Affine Alignment
 
Alignment between syn-3 (top F55A11.2 413aa) and syn-3 (bottom F55A11.2 413aa) score 38969

001 MSDFHNIRSRRRIPEASSYSTVDFDYDPDQKNHTSAVAPTSFAYSSLTTVFNASASQLWN 060
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
001 MSDFHNIRSRRRIPEASSYSTVDFDYDPDQKNHTSAVAPTSFAYSSLTTVFNASASQLWN 060

061 SAQEALVSSYDTAEGTESIDADRSKVVETLESLSIFGNPLDHIIITMPSRDRTSEFRATA 120
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
061 SAQEALVSSYDTAEGTESIDADRSKVVETLESLSIFGNPLDHIIITMPSRDRTSEFRATA 120

121 KSYEMKAAANGIRPQPKHEMLSESVQFNQLAKRIGKELSQTCAKMEKLAEYAKKKSCYEE 180
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
121 KSYEMKAAANGIRPQPKHEMLSESVQFNQLAKRIGKELSQTCAKMEKLAEYAKKKSCYEE 180

181 RSQIDHLSSIVKSDITGLNKQIGQLQEFSKRRAGNMKNQNSGHIQLVVVGLQSKLANVGK 240
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
181 RSQIDHLSSIVKSDITGLNKQIGQLQEFSKRRAGNMKNQNSGHIQLVVVGLQSKLANVGK 240

241 DYQSVLEISTETMKAEKNRRDKFSSGAAVPMGLPSSSSGANVRSKLLQDDEQHGSSSIAL 300
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
241 DYQSVLEISTETMKAEKNRRDKFSSGAAVPMGLPSSSSGANVRSKLLQDDEQHGSSSIAL 300

301 DMGALSNMQSQQTMQQRDSSLEYAQARSNTMATIEGSISELGQIFSQLASLVSEQGEMIT 360
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
301 DMGALSNMQSQQTMQQRDSSLEYAQARSNTMATIEGSISELGQIFSQLASLVSEQGEMIT 360

361 RIDSNVEDTALNIDMAHSELVRYLQNISKNRWLMIQVFGVLMVFFVVFVLFLT 413
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
361 RIDSNVEDTALNIDMAHSELVRYLQNISKNRWLMIQVFGVLMVFFVVFVLFLT 413