Affine Alignment
 
Alignment between rpt-2 (top F29G9.5 443aa) and rpt-2 (bottom F29G9.5 443aa) score 42940

001 MGQQQSGFGGRGNDRGAGDGEKKEKKKYEAPIPSRIGKKKKGSKGPDAASKLPAVTPHAR 060
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
001 MGQQQSGFGGRGNDRGAGDGEKKEKKKYEAPIPSRIGKKKKGSKGPDAASKLPAVTPHAR 060

061 CRLKLLKSERIKDYLLMEQEFIQNQERLKPQEERQEEERAKVDELRGTPMAVGSLEEIID 120
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
061 CRLKLLKSERIKDYLLMEQEFIQNQERLKPQEERQEEERAKVDELRGTPMAVGSLEEIID 120

121 DQHAIVSTNVGSEHYVNIMSFVDKEQLEPGCSVLLNHKNHAVIGVLSDDTDPMVSVMKLE 180
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
121 DQHAIVSTNVGSEHYVNIMSFVDKEQLEPGCSVLLNHKNHAVIGVLSDDTDPMVSVMKLE 180

181 KAPQETYADVGGLDQQIQEIKEAVELPLTHPEYYEEMGIRPPKGVILYGCPGTGKTLLAK 240
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
181 KAPQETYADVGGLDQQIQEIKEAVELPLTHPEYYEEMGIRPPKGVILYGCPGTGKTLLAK 240

241 AVANQTSATFLRIVGSELIQKYLGDGPKMVRELFRVAEENAPSIVFIDEIDAVGTKRYDS 300
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
241 AVANQTSATFLRIVGSELIQKYLGDGPKMVRELFRVAEENAPSIVFIDEIDAVGTKRYDS 300

301 NSGGEREIQRTMLELLNQLDGFDSRGDVKVLMATNRIESLDPALIRPGRIDRKIEFPLPD 360
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
301 NSGGEREIQRTMLELLNQLDGFDSRGDVKVLMATNRIESLDPALIRPGRIDRKIEFPLPD 360

361 EKTKRRIFQIHTSRMTLGKEVNLEEFITAKDELSGADIKAMCTEAGLLALRERRMRVTME 420
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
361 EKTKRRIFQIHTSRMTLGKEVNLEEFITAKDELSGADIKAMCTEAGLLALRERRMRVTME 420

421 DFQKSKENVLYRKKEGAPEELYL 443
    |||||||||||||||||||||||
421 DFQKSKENVLYRKKEGAPEELYL 443