Affine Alignment
 
Alignment between str-248 (top C55A1.3 360aa) and str-248 (bottom C55A1.3 360aa) score 35340

001 MFSNYREIFQRTCAFLGLFNNSILALLILYKSPKKLGNYKYLMMYISIFEIIYSLLDFST 060
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
001 MFSNYREIFQRTCAFLGLFNNSILALLILYKSPKKLGNYKYLMMYISIFEIIYSLLDFST 060

061 VPEIFSKDSAFLITIEKRLAVLPDIALQFALSEFPVKCRLLKFEISVVFCSLFGMSMAIF 120
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
061 VPEIFSKDSAFLITIEKRLAVLPDIALQFALSEFPVKCRLLKFEISVVFCSLFGMSMAIF 120

121 AIHFVYRYLVMTGSHFIKTRHLLKVISLIGFTLCIGVVWSFLCILFHPIPQADLILTQEY 180
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
121 AIHFVYRYLVMTGSHFIKTRHLLKVISLIGFTLCIGVVWSFLCILFHPIPQADLILTQEY 180

181 LKPRNLQLAEIDYLGPCFQVQDEKGVYHLNWDAAGPIGIMTVLIGLSFITVFYCGYSIYR 240
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
181 LKPRNLQLAEIDYLGPCFQVQDEKGVYHLNWDAAGPIGIMTVLIGLSFITVFYCGYSIYR 240

241 NIKSMAAMRSSVDHSLQSQLFYALVFQTLIPVILMHIPASLGFLFSMFGQSILFFGELPT 300
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
241 NIKSMAAMRSSVDHSLQSQLFYALVFQTLIPVILMHIPASLGFLFSMFGQSILFFGELPT 300

301 FSVFLYPILDPLPNFFIIRSYRQAILDFFGCFLRKPSPNSSNNQSNPNQMELRNHVVASN 360
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
301 FSVFLYPILDPLPNFFIIRSYRQAILDFFGCFLRKPSPNSSNNQSNPNQMELRNHVVASN 360