Affine Alignment
 
Alignment between rpt-5 (top F56H1.4 430aa) and rpt-5 (bottom F56H1.4 430aa) score 41515

001 MSQTPPPKDGKNPEAMEVEDAIDEEILKMSTEDLKSRTHLLDNEIRIMRSEVQRINHSAT 060
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
001 MSQTPPPKDGKNPEAMEVEDAIDEEILKMSTEDLKSRTHLLDNEIRIMRSEVQRINHSAT 060

061 TLKERIKENTERIKVNKTLPYLVSNVVELLDLEDNTEEEGANVDLDAQKTKCAVIKTSTR 120
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
061 TLKERIKENTERIKVNKTLPYLVSNVVELLDLEDNTEEEGANVDLDAQKTKCAVIKTSTR 120

121 ATYFLPVVGLVDPDELKPGDLVGVNKDSYLILEKLPAEYDSRVKAMEVDERPTEQYSDIG 180
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
121 ATYFLPVVGLVDPDELKPGDLVGVNKDSYLILEKLPAEYDSRVKAMEVDERPTEQYSDIG 180

181 GCDKQIQELIEAVVLPMTHKDRFVNLGIHPPKGVLMYGPPGTGKTMMARAVAAQTKSTFL 240
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
181 GCDKQIQELIEAVVLPMTHKDRFVNLGIHPPKGVLMYGPPGTGKTMMARAVAAQTKSTFL 240

241 KLAGPQLVQMFIGDGAKLVRDAFALAKEKAPAIIFIDELDAIGTKRFDSEKAGDREVQRT 300
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
241 KLAGPQLVQMFIGDGAKLVRDAFALAKEKAPAIIFIDELDAIGTKRFDSEKAGDREVQRT 300

301 MLELLNQLDGFQPNDDIKVIAATNRIDVLDPALLRSGRLDRKIELPHPNEDARARIMQIH 360
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
301 MLELLNQLDGFQPNDDIKVIAATNRIDVLDPALLRSGRLDRKIELPHPNEDARARIMQIH 360

361 SRKMNVNKDVNFEELARCTDDFNGAQCKAVCVEAGMIALRRDATEILHEDFMDAILEVQA 420
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
361 SRKMNVNKDVNFEELARCTDDFNGAQCKAVCVEAGMIALRRDATEILHEDFMDAILEVQA 420

421 KKKASLNYYA 430
    ||||||||||
421 KKKASLNYYA 430