Affine Alignment
 
Alignment between pat-2 (top F54F2.1 1226aa) and pat-2 (bottom F54F2.1 1226aa) score 124203

0001 MREGSFPRRIGLLLGLLGLLAGVATFNIDTKNVVVHHMAGNYFGYSLDFYHEQKGMPVLV 0060
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0001 MREGSFPRRIGLLLGLLGLLAGVATFNIDTKNVVVHHMAGNYFGYSLDFYHEQKGMPVLV 0060

0061 VGAPEAESNNPNLAGIRRPGAVYACSVNRATCREVHVDKMKGNLKKLNGSHLVPIEEKSH 0120
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0061 VGAPEAESNNPNLAGIRRPGAVYACSVNRATCREVHVDKMKGNLKKLNGSHLVPIEEKSH 0120

0121 QFFGATVRSNDKHDKIVVCAPKYTYFYSKFEVIEPVGTCFYAENGFDNAEEFSSCKQEPA 0180
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0121 QFFGATVRSNDKHDKIVVCAPKYTYFYSKFEVIEPVGTCFYAENGFDNAEEFSSCKQEPA 0180

0181 RHGRHRLGYGQCGFSAAVPGKKNQNRVFIGAPGVWYWQGAMFSQNIKNQTDRPNTEYGSK 0240
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0181 RHGRHRLGYGQCGFSAAVPGKKNQNRVFIGAPGVWYWQGAMFSQNIKNQTDRPNTEYGSK 0240

0241 EYDHDMMGYSTATGDFDGDGIDDIVAGVPRGNDLHGKLVLYTSKLKMMINLTDEVSTQHG 0300
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0241 EYDHDMMGYSTATGDFDGDGIDDIVAGVPRGNDLHGKLVLYTSKLKMMINLTDEVSTQHG 0300

0301 QYCGGSVAVADVNKDGRDDIIMGCPFYTDYGSVKDAKTQERKPQYDVGKVIVMLQTAPGV 0360
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0301 QYCGGSVAVADVNKDGRDDIIMGCPFYTDYGSVKDAKTQERKPQYDVGKVIVMLQTAPGV 0360

0361 FGKQIAVVGDDQWGRFGHAVAAAGDLNLDGYNDVIVGAPYAGKNKQGAVYVIHGSKDGVR 0420
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0361 FGKQIAVVGDDQWGRFGHAVAAAGDLNLDGYNDVIVGAPYAGKNKQGAVYVIHGSKDGVR 0420

0421 ELPTQKIEGANIGHGNIKSFGFSLTGNEDVDGNGMPDIAVGAWKSGNAAVLLTKPVVTVT 0480
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0421 ELPTQKIEGANIGHGNIKSFGFSLTGNEDVDGNGMPDIAVGAWKSGNAAVLLTKPVVTVT 0480

0481 GQTEPESALISVEDKNCDVDGKLGKQACKHINTCFKYEGKGDTPNDLEFDLRFNLDDHSP 0540
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0481 GQTEPESALISVEDKNCDVDGKLGKQACKHINTCFKYEGKGDTPNDLEFDLRFNLDDHSP 0540

0541 EPRAYFLQKDVKSDRSIKVAQGSKTRDHPSSIEQRVRLEKGRQKCFRHRFFASSTMKDKL 0600
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0541 EPRAYFLQKDVKSDRSIKVAQGSKTRDHPSSIEQRVRLEKGRQKCFRHRFFASSTMKDKL 0600

0601 SPIHWSVNYTYVESKTGKLRGDKLEPAIDTTVPLSFQNKINIANNCGKDDLCVPDLKVTA 0660
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0601 SPIHWSVNYTYVESKTGKLRGDKLEPAIDTTVPLSFQNKINIANNCGKDDLCVPDLKVTA 0660

0661 VADREKFLLGTQDNTMLINVTVQNGGEDSYETKLYFDVPQGFEYGGIESVGGDGSKSAPA 0720
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0661 VADREKFLLGTQDNTMLINVTVQNGGEDSYETKLYFDVPQGFEYGGIESVGGDGSKSAPA 0720

0721 CSPTSDEPDSDGKWTFACDLGNPLPANKVVSSVVRVTASSDKPPLAPISINAHVNSSNDE 0780
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0721 CSPTSDEPDSDGKWTFACDLGNPLPANKVVSSVVRVTASSDKPPLAPISINAHVNSSNDE 0780

0781 EAHTVADNKVTFTIPVDFKNQLSLNGRSNPEQVDFSMTNKTRVDAFDDNEIGPVVSHLYQ 0840
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0781 EAHTVADNKVTFTIPVDFKNQLSLNGRSNPEQVDFSMTNKTRVDAFDDNEIGPVVSHLYQ 0840

0841 ISNRGPSEVDSATLDIFWPSFSTEGGHLLYIITEPVVNPPNKGRCRVKQLQNVNPLNLRI 0900
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0841 ISNRGPSEVDSATLDIFWPSFSTEGGHLLYIITEPVVNPPNKGRCRVKQLQNVNPLNLRI 0900

0901 TNEHVPTEPPVAKTPNEYSREEDDESYEDETTTQSQSTRHQSTQHQTHHQSGPVHVYEKD 0960
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0901 TNEHVPTEPPVAKTPNEYSREEDDESYEDETTTQSQSTRHQSTQHQTHHQSGPVHVYEKD 0960

0961 EEKIRQNTGNWQYVEDKKKKGDYEYIPDDQEYDGDDFEEEDDEDFDRAGSKRVKRNPTPK 1020
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0961 EEKIRQNTGNWQYVEDKKKKGDYEYIPDDQEYDGDDFEEEDDEDFDRAGSKRVKRNPTPK 1020

1021 KKKKGGEHRGEPRSDKARFSDLREAVKLSKEAGGVVDYKGPLSRASVDCNSLRCTHIECD 1080
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1021 KKKKGGEHRGEPRSDKARFSDLREAVKLSKEAGGVVDYKGPLSRASVDCNSLRCTHIECD 1080

1081 IYDLKEDEFVLVEIFSRLYTNTLVDEKNPGGDISSLALARVTSTKYNLPHKPTLITAVST 1140
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1081 IYDLKEDEFVLVEIFSRLYTNTLVDEKNPGGDISSLALARVTSTKYNLPHKPTLITAVST 1140

1141 NMNAIASEEGRDLPWWLYLLAILIGLAILILLILLLWRCGFFKRNRPPTEHAELRADRQP 1200
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1141 NMNAIASEEGRDLPWWLYLLAILIGLAILILLILLLWRCGFFKRNRPPTEHAELRADRQP 1200

1201 NAQYADSQSRYTSQDQYNQGRHGQML 1226
     ||||||||||||||||||||||||||
1201 NAQYADSQSRYTSQDQYNQGRHGQML 1226