Affine Alignment
 
Alignment between spt-5 (top K08E4.1 1208aa) and spt-5 (bottom K08E4.1 1208aa) score 120536

0001 MSSDESDAASNKEEDTTLSDDDGSDVEIKNSKKDRKRKLASESEKSGSDDDDDDDDDEDE 0060
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0001 MSSDESDAASNKEEDTTLSDDDGSDVEIKNSKKDRKRKLASESEKSGSDDDDDDDDDEDE 0060

0061 NVTSKKSKKQKRKNKAPSGRDFLAWDVEVDDEDEDDDNDYDDEDDPSMNAMNEREEAERA 0120
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0061 NVTSKKSKKQKRKNKAPSGRDFLAWDVEVDDEDEDDDNDYDDEDDPSMNAMNEREEAERA 0120

0121 MKEMELSQRNRDRYKFQNMTEDEVQKYFENKYKGDKNDSQYDDEDSAMDDISKNSHLPST 0180
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0121 MKEMELSQRNRDRYKFQNMTEDEVQKYFENKYKGDKNDSQYDDEDSAMDDISKNSHLPST 0180

0181 KDPNLWIVKCRMGEEKLVAMHLMRKCLAVEHTNEPFQIKSVVVKEGLKGMIYIEAFKQSH 0240
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0181 KDPNLWIVKCRMGEEKLVAMHLMRKCLAVEHTNEPFQIKSVVVKEGLKGMIYIEAFKQSH 0240

0241 VMSAIEGFSALNQFTITMVPIKDMVDVLRVVKDIPQLKLGSYVRLKRTMYKDDLAVVDLV 0300
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0241 VMSAIEGFSALNQFTITMVPIKDMVDVLRVVKDIPQLKLGSYVRLKRTMYKDDLAVVDLV 0300

0301 DIAQNRVNLKLIPRVDYQKRRGAMRTDADKNYKLKRRPMPKLFDQDTIKEVGGEIVTDGD 0360
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0301 DIAQNRVNLKLIPRVDYQKRRGAMRTDADKNYKLKRRPMPKLFDQDTIKEVGGEIVTDGD 0360

0361 FLVFEGNHFRRGFLYKYFPINAIQADGVKPTLGELEKFQESSDDLKRELETASLKDTENP 0420
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0361 FLVFEGNHFRRGFLYKYFPINAIQADGVKPTLGELEKFQESSDDLKRELETASLKDTENP 0420

0421 FVPGDIVEVKAGELVNLRGKVMTVDGTKVVMMPDQEDLKEAITLNAHELRKYFKEGDHAK 0480
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0421 FVPGDIVEVKAGELVNLRGKVMTVDGTKVVMMPDQEDLKEAITLNAHELRKYFKEGDHAK 0480

0481 VISGRYEGHTGLIVRVKDSTAIVLSDLGMEELKVRVRDLQLCADVTTGVDSLGQFQYHDL 0540
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0481 VISGRYEGHTGLIVRVKDSTAIVLSDLGMEELKVRVRDLQLCADVTTGVDSLGQFQYHDL 0540

0541 VQLDHTGNVGVIVRLEKEHLEVLNMHGVVNRIKPQAIIAKKDVRFAKVLDSQNNSIEAKD 0600
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0541 VQLDHTGNVGVIVRLEKEHLEVLNMHGVVNRIKPQAIIAKKDVRFAKVLDSQNNSIEAKD 0600

0601 LVKVIGGPNAKERETDEDPVGEVLYAFRGTVFVYSRKVTKNGGVLVCKPKQLILQGAKKT 0660
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0601 LVKVIGGPNAKERETDEDPVGEVLYAFRGTVFVYSRKVTKNGGVLVCKPKQLILQGAKKT 0660

0661 TSTPMVSRMASPNPMASPRHSSGGMTPRSPQDGMSSRGSSGGQTPRQGGGGGRGGHFGTA 0720
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0661 TSTPMVSRMASPNPMASPRHSSGGMTPRSPQDGMSSRGSSGGQTPRQGGGGGRGGHFGTA 0720

0721 NQQKVRRDLTLIGKNVRIIKGPMKGHFGIVRDATEDTVRVELHTQCRTISVDRARVMVVG 0780
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0721 NQQKVRRDLTLIGKNVRIIKGPMKGHFGIVRDATEDTVRVELHTQCRTISVDRARVMVVG 0780

0781 DTGITAGSGGGSSFYSSSKTPMRDSGKTPMYGSKTPMYGAQTPMYGSMTPAYDGGRTPAY 0840
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0781 DTGITAGSGGGSSFYSSSKTPMRDSGKTPMYGSKTPMYGAQTPMYGSMTPAYDGGRTPAY 0840

0841 GEGGRTPAYGSKTPAYGDLDEHSSSRTPAYGNDSSRTPAYGSADGARTPAYGSTEGGRTP 0900
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0841 GEGGRTPAYGSKTPAYGDLDEHSSSRTPAYGNDSSRTPAYGSADGARTPAYGSTEGGRTP 0900

0901 AYGSMDNSRTPAYDDSGRTPGYESMPSRTPNYDSSSKTPAYPESEHSARTPAYNNDYDIP 0960
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0901 AYGSMDNSRTPAYDDSGRTPGYESMPSRTPNYDSSSKTPAYPESEHSARTPAYNNDYDIP 0960

0961 LSPAYEPDAPEAYDNAPARTPAFVSRTPGYDTYENSSPTYEPDAATKVEEDIGDTSSPTY 1020
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0961 LSPAYEPDAPEAYDNAPARTPAFVSRTPGYDTYENSSPTYEPDAATKVEEDIGDTSSPTY 1020

1021 DSPPHSYVVPTPGAMLNPATPGAYHVDTPGFAAPMTPGSGGAYDQYVAPSPFAGYDSNNY 1080
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1021 DSPPHSYVVPTPGAMLNPATPGAYHVDTPGFAAPMTPGSGGAYDQYVAPSPFAGYDSNNY 1080

1081 NNADGAIEQIPDHFLAQGVWIVQNLCVQIKDHEGRFNGREAIIKDVTDGKVDVYMPDHKC 1140
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1081 NNADGAIEQIPDHFLAQGVWIVQNLCVQIKDHEGRFNGREAIIKDVTDGKVDVYMPDHKC 1140

1141 NLEVDFDQLTPMKPQPGDDARVIFGQDAGHSGQLVSMDGFEAVIRSQEDMSDMRVINIGL 1200
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1141 NLEVDFDQLTPMKPQPGDDARVIFGQDAGHSGQLVSMDGFEAVIRSQEDMSDMRVINIGL 1200

1201 CCKMHSET 1208
     ||||||||
1201 CCKMHSET 1208