Affine Alignment
 
Alignment between nud-1 (top F53A2.4 320aa) and nud-1 (bottom F53A2.4 320aa) score 31008

001 MSQYERFDSVLLSMAQQLSGGVPEMLDVLFEFLSRKTDFYSGAGVDQARTLLLEKFDKHG 060
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
001 MSQYERFDSVLLSMAQQLSGGVPEMLDVLFEFLSRKTDFYSGAGVDQARTLLLEKFDKHG 060

061 GKAMKEAEEAKKRKEEQERKLAERRAAQKAKEEEEFRNAKVVEVTDEEAAAFEKEQAKNS 120
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
061 GKAMKEAEEAKKRKEEQERKLAERRAAQKAKEEEEFRNAKVVEVTDEEAAAFEKEQAKNS 120

121 VENLEKFVDNEGETSKDAEVEDEDSKLMKPNSGNGADLAKYQWTQTLQELEVKIPIAAGF 180
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
121 VENLEKFVDNEGETSKDAEVEDEDSKLMKPNSGNGADLAKYQWTQTLQELEVKIPIAAGF 180

181 AIKSRDVVVKIEKTSVSVGLKNQAPIVDGKLPHAIKVENCNWVIENGKAIVLTLEKINDM 240
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
181 AIKSRDVVVKIEKTSVSVGLKNQAPIVDGKLPHAIKVENCNWVIENGKAIVLTLEKINDM 240

241 EWWNRFLDSDPPINTKEVKPENSKLSDLDGETRAMVEKMMYDQRQKEMGLPTSDEKKKHD 300
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
241 EWWNRFLDSDPPINTKEVKPENSKLSDLDGETRAMVEKMMYDQRQKEMGLPTSDEKKKHD 300

301 MLQQFMKQHPEMDFSNAKIG 320
    ||||||||||||||||||||
301 MLQQFMKQHPEMDFSNAKIG 320