Affine Alignment
  
Alignment between R05H11.1 (top R05H11.1 476aa) and R05H11.1 (bottom R05H11.1 476aa) score 48013

001 MHCSKSDPLLLSPIHPFLNLLALPKKSLKKLYEYLNPIDCYNIAKCSKNLEAQVRKYKNP 060
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001 MHCSKSDPLLLSPIHPFLNLLALPKKSLKKLYEYLNPIDCYNIAKCSKNLEAQVRKYKNP 060

061 VINYIYMRFDDEKSCIGVYFEKYKYNACVFYSWRDKDGKRTIWNNSYYLKSSKFQNYMFC 120
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061 VINYIYMRFDDEKSCIGVYFEKYKYNACVFYSWRDKDGKRTIWNNSYYLKSSKFQNYMFC 120

121 KRSHPKEVKSLQPSTIPQNYINGMLETYQELCSLFSAQDAFYFVGVNVNDKISYETFCTM 180
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121 KRSHPKEVKSLQPSTIPQNYINGMLETYQELCSLFSAQDAFYFVGVNVNDKISYETFCTM 180

181 PHLPRFIGNFRLIGSKSPKVERVRDILRSANVLGTIRVSHQIGSACMQEELINSKHIVLD 240
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181 PHLPRFIGNFRLIGSKSPKVERVRDILRSANVLGTIRVSHQIGSACMQEELINSKHIVLD 240

241 DPEWISREELLSLNCITVDIGHNNLTADDLNAFLLQWMFIDSDQTRLERMEITLSPEAFR 300
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241 DPEWISREELLSLNCITVDIGHNNLTADDLNAFLLQWMFIDSDQTRLERMEITLSPEAFR 300

301 NKAQITNGLMLLDWDPRRREGEHFDSSYYLSRSTIRDPYHFLDCKFSKDILRDDGRLATI 360
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301 NKAQITNGLMLLDWDPRRREGEHFDSSYYLSRSTIRDPYHFLDCKFSKDILRDDGRLATI 360

361 LFYGKKLYFLVWKDRFPYKTIKDAKKQQKERKVKKKLTRALNDALRDLNVRSQNEWNQKT 420
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361 LFYGKKLYFLVWKDRFPYKTIKDAKKQQKERKVKKKLTRALNDALRDLNVRSQNEWNQKT 420

421 EWLEAVLKTRKAVAEEEQNAKRKYFQALKEFLDTSEPKPKRRLLRTITIFKKDVIP 476
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421 EWLEAVLKTRKAVAEEEQNAKRKYFQALKEFLDTSEPKPKRRLLRTITIFKKDVIP 476