Affine Alignment
 
Alignment between tra-3 (top LLC1.1 648aa) and tra-3 (bottom LLC1.1 648aa) score 65664

001 MTRSEKTRHFGNQNYEKLRKICIKKKQPFVDTLFPPTNQSLFLEQRQSSDIVWKRPGELH 060
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
001 MTRSEKTRHFGNQNYEKLRKICIKKKQPFVDTLFPPTNQSLFLEQRQSSDIVWKRPGELH 060

061 PDPHLFVEGASPNDVTQGILGNCWFVSACSALTHNFKLLAQVIPDADDQEWSTKHAYAGI 120
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
061 PDPHLFVEGASPNDVTQGILGNCWFVSACSALTHNFKLLAQVIPDADDQEWSTKHAYAGI 120

121 FRFRFWRFGKWVEVVIDDLLPTRDGKLLFARSKTPNEFWSALLEKAFAKLYGCYENLVGG 180
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
121 FRFRFWRFGKWVEVVIDDLLPTRDGKLLFARSKTPNEFWSALLEKAFAKLYGCYENLVGG 180

181 HLSDALQDVSGGVAETLHVRKFLKDDPNDTELKLFNDLKTAFDKGALVVAAIAARTKEEI 240
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
181 HLSDALQDVSGGVAETLHVRKFLKDDPNDTELKLFNDLKTAFDKGALVVAAIAARTKEEI 240

241 EESLDCGLVKGHAYAVSAVCTIDVTNPNERSFTSFIMGSKRKQNLIRLQNPWGEKEWNGA 300
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
241 EESLDCGLVKGHAYAVSAVCTIDVTNPNERSFTSFIMGSKRKQNLIRLQNPWGEKEWNGA 300

301 WSDDSPEWQNVSASQLSTMGVQPANSDSDDGDFWMPWESFVHYFTDISLCQLFNTSVFSF 360
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
301 WSDDSPEWQNVSASQLSTMGVQPANSDSDDGDFWMPWESFVHYFTDISLCQLFNTSVFSF 360

361 SRSYDEQIVFSEWTTNGKKSGAPDDRAGGCHNFKATFCNNPQYIFDIPSPNCSVMFALIQ 420
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
361 SRSYDEQIVFSEWTTNGKKSGAPDDRAGGCHNFKATFCNNPQYIFDIPSPNCSVMFALIQ 420

421 NDPSEGLKKREPFVTIGMHVMKVENNRQYRVHTAMHPIAISDYASGRSVYLHLQSLPRGR 480
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
421 NDPSEGLKKREPFVTIGMHVMKVENNRQYRVHTAMHPIAISDYASGRSVYLHLQSLPRGR 480

481 YLLIPTTFAPKEQTLFMLRVYSDEHIHFSPLTKHAPKLGLLKCKSAQSVTRLTIHGVDFN 540
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
481 YLLIPTTFAPKEQTLFMLRVYSDEHIHFSPLTKHAPKLGLLKCKSAQSVTRLTIHGVDFN 540

541 SASTGTHNVYAILKDSRKSFRTKTLSGVKSIQWDEQFLFHKSKNRQQYKIEVWEDRKMAR 600
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
541 SASTGTHNVYAILKDSRKSFRTKTLSGVKSIQWDEQFLFHKSKNRQQYKIEVWEDRKMAR 600

601 DHLLAQSVIIALIDNENRDTTLQLTDPRGTVIGTVSVTVSAFDDPMYL 648
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
601 DHLLAQSVIIALIDNENRDTTLQLTDPRGTVIGTVSVTVSAFDDPMYL 648