Affine Alignment
 
Alignment between ssq-4 (top T28H11.1 373aa) and ssq-4 (bottom T28H11.1 373aa) score 37221

001 MTSAYFGVAGGGNAGAQSAYFGVGGGPAGGGGGNKSAGGGGAPPPGVSCYLGAGAGGAAS 060
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
001 MTSAYFGVAGGGNAGAQSAYFGVGGGPAGGGGGNKSAGGGGAPPPGVSCYLGAGAGGAAS 060

061 GSQSAYFGVGGGPVGGGGGGGAPPAASNDAGYFATPPAAPAGGSSTMTAVGGAPRGASTM 120
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
061 GSQSAYFGVGGGPVGGGGGGGAPPAASNDAGYFATPPAAPAGGSSTMTAVGGAPRGASTM 120

121 TAVGGAPVGGSSTMTAVGGAPSGASTMTAIGGAPRGASTMTAVGGAPMGGGSTMTAVGGA 180
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
121 TAVGGAPVGGSSTMTAVGGAPSGASTMTAIGGAPRGASTMTAVGGAPMGGGSTMTAVGGA 180

181 PSGASTMTAVGGAPSGASTMTAIGGAPRGASTMTAVGGAPMGGSSTMTAVGGAPIGGSST 240
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
181 PSGASTMTAVGGAPSGASTMTAIGGAPRGASTMTAVGGAPMGGSSTMTAVGGAPIGGSST 240

241 MTAVGGAPRGASTMTAVGGAPGGASTMTAMGGGPSAFGGAPPPPSGSAMGGGGGGGATSA 300
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
241 MTAVGGAPRGASTMTAVGGAPGGASTMTAMGGGPSAFGGAPPPPSGSAMGGGGGGGATSA 300

301 YFGVGSGAMGGGGAGAQSAYFGVGGGPVGGGGGGAKSGGGGGGIPGQSVYMGAGGGGGGG 360
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
301 YFGVGSGAMGGGGAGAQSAYFGVGGGPVGGGGGGAKSGGGGGGIPGQSVYMGAGGGGGGG 360

361 GGGGATSAYFAPR 373
    |||||||||||||
361 GGGGATSAYFAPR 373