWSLLLSFGYRYYILHYS 120

121 ALTRLKLVKIVLLILIPSLFQGLTFWTSFAPLEIILPLAKKWFPQYNFEAETGVLTGIVD 180
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
121 ALTRLKLVKIVLLILIPSLFQGLTFWTSFAPLEIILPLAKKWFPQYNFEAETGVLTGIVD 180

181 ITHWAATYAVFNICLPIFPIYIAIFILRQKIITFLGAKTQSMSPDTKAAHSQLLKALTIQ 240
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
181 ITHWAATYAVFNICLPIFPIYIAIFILRQKIITFLGAKTQSMSPDTKAAHSQLLKALTIQ 240

241 AFIPIFMGIGVIFYLIAQSGLIVSPIVENAIFSIAILMPALSPLTYFYFVRPYRQFLKRI 300
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
241 AFIPIFMGIGVIFYLIAQSGLIVSPIVENAIFSIAILMPALSPLTYFYFVRPYRQFLKRI 300

301 FKNPFKVSAAYVQRTGSSSAMFQSGGHPSQIGTQATTVL 339
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
301 FKNPFKVSAAYVQRTGSSSAMFQSGGHPSQIGTQATTVL 339