Affine Alignment
 
Alignment between F35A5.1 (top F35A5.1 1987aa) and F35A5.1 (bottom F35A5.1 1987aa) score 206530

0001 MSRAPPTPIKNPAKKWKPPWESVDEEEEMEVDEETPAPSKLEKKPSLKRKDAPTKPVPSP 0060
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0001 MSRAPPTPIKNPAKKWKPPWESVDEEEEMEVDEETPAPSKLEKKPSLKRKDAPTKPVPSP 0060

0061 GAPSPVPIKNPVKKWKAPWEDDEPMEEAPAAPVPAKKVRDPSPKKVPAKPRDASPKKIMA 0120
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0061 GAPSPVPIKNPVKKWKAPWEDDEPMEEAPAAPVPAKKVRDPSPKKVPAKPRDASPKKIMA 0120

0121 AKKEPETLPAVPPTPVKNPVKKFKAPWEDDEVDVEDVKDAPTVPAKKTPVLKKKEPAAAA 0180
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0121 AKKEPETLPAVPPTPVKNPVKKFKAPWEDDEVDVEDVKDAPTVPAKKTPVLKKKEPAAAA 0180

0181 KPRDPSPKKAAPSKEHDPIVPPTPIKNPAKKWKPPWEDDEVPTEEIKEPEPATRKVPALK 0240
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0181 KPRDPSPKKAAPSKEHDPIVPPTPIKNPAKKWKPPWEDDEVPTEEIKEPEPATRKVPALK 0240

0241 KKEPSTSVKPVSDPSPTKKVPVKKEPEVPPTPIKNPTKKWKPPWEDETPVEEVKEPPVPE 0300
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0241 KKEPSTSVKPVSDPSPTKKVPVKKEPEVPPTPIKNPTKKWKPPWEDETPVEEVKEPPVPE 0300

0301 KKAPVLKKKDPAPAAKARDPSPSKAAPKKVEPSSPVVPPTPVKNPVKKYKPPWEVDDEPA 0360
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0301 KKAPVLKKKDPAPAAKARDPSPSKAAPKKVEPSSPVVPPTPVKNPVKKYKPPWEVDDEPA 0360

0361 EEVKKPSAPEKKTPVLKRKEPEPSSTTPSSDPSPKKAAPAVKPRDSSPKKATPLQADPKA 0420
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0361 EEVKKPSAPEKKTPVLKRKEPEPSSTTPSSDPSPKKAAPAVKPRDSSPKKATPLQADPKA 0420

0421 QEVPPTPVKNPVKKYKPPWEVDDEDPVEEVKQPEAPAKKTPVLKRKEPAAKDTAKPATSK 0480
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0421 QEVPPTPVKNPVKKYKPPWEVDDEDPVEEVKQPEAPAKKTPVLKRKEPAAKDTAKPATSK 0480

0481 TPETPEKKDPVKPRDSSPKKVAAKPDSAQAPATPVKNPVKKWRPPWEDDETPADDVSKPT 0540
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0481 TPETPEKKDPVKPRDSSPKKVAAKPDSAQAPATPVKNPVKKWRPPWEDDETPADDVSKPT 0540

0541 DAKKTPSLAKKDPAPAKESLKPKADTKAPAKPRDPSPKKVAPTAPEKKTPVLAKKEPAGP 0600
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0541 DAKKTPSLAKKDPAPAKESLKPKADTKAPAKPRDPSPKKVAPTAPEKKTPVLAKKEPAGP 0600

0601 ADSKTKEPEKSKPRDPSPKKAVPAKPVPKTEVAPAAVKKPEPISKPKDTAPKKAEPNSPV 0660
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0601 ADSKTKEPEKSKPRDPSPKKAVPAKPVPKTEVAPAAVKKPEPISKPKDTAPKKAEPNSPV 0660

0661 VPPTPVKNPVKKWKPPWEDDDAPAKPVSLPEPEKKTPVLAKKAPTKPDSEAAADPVSGPS 0720
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0661 VPPTPVKNPVKKWKPPWEDDDAPAKPVSLPEPEKKTPVLAKKAPTKPDSEAAADPVSGPS 0720

0721 SKDPKLAKKAPVKPRDPSPMKAVPIKPAPKTEVPPAVVKKPEPVAKSRDPSPKKAKAEPN 0780
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0721 SKDPKLAKKAPVKPRDPSPMKAVPIKPAPKTEVPPAVVKKPEPVAKSRDPSPKKAKAEPN 0780

0781 SPVVPPTPVKNPVKKWKPPWEDDDAPAEPVNVPEPEKKTPVLAKKTPVKPRDPSPKKAVP 0840
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0781 SPVVPPTPVKNPVKKWKPPWEDDDAPAEPVNVPEPEKKTPVLAKKTPVKPRDPSPKKAVP 0840

0841 AKPSTKTDAPPVSVKKPEPVSKPKEPSPKKAEPNSPVVPPTPVKNPVKKWKPPWEDDDEP 0900
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0841 AKPSTKTDAPPVSVKKPEPVSKPKEPSPKKAEPNSPVVPPTPVKNPVKKWKPPWEDDDEP 0900

0901 TEEVKKPSEPEKKTPVLAKKEPEKPKDAPKVAAKPRDPSPKKAVPEKEPAKVAAKPRDLS 0960
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0901 TEEVKKPSEPEKKTPVLAKKEPEKPKDAPKVAAKPRDPSPKKAVPEKEPAKVAAKPRDLS 0960

0961 PKKAIPIPANTQEAPPTPVKNPVKKWKPPWEDDDEPAEPVSAPEPEKKTPVLAKKAPAKP 1020
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0961 PKKAIPIPANTQEAPPTPVKNPVKKWKPPWEDDDEPAEPVSAPEPEKKTPVLAKKAPAKP 1020

1021 RDPSPKKAAPVAAKPDPKIPEVPPTPVKNPVKKWKPPWEDDDEPSEPVSAPEPEKKTPVL 1080
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1021 RDPSPKKAAPVAAKPDPKIPEVPPTPVKNPVKKWKPPWEDDDEPSEPVSAPEPEKKTPVL 1080

1081 AKKAPTKPATKPDSEAAADPVKKWKPPWEDDPDEPEADFTMPAPKKPDSEDPADSLGGPK 1140
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1081 AKKAPTKPATKPDSEAAADPVKKWKPPWEDDPDEPEADFTMPAPKKPDSEDPADSLGGPK 1140

1141 PKDPKLASKAPAKKPSETPKPKEVPKELPKPAEPSKPAAPKKWRPPWEDDPDEPEEPEAD 1200
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1141 PKDPKLASKAPAKKPSETPKPKEVPKELPKPAEPSKPAAPKKWRPPWEDDPDEPEEPEAD 1200

1201 FTMPAPKKPDTEDPADSLGGPKPKDPKLAKKAPAKKPTETLKPKDAPKEPPKPADPPKPA 1260
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1201 FTMPAPKKPDTEDPADSLGGPKPKDPKLAKKAPAKKPTETLKPKDAPKEPPKPADPPKPA 1260

1261 ALKKPPWEDDPDEPEADFTMPAPKKPDTEDLADPPEPPKPAAPKKWKPPWEEDPDEPEEP 1320
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1261 ALKKPPWEDDPDEPEADFTMPAPKKPDTEDLADPPEPPKPAAPKKWKPPWEEDPDEPEEP 1320

1321 EADYTMPAPKKPDTEDPADPLGGPKPKDPKLAKKAPAKKPTDKPKSKDVPKEAPKPAEPP 1380
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1321 EADYTMPAPKKPDTEDPADPLGGPKPKDPKLAKKAPAKKPTDKPKSKDVPKEAPKPAEPP 1380

1381 KPAAPKKWKPPWEEDPDEPEEPEADFTMPAPKKPDTEDPADPLGGPKKKDPKLAKKAPSK 1440
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1381 KPAAPKKWKPPWEEDPDEPEEPEADFTMPAPKKPDTEDPADPLGGPKKKDPKLAKKAPSK 1440

1441 KPTDKPKPKDLPKEEPKPAEPPKPAAPKKWKPPWEEDPDEPEEPEADFTMPAPKKPDTED 1500
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1441 KPTDKPKPKDLPKEEPKPAEPPKPAAPKKWKPPWEEDPDEPEEPEADFTMPAPKKPDTED 1500

1501 PADPLGGPKKKDPKLAKKAPAKKPTDKPKPKDAPKDAKPTPEEPAKPVAPKKWKPPWEED 1560
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1501 PADPLGGPKKKDPKLAKKAPAKKPTDKPKPKDAPKDAKPTPEEPAKPVAPKKWKPPWEED 1560

1561 PDEPEEPEADFTMPAKKKPDTEDPADPLGGPNKKDPKLAKKAPTKKPADKPKPSEEPEKP 1620
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1561 PDEPEEPEADFTMPAKKKPDTEDPADPLGGPNKKDPKLAKKAPTKKPADKPKPSEEPEKP 1620

1621 VAPKKWKPPWEEDPDDEPEADFTVPIKPGEDEDEPEDADDEEEPEDEPAEDEPKKKKPKK 1680
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1621 VAPKKWKPPWEEDPDDEPEADFTVPIKPGEDEDEPEDADDEEEPEDEPAEDEPKKKKPKK 1680

1681 HRKRPKKKKPVVEPEKEPTPEPVVPKAPKWIAPIKKPEEPIPMPPKEKTIAERNKEERIP 1740
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1681 HRKRPKKKKPVVEPEKEPTPEPVVPKAPKWIAPIKKPEEPIPMPPKEKTIAERNKEERIP 1740

1741 PALRYAKKPRELEVYIPFVIPWEQTAALITQEGMGAFGKSRAANVEVNFGDKPIVQGAVD 1800
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1741 PALRYAKKPRELEVYIPFVIPWEQTAALITQEGMGAFGKSRAANVEVNFGDKPIVQGAVD 1800

1801 SKTVIPLWNDESKCANRSGMTAFGAPREIDQNVVDHHVFNLMDKGKSQGIIPLLAKGTTY 1860
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1801 SKTVIPLWNDESKCANRSGMTAFGAPREIDQNVVDHHVFNLMDKGKSQGIIPLLAKGTTY 1860

1861 HPHGEYGTIRRQTADVKYKDGWKPGMDSESHGFISRQFIANSKEKAGSNLLDKRRTIISD 1920
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1861 HPHGEYGTIRRQTADVKYKDGWKPGMDSESHGFISRQFIANSKEKAGSNLLDKRRTIISD 1920

1921 ALPQSKECEAMIPLMFDGRAVETREGSEFGSFRPLVTNATGGYLMSYADEMKCKNIIPFQ 1980
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1921 ALPQSKECEAMIPLMFDGRAVETREGSEFGSFRPLVTNATGGYLMSYADEMKCKNIIPFQ 1980

1981 TAPSLVR 1987
     |||||||
1981 TAPSLVR 1987