Affine Alignment
 
Alignment between cdk-5 (top T27E9.3 292aa) and cdk-5 (bottom T27E9.3 292aa) score 29374

001 MLNYDKMEKIGEGTYGTVFKARNKNSGEIVALKRVRLDDDDEGVPSSALREICILRELKH 060
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
001 MLNYDKMEKIGEGTYGTVFKARNKNSGEIVALKRVRLDDDDEGVPSSALREICILRELKH 060

061 RNVVRLYDVVHSENKLTLVFEYCDQDLKKFFDSLNGYMDAQTARSLMLQLLRGLSFCHAH 120
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
061 RNVVRLYDVVHSENKLTLVFEYCDQDLKKFFDSLNGYMDAQTARSLMLQLLRGLSFCHAH 120

121 HVLHRDLKPQNLLINTNGTLKLADFGLARAFGVPVRCFSAEVVTLWYRPPDVLFGAKLYN 180
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
121 HVLHRDLKPQNLLINTNGTLKLADFGLARAFGVPVRCFSAEVVTLWYRPPDVLFGAKLYN 180

181 TSIDMWSAGCIFAEISNAGRPLFPGADVDDQLKRIFKQLGSPSEDNWPSITQLPDYKPYP 240
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
181 TSIDMWSAGCIFAEISNAGRPLFPGADVDDQLKRIFKQLGSPSEDNWPSITQLPDYKPYP 240

241 IYHPTLTWSQIVPNLNSRGRDLLQKLLVCNPAGRIDADAALRHAYFADTSDV 292
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
241 IYHPTLTWSQIVPNLNSRGRDLLQKLLVCNPAGRIDADAALRHAYFADTSDV 292