Affine Alignment
 
Alignment between ssu-1 (top Y113G7A.11 412aa) and ssu-1 (bottom Y113G7A.11 412aa) score 42769

001 MTPKTPKTPKPPQTPRPMLTVGSPPCTPCSPFVLNATSFCFRKGPARSVVYQPNGHPKQV 060
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
001 MTPKTPKTPKPPQTPRPMLTVGSPPCTPCSPFVLNATSFCFRKGPARSVVYQPNGHPKQV 060

061 VIDGEIWPPIFKPKNVRTAKSMQFGETDVVIATYPKCGTTWLQHITSQLIKGHDYKAGKG 120
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
061 VIDGEIWPPIFKPKNVRTAKSMQFGETDVVIATYPKCGTTWLQHITSQLIKGHDYKAGKG 120

121 NELCVQSPMIERMGAAFADNIKGPRVLKTHFHHYNIPKYPDTKYIYCVRNPKDCLTSYFH 180
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
121 NELCVQSPMIERMGAAFADNIKGPRVLKTHFHHYNIPKYPDTKYIYCVRNPKDCLTSYFH 180

181 HNRNFKIYNWANGTWDVFLDLFASGQLAFGDYFEHLLSWLPCLKDDNVLFLKYEDMFQDL 240
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
181 HNRNFKIYNWANGTWDVFLDLFASGQLAFGDYFEHLLSWLPCLKDDNVLFLKYEDMFQDL 240

241 ENAVYKIGQFLGGEAAHRVENPEILREIVDNSTIDAMKKDQKRWFPESQLHKVEFIRKGG 300
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
241 ENAVYKIGQFLGGEAAHRVENPEILREIVDNSTIDAMKKDQKRWFPESQLHKVEFIRKGG 300

301 SRDWKNYFTREQSDRIDSIFAAKFAGTPAEHWWKYEMAWEEKPLSIENLSMEEEEEEQSQ 360
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
301 SRDWKNYFTREQSDRIDSIFAAKFAGTPAEHWWKYEMAWEEKPLSIENLSMEEEEEEQSQ 360

361 KLFALPPLPPQRRFSRTSLLSAGYGSVWSLSSQNANMSASSSVNKDLSTFAE 412
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
361 KLFALPPLPPQRRFSRTSLLSAGYGSVWSLSSQNANMSASSSVNKDLSTFAE 412