Affine Alignment
 
Alignment between pqn-40 (top F52D1.3 774aa) and pqn-40 (bottom F52D1.3 774aa) score 76798

001 MRWEKFASFIFLLISGTDAQFGEIASLATSLLGGALGNGAGLGALAGAGAAGAGAAGQAG 060
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
001 MRWEKFASFIFLLISGTDAQFGEIASLATSLLGGALGNGAGLGALAGAGAAGAGAAGQAG 060

061 GAIAQIGQLYQLAQGALQLTGTGVGVLNQASEGNWFPAVLEQTAKNSQALMKQGGGGGLN 120
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
061 GAIAQIGQLYQLAQGALQLTGTGVGVLNQASEGNWFPAVLEQTAKNSQALMKQGGGGGLN 120

121 LGALGPAPGKTSGGLGPEFGTSFPAPNIDDYDENAEIPGVTEKKTPKAPDGLVDIEEEDY 180
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
121 LGALGPAPGKTSGGLGPEFGTSFPAPNIDDYDENAEIPGVTEKKTPKAPDGLVDIEEEDY 180

181 EVDTTTPTTSTTTTESTTTTTTPDEYEEEATTEPTSPPPRQIRIQLPDKNGKTQPEEELD 240
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
181 EVDTTTPTTSTTTTESTTTTTTPDEYEEEATTEPTSPPPRQIRIQLPDKNGKTQPEEELD 240

241 YEDLINKKTEIGQQVIPTIDAESTDELKRNVIATHGTKTQPIVPKLDKLVEVLKKSKLSK 300
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
241 YEDLINKKTEIGQQVIPTIDAESTDELKRNVIATHGTKTQPIVPKLDKLVEVLKKSKLSK 300

301 EEIDEIVAQVEGNKNIEKPAKYDFNAAVQNIPDKRNNIRQKITDASRIISTNFENQRKEQ 360
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
301 EEIDEIVAQVEGNKNIEKPAKYDFNAAVQNIPDKRNNIRQKITDASRIISTNFENQRKEQ 360

361 SIVVQQQVDELKVLPDLTDSSIQARSVSVVAPTAPTHPQVAPQVAPQVALQTAQQVAPQV 420
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
361 SIVVQQQVDELKVLPDLTDSSIQARSVSVVAPTAPTHPQVAPQVAPQVALQTAQQVAPQV 420

421 QQPQQPYNNFWNHQNHFQQPFHQQQQQFYYTQAPFYGQQTQNYWGQQNNQYNQQYGLPPY 480
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
421 QQPQQPYNNFWNHQNHFQQPFHQQQQQFYYTQAPFYGQQTQNYWGQQNNQYNQQYGLPPY 480

481 HQPQQTQQPQGYQQQQYGYSTPFPVQQPQPQQPQQQQFYNQQQYNAQTPQQVQQVHQQTP 540
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
481 HQPQQTQQPQGYQQQQYGYSTPFPVQQPQPQQPQQQQFYNQQQYNAQTPQQVQQVHQQTP 540

541 QQQVQQPHQPNQQPHIPSQQLPRQQAPQPAQNRPSAAQQVVFQQGSVQATTAPQRPANGN 600
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
541 QQQVQQPHQPNQQPHIPSQQLPRQQAPQPAQNRPSAAQQVVFQQGSVQATTAPQRPANGN 600

601 TNQVVHYYQDGKQVVQQIIPRRIAANGNLPLNGPFNSQSVGPTDPAEYQRRQRALHQAYS 660
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
601 TNQVVHYYQDGKQVVQQIIPRRIAANGNLPLNGPFNSQSVGPTDPAEYQRRQRALHQAYS 660

661 QPQTRGTVATRSVATGAQRQRNAQPAARVQPRIYESTVTATGHHQAHAIRTYQATKSASV 720
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
661 QPQTRGTVATRSVATGAQRQRNAQPAARVQPRIYESTVTATGHHQAHAIRTYQATKSASV 720

721 TPPNPQPSAATRSSGRVSSSKKRYSGHVLPGPTIDHRSLIEKRTTAKPRYVRVP 774
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
721 TPPNPQPSAATRSSGRVSSSKKRYSGHVLPGPTIDHRSLIEKRTTAKPRYVRVP 774