Affine Alignment
 
Alignment between nph-4 (top R13H4.1 1305aa) and nph-4 (bottom R13H4.1 1305aa) score 129200

0001 MSVNDWYSLFLANRPVEMKRNVSRGTKALCYSMFISNLTSPQLTENIRYQISAFLFDTKT 0060
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0001 MSVNDWYSLFLANRPVEMKRNVSRGTKALCYSMFISNLTSPQLTENIRYQISAFLFDTKT 0060

0061 SQMFGRQCRTEWIPANSNGTCVFNETLYFYSIINSRDVLLILEFVEEGSDEITPATSVGW 0120
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0061 SQMFGRQCRTEWIPANSNGTCVFNETLYFYSIINSRDVLLILEFVEEGSDEITPATSVGW 0120

0121 FSTHIEKKTPVEISNTKIFDIFGGTPKLLIFDKETVLKPVGNVECTYNIFEMPPIFFQCL 0180
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0121 FSTHIEKKTPVEISNTKIFDIFGGTPKLLIFDKETVLKPVGNVECTYNIFEMPPIFFQCL 0180

0181 PEFCIVCDKDIIPGIIKDSSDEWWLSTPKEMPTIPAAIDAIVIQFKNNVPELEKQITHDI 0240
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0181 PEFCIVCDKDIIPGIIKDSSDEWWLSTPKEMPTIPAAIDAIVIQFKNNVPELEKQITHDI 0240

0241 EKEWALKEGGTLKPKAIIMDRKLRIGVHNGYTYVTEPFTVDLEIISSNAGDTLRSRKKPI 0300
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0241 EKEWALKEGGTLKPKAIIMDRKLRIGVHNGYTYVTEPFTVDLEIISSNAGDTLRSRKKPI 0300

0301 DFGKSSNWEEQLLFQAAGNPRLALRNLYADPRMAIIFLLEYTFHREDNQSLNQTILIGWA 0360
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0301 DFGKSSNWEEQLLFQAAGNPRLALRNLYADPRMAIIFLLEYTFHREDNQSLNQTILIGWA 0360

0361 AWTPFSDGAFSGKEVETRVSFVGGPRPNPEGVLCYKNVLNQPDSLKPLNEKLEIFVDFKF 0420
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0361 AWTPFSDGAFSGKEVETRVSFVGGPRPNPEGVLCYKNVLNQPDSLKPLNEKLEIFVDFKF 0420

0421 YENGRSVHNTPTSRRAADSARVQTGRSGDNGQSARSNRKSVKIETPRSPENSNRFPALVD 0480
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0421 YENGRSVHNTPTSRRAADSARVQTGRSGDNGQSARSNRKSVKIETPRSPENSNRFPALVD 0480

0481 TGRSVSSVDELRSINEDLNRFIEEPMEIPVQDVVVAKKPVEEPLPITSVYKIPFDELKPI 0540
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0481 TGRSVSSVDELRSINEDLNRFIEEPMEIPVQDVVVAKKPVEEPLPITSVYKIPFDELKPI 0540

0541 NFPRSAHSMFARQNFTQLKDRNGSPPNTEDVTLKTIIDMKREQLDRLITSHVYFQFIAFK 0600
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0541 NFPRSAHSMFARQNFTQLKDRNGSPPNTEDVTLKTIIDMKREQLDRLITSHVYFQFIAFK 0600

0601 QLAAPDARMIKKLFFTIGFYRFPDITTESMLLTSMEKGEPTLLTRLDKNGNSDVIASPGF 0660
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0601 QLAAPDARMIKKLFFTIGFYRFPDITTESMLLTSMEKGEPTLLTRLDKNGNSDVIASPGF 0660

0661 IAKYIIEGEESKADFLDFMASGHATIDVWDSDSLIHLGSTIVPIKNLYRRGREAVQLFIQ 0720
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0661 IAKYIIEGEESKADFLDFMASGHATIDVWDSDSLIHLGSTIVPIKNLYRRGREAVQLFIQ 0720

0721 CPVVDTSLDTSSKAGAFLYMRVANIGFPSGNTYDLSSSSSSLTTTRSNVNSGQGTVVRRL 0780
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0721 CPVVDTSLDTSSKAGAFLYMRVANIGFPSGNTYDLSSSSSSLTTTRSNVNSGQGTVVRRL 0780

0781 TSSIRLNEEGPHSYRIHAKPLPGNSGVGLDRFLTAQRLDIQQRHEQLFNENSLDKIRQWN 0840
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0781 TSSIRLNEEGPHSYRIHAKPLPGNSGVGLDRFLTAQRLDIQQRHEQLFNENSLDKIRQWN 0840

0841 DLKEGFNFSDNKEIAQKFIFEEELAAYKKLRYESKPAKLLEAVFKGITSCHQINPSFGEK 0900
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0841 DLKEGFNFSDNKEIAQKFIFEEELAAYKKLRYESKPAKLLEAVFKGITSCHQINPSFGEK 0900

0901 VFFEFPLENYNSEPINCTIEFDDEALKPVFDAEEWKFYKTVNKVTTPSEKQMMRQTTDRI 0960
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0901 VFFEFPLENYNSEPINCTIEFDDEALKPVFDAEEWKFYKTVNKVTTPSEKQMMRQTTDRI 0960

0961 EICLQPGDVLFIPFIYDAFFFPNDAFNMYSTKVVFRRWDTKEPLAILDLHVHRRNFLLQH 1020
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0961 EICLQPGDVLFIPFIYDAFFFPNDAFNMYSTKVVFRRWDTKEPLAILDLHVHRRNFLLQH 1020

1021 SVTFICETSGNWEKQLVLPPMARDRRVLSCRCSDPSVRLTVRNATLQQIVGFTTYSGETN 1080
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1021 SVTFICETSGNWEKQLVLPPMARDRRVLSCRCSDPSVRLTVRNATLQQIVGFTTYSGETN 1080

1081 DRKTFLLLMYSDHYQTRLMATWKITILPFFNVDVRSIVGQTTRLHLLVHRRSEHDGVPDD 1140
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1081 DRKTFLLLMYSDHYQTRLMATWKITILPFFNVDVRSIVGQTTRLHLLVHRRSEHDGVPDD 1140

1141 LLKVYTASGCMKVVDSVLTERTPTATIDFTPNFIGTKKLVVSVVNTNTLKLERGFLVYGK 1200
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1141 LLKVYTASGCMKVVDSVLTERTPTATIDFTPNFIGTKKLVVSVVNTNTLKLERGFLVYGK 1200

1201 SEAPRITQKFVIQIPSSDEAIRKRIPIRNPYGLPKTFRITTSNSDIVKITDSLLSVPPMG 1260
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1201 SEAPRITQKFVIQIPSSDEAIRKRIPIRNPYGLPKTFRITTSNSDIVKITDSLLSVPPMG 1260

1261 KLPCEMYFVKNTHLQKNIETLLYISDAETYVQEEAYSITLAFEAS 1305
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1261 KLPCEMYFVKNTHLQKNIETLLYISDAETYVQEEAYSITLAFEAS 1305